低酸素誘導因子を阻害する特殊ペプチドの創出

创建抑制缺氧诱导因子的特殊肽

• 批准号: 13F03026
• 负责人: 菅 裕明
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13F03026/
• 关键词: ペプチド; ケミカルバイオロジー; 翻訳; シアリダーゼ; 人口触媒; 糖転移; ペルチド; 人工触媒

Jongkees 博士は、まず 3,5-dihydrophenylalanine をフレキシザイム(菅研が開発した人工RNA 酵素)で tRNA の 3’末端にチャージし、さらに FIT システムによって効率よくペプチド鎖に取 り込まれることを確認した。その上で、開始 tRNA に N-chloroacetyl-L-Tyrosine(N-ClAc-L-Tyr) をフレキシザイムでチャージして翻訳を開始することで、下流のシスティン残基側鎖と反応しチ オエーテル結合で架橋された大環状ペプチドライブラリーを構築に成功した。また、Jongkees 博士は T. cruzi 由来の His タグ化された trans-sialidase に対して大環 状特殊ペプチドのリガンド探索を進めた。このタンパク質は市販されていないが、Jongkees 博士 の Ph.D.スーパーバイザーであり且つ共同研究者である Steve Withers 教授(ブリティッシュコ ロンビア大)から提供を受けた。この標的を磁気ビーズに固定化する条件を最適化後、2種類の ライブラリーを用いてセレクションを進めた。ひとつは、通常の大環状特殊ペプチドライブラリ ーで、確実なリガンドを獲得することを目的とした。もうひとつは、Pancreatic α-amylase で 試みた上記の 3,5-dihydrophenylalanine 含有大環状ペプチドライブラリーを用いて、セレクショ ンを試みた。前者は、非常に良好なセレクションのプロファイルが得られ、ペプチドリガンドの 獲得に成功した。この特殊ペプチド数種類を共同研究者に送付し、その阻害活性の評価を行った 結果、阻害活性をもつ特殊ペプチドがみつかり、現在その詳細な機能解析と結晶線解析をおこな っている。一方、後者のライブラリーでは、標的に対する特異的な特殊ペプチド群の濃縮がなか なか高くならず、現状では満足いく結果になっていない。現在、条件の再検討を行い、再度活性 種の濃縮に挑んでいるところである。

Dr. Jongkees confirmed that 3,5-dihydrophenylalanine was detected at the 3 'end of tRNA, and that FIT was detected at the 3' end of RNA. In the upper part, the initial tRNA N-chloroacetyl-L-tyrosine(N-ClAc-L-Tyr) was successfully constructed. Dr. Jongkees T. cruzi origin of His trans-sialidase to explore the macrocyclic special selection Dr. Jongkees, Ph.D., Ph.D., Ph.D. After optimizing the conditions of magnetic immobilization of the target, the two kinds of magnetic immobilization were improved. For example, the general purpose of a large ring is to ensure that the ring is not damaged. 3,5-dihydrophenylalanine contains a large cyclic peptide, which can be used as a reagent for the treatment of Pancreatic cancer. The former is very successful in the selection of products. This special selection number is submitted by the co-investigator, and the evaluation results of the resistance activity are presented. The resistance activity is selected from the special selection list. Now the detailed function analysis and crystallization line analysis are presented. One side, the other side, the other side Now, the condition of re-examination, re-active species concentration, selection, selection.

项目成果

ブリテッシュコロンビア大学(カナダ)

不列颠哥伦比亚大学（加拿大）

Mechanistic studies on Clostridium perfringens unsaturated glucuronyl hydrolase (UGL)

产气荚膜梭菌不饱和葡萄糖醛酸水解酶（UGL）的机理研究

• 发表时间: 2015
• 作者: Seino A K Jongkees;Hayoung Yoo;Stephen G Withers
• 通讯作者: Stephen G Withers

Model foldamers: applications and structures of stable macrocyclic peptides identified using in vitro selection

模型文件夹：使用体外选择鉴定的稳定大环肽的应用和结构

• 发表时间: 2015
• 期刊: New Journal of Chemistry
• 影响因子: 3.3
• 作者: Seino A. K. Jongkees;Christopher J. Hipolito;Joseph M. Rogers;Hiroaki Suga
• 通讯作者: Hiroaki Suga

Mechanistic Investigations of Unsaturated Glucuronyl Hydrolase from Clostridium perfringens

• DOI: 10.1074/jbc.m113.545293
• 发表时间: 2014-04-18
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Jongkees, Seino A. K.;Yoo, Hayoung;Withers, Stephen G.
• 通讯作者: Withers, Stephen G.