Evolutionary and functional genomics of Drosophila gene expression

果蝇基因表达的进化和功能基因组学

• 批准号: 5436493
• 负责人: Professor Dr. John Parsch
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Evolutionsbiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2003-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5436493?language=en
• 关键词: Evolutionary; functional; genomics; Drosophila; gene

Neuere Fortschritte in genomischen Techniken ermöglichen globale Analysen von innerartlichen, individuellen Unterschieden in der Expression von Genen. Erste, überraschende Befunde deuten an, dass in vielen Arten (darunter Hefe, Drosophila, Menschen) große Unterschiede in der Genexpression bestehen. Zum Beispiel zeigen 40% aller Gene bei D. melanogaster individuelle Expressionsunterschiede. Das Ziel dieses Projekts ist die evolutive und funktionelle Analyse von Genen, die signifikante Expressionsunterschiede zwischen Linien von D. melanogaster zeigen. Die spezifischen Teilziele sind wie folgt: (1) Populoationsgenetische Analyse von "Kandidaten-Genen" um festzustellen, ob Expressionsunterschiede mit der Segregation von Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) korreliert sind, (2) Zwischenartlicher Vergleich von Kandidaten-Genen zur Frage, ob Gene mit großen Expressionsunterschieden innerhalb von Populationen auch erhöhte Raten molekularer Evolution zeigen, und (3) Funktionelle Analyse vermuteter cis-reglulatorischer Sequenzen, um SNPs zu identifizieren, die für inter-allergische Expresssionsunterschiede verantwortlich sind.

Neuere Fortschritte in genomischen Techniken ermöglichen globale Analysen von innerartlichen，individuellen Unterscheden in der Expression von Genen.首先，在许多动物（包括黑猩猩、果蝇、人类）中，基因表达的差异最大。在D.黑腹个体表达不完全。这两个项目是对基因的进化和功能分析，是对D.黑腹菌Die specifischen Teilziele sind wie folgt：（1）Populoationsgenetische Analyse von“Kandidaten-Genen”um festzustellen，ob Expressionsunterede mit der Segregation von Single Nucleotide Polymorphisms（SNPs）korreliert sind，（2）Zwischenartlicher Vergleich von Kandidaten-Genen zur Frage，ob Gene mit großen Expressionsuntereden innerhalb von Populationen auch erhöhte Raten molekularer Evolution zeigen，（3）顺式调节基因测序功能分析，确定SNPs，以确定过敏原间的相互作用。