Identifikation und Charakterisierung homo- und heterotypischer membranständiger Interaktionsdomänen durch in vitro Selektion

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Spezifische Wechselwirkungen zwischen a-helikalen Transmembransegmenten (TMSen) bewirken bzw. unterstützen die Faltung und Oligomerisierung vieler integraler Membranbroteine. Wir streben ein detailliertes Verständnis dieser Protein/Protein-Interaktionen in biologischen Membranen an und verfolgen die Möglichkeit ihrer Vorhersage durch eine statistische Analyse von Kontaktflächen zwischen diesen Domänen. Diese lassen sich durch in vitro Selektion randomisierter Transmembransegmente aus kombinatorischen Banken (ToxR/POSSYCCAT System) identifizieren. Hier wollen wir i) den Beitrag unterschiedlicher Bindungskräfte zu diesen Interaktionen studieren indem wir ein homotypisch interagierendes membranständiges Heptadenmotiv mit allen natürlichen Aminosäuren randomisieren, ii) ein System zur Selektion heterotypischer Interaktionspartner entwickeln, iii) damit die Natur die Bindungskräfte bei heterotypischen TMS-TMS Interaktionen untersuchen und iv) die Auswirkung partieller Randomisierungen auf die TMS-TMS Interaktion bestimmen.