体細胞モザイク誘導系を用いたショウジョウバエ概日振動体間相互作用の解析

使用体细胞镶嵌诱导系统分析果蝇昼夜节律振荡器相互作用

• 批准号: 12048215
• 负责人: 松本 顕
• 金额: $ 3.01万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2001
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12048215/
• 关键词: ショウジョウバエ; サーカディアン; 細胞間相互作用; 概日時計; カップリング

Gene Chip(oligonucleotide microarray)により、ショウジョウバエのゲノム上の全ての遺伝子に関して、mRNAレベルでの振動の有無を検定し、ペースメーカー間相互作用に関連する遺伝子候補を網羅的に同定することをめざした。明暗サイクル下(LD)と恒暗条件下(DD)で4時間ごとにそれぞれ2日間ショウジョウバエをサンプリングし、頭部よりRNAを精製した。GeneChipを用いて各遺伝子のRNA量を定量した後、数種類の統計的フィルターを適用することによって、mRNA量が有意に振動している遺伝子を同定した。その結果、LDでは約13,600の遺伝子のうちで712個の遺伝子が振動しており、この中でDDでも振動しているものは115個あることがわかった。この他に、LDでは明瞭な1峰性の振動を示さないが、DDでは示すものが341個あった。これらの遺伝子をKEGGやGene Onthologyといった各種データベースをもちいて機能毎に分類した。顕著な振動を示す機能グループに光受容経路に関わる遺伝子群があった。振動体間の相互作用を担っていることが推測される分子としては、GABA/Glutamateの生産経路、放出に関わる遺伝子の多くや、5-HTreceptorの2型やligand不明の3つのG protein coupled receptor、また2つのneuropeptide(PDFとFMRamide)、2つのホルモン様物質等のmRNAが振動していた。この他に、多数のレセプターや膜貫通型タンパク、ligand結合タンパク、イオンチャンネルのmRNAも概日振動していた。これらの分子のタンパクレベルでの機能を解析することで概日振動体間の相互作用の解明が期待される。

Gene Chip(oligonucleotide Microarray) に よ り, シ ョ ウ ジ ョ ウ バ エ の ゲ ノ all の ム て の posthumous son 伝 に masato し て, mRNA レ ベ ル で の vibration の presence of を 検 し, ペ ー ス メ ー カ ー interaction between に masato even す る but 伝 son alternate を snare に with fixed す る こ と を め ざ し た. Under the light and shade サ イ ク ル (LD) と (DD) で 4 time under the condition of constant dark ご と に そ れ ぞ れ 2 シ ョ ウ ジ ョ ウ バ エ を サ ン プ リ ン グ し, head よ り RNA を refined し た. GeneChip を with い て each legacy 伝 son の RNA amount を quantitative し た, several kinds の statistics after フ ィ ル タ ー を applicable す る こ と に よ っ て, mRNA が intentionally に vibration し て い る heritage 伝 son を be し た. About 13600 の そ の results, LD で は heritage 伝 son の う ち で 712 の heritage 伝 が vibrators し て お り, こ の で in DD で も vibration し て い る も の は 115 あ る こ と が わ か っ た. こ の に, LD で は clear sexual の な 1 peak vibration を shown さ な い が, DD で は shown す も の が 341 あ っ た. こ れ ら の posthumous son 伝 を KEGG や Gene Onthology と い っ た various デ ー タ ベ ー ス を も ち い て function in their classification し に た. 顕 function of the vibration を shown す な グ ル ー プ に light the road capacity 経 に masato わ る heritage 伝 subgroup が あ っ た. の interaction between vibration body を bear っ て い る こ と が speculation さ れ る molecular と し て は, GABA/Glutamate production 経 の way, release に masato わ る posthumous son 伝 の more く や, 5 - HTreceptor の type 2 や ligand unknown の 3 つ の G protein coupled <s:1> mrnas such as receptor, また2 <s:1> <s:1> neuropeptide(PDFとFMRamide), 2 <s:1> <s:1> ホ モ モ モ similar substances が vibrate <s:1> て た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た た. こ の he に, most の レ セ プ タ ー や transmembrane type タ ン パ ク, ligand binding タ ン パ ク, イ オ ン チ ャ ン ネ ル の mRNA も almost daily vibration し て い た. Molecular の こ れ ら の タ ン パ ク レ ベ ル で の function analytical す を る こ と で almost daily の interaction between vibration body の interpret が expect さ れ る.

项目成果

Ueda et al.: "Genome-wide transcriptional orchestration of circadian thythms in Drosophila"Journal of Biological Chemistry. 277(印刷中). (2002)

Ueda 等人：“果蝇昼夜节律的全基因组转录编排”，《生物化学杂志》277（出版中）。

Ishimoto,h.,Motsumoto,A.,and Tanimurn,T.: "Mokcular identifination of taste receptor gene for Trehalose in Drosophila"Science. 289. 116-119 (2000)

Ishimoto,h.、Motsumoto,A. 和 Tanimurn,T.：“果蝇海藻糖味觉受体基因的分子鉴定”科学。