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Epigenetic control of age-induced circadian oscillations and its adaptive effects on fitness

年龄引起的昼夜节律振荡的表观遗传控制及其对健康的适应性影响

基本信息

批准号：
21K19277
负责人：
松本顕
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Juntendo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-07-09 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、ショウジョウバエにおいて加齢が進行してから高発現を開始し、明瞭に概日振動を示し始めるlate-life cyclerの発現機序と適応的意義のエピジェネティックなゲノム修飾の観点からの解明である。2年度目の本年はATAC-seqを用いて、クロマチン修飾が時刻および加齢によって変動するゲノム領域を網羅的に同定することをめざした。前年度の予備実験から、ATAC-seqは12匹の脳で実施可能であることが判明していた。そこで、LD12:12の光条件に同調させた1週齢の若齢オスと10週齢の老齢オスについて、明期開始から、1、7、13、20時間後のタイミングで、それぞれ12匹ずつ解剖して脳をサンプリングした。サンプリングは独立に2系列行った。合計16サンプルについて、平均1億リードの次世代シークエンスを行った。duplicationサンプル間での相関係数はきわめて高く、再現性よく実験が行われたことが示唆された。まずは、同じ週齢のサンプル群において、時刻毎にクロマチン構造が変化している領域をバイオインフォ解析で探索したが、シークエンス断片のヒット数が有意に増減した領域は数か所しか見つからず、同じ週齢内では、サンプリング時刻が異なっても、クロマチン構造にほとんど変化がない可能性が示唆された。続いて、サンプリング時刻毎に、加齢による変化が見られる領域を探索したところ、増・減ともに約2000領域が同定された。よって、加齢により、オスの脳内のクロマチン構造に明瞭な違いが生じていることが強く示唆された。

The purpose of this study is, the purpose of this study is to carry out the research, to start the research, to understand the vibration of the day, to start, and to start late-life The meaning of the cycler's current machine sequence is the meaning of the cycler. The meaning of the cycler is the meaning of the cycler. 2nd year project of this year's ATAC-seq is modified with いて and クロマチン and the time is および加颢によって変动するゲノム区を同定することをめざした. The previous year's preliminary preparation and ATAC-seq's 12 pieces of information may not be clear.そこで, LD12:12の光conditionに同声させた1week齢の如颢オスと10week齢の老颢オスについて, open tomorrow The beginning of time, 1, 7, 13, 20 hours later, のタイミングで, それぞれ12 pieces of ずつanatomy, サンプリングした.サンプリングは independent 2 series line った. A total of 16 new products, an average of 100 million next-generation products. The duplication coefficient is high, the correlation coefficient is high, and the reproducibility is high.まずは, 同廢形のサンプル群において, 时毎にクロマチンstructure が変化している区をバイオインフォANALYSISでExplorationしたが、シークエンス fragmentのヒットnumberがThere is an intention to increase or decrease the number of areas and the number of places that can be seen. The time is different, the structure of the time is different, and the possibility of the time is changing.続いて, サンプリング every moment, and 形による変化が见られるfieldしたところ、increase and decrease ともにAbout 2000 areas are determined together.よって, 加颢により, オスの脳内のクロマチンstructurally clear なviolated いが生じていることが强く说唆された.