耐熱性光合成反応中心における立体構造安定化機構の結晶学的研究
耐熱性光合成反応中心における立体構造安定化機構の結晶学的研究
批准号:
07280211
负责人:
三木 邦夫
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
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紅色光合成細菌Chromatium tepidumはその生育温度が50℃にも達する耐熱性種である.本研究は,この好熱性光合成細菌の反応中心複合体の立体構造を、これまでに解明されている。Rhodopseudomonas viridisやRhodobacter sphaeroidesなど常温菌の反応中心複合体の立体構造と比較することによって,膜結合性タンパク質における熱安定化の機構を理解しようとするものである.そのために,C.tepidumの反応中心複合体のX線結晶構造解析による立体構造決定に着手した.C.tepidumの反応中心複合体は界面活性剤LDAO(N,N-ジメチルドデシルアミン-N-オキシド)で可溶化し,後にこれをβ-オクチルグルコシドに置き換えて結晶化に用いた.沈殿剤にPEG4000を用いて蒸気拡散法で結晶化を行い,X線回折実験に達する大きさの結晶を得ることができた.結晶は斜方晶系,空間群P2_12_12_1に属し,格子定数はa=136Å,b=197Å,c=82Åであった.非対称単位中に1分子を含むと考えるとV_M値は4.3Å/Daとなり,膜タンパク質結晶として妥当な値をとることになる.高エネルギー物理学研究所・放射光実験施設のシンクロトロン放射光で,3Å分解能以上の回折を観測することができた.シンクロトロン放射光を用いてnative結晶の回折強度を測定したところ,3Å分解能までの17,724個の独立な反射を収集することができ,等価な反射の一致度Rmergeは0.095であった.しかし,そのデータは測定中にX線によって結晶が損傷を受け,その測定精度が十分でないことがわかった.また,最近,界面活性剤にβ-デシルマルトシドを用いることによっても良好な結晶が析出することがわかった.このような界面活性剤の種類の違いが.膜タンパク質結晶化においてその結晶性に及ぼす影響を詳細に検討し,より高分解能の回折を与え,かつX線による損傷が小さい結晶を選んで,今後の構造解析に用いるつもりである.C.tepidumの反応中心複合体は,すでに構造が明らかなRps.viridisの反応中心複合体と同様,H,M,L,チトクロムという4つのサブユニットから構成されている.現在のX線回折データを用いて,Rps.vividisの反応中心複合体の構造をモデル分子とした分子置換法を適用したところ,右図に示すような予備的な結晶内パッキングの解を得た.今後,回折データを再測定して構造解析を進める予定である.
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会议论文
放射光と中性子の連携利用による電子伝達タンパク質の精密構造解析
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批准号:20K06523
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2020
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
DnaK分子シヤペロンによるDNA複製開始タンパク質の活性化過程の解明
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批准号:17028029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
分子シャペロンによるDNA複製開始タンパク質(RepE)の活性化の分子機構:repE遺伝子の転写、翻訳、活性化過程におけるシャペロンの働きとRepE-シャペロン複合体の構造解析
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批准号:15032223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.22万
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财政年份:2003
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
高エネルギーX線によるXe,Csを用いた多波長異常分散(MAD)法
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批准号:14658216
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2002
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
耐熱性光合成細菌Chromatium Tepidum反応中心タンパク質の機能・構造解析
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批准号:98F00450
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
次世代大型放射光SPring-8での超分子タンパク質結晶学研究の確立
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批准号:10878111
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
次世代大型放射光SPring-8タンパク質結晶解析ビームラインの性能評価
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批准号:09878142
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
テトラサイクリン/プロトンアンチポ-タの結晶化とX線構造解析
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批准号:08268224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
タンパク質の立体構造に基づく超分子形成の分子機構の解明
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批准号:08219226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
テトラサイクリン/プロトンアンチポ-タの結晶化とX線構造解析
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批准号:08268224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
光回復酵素の結晶化とX線構造解析
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批准号:07255203
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
タンパク質の立体構造に基づく超分子形成の分子機構の解明
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批准号:07229228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1995
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
テトラサイクリン/プロトンアンチポ-タの結晶化とX線構造解析
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批准号:07276217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1995
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
光合成エネルギー変換反応に携わる超分子タンパク質複合体の構造と機能
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批准号:06240219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1994
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
DNA光回復酵素の結晶化とX線構造解析
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批准号:06263205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
高度好熱菌ATPaseのサブユニットの結晶化と高分解能X線構造解析
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批准号:05259206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1993
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
X線結晶解析と分子グラフィックスによる膜複合体電子伝達反応の分子機構
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批准号:04266208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1992
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
NADPH-チトクロムP-450還元酵素のX線結晶解析
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批准号:01780201
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
NADH-チトクロムb_5還元酵素のX線結晶解析
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批准号:62780193
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1987
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
疎水性膜タンパク質, 光合成細菌反応中心複合体の結晶化およびX線結晶解析
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批准号:59780066
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1984
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负责人:三木 邦夫
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依托单位:
海外基金