Core A (Administrative/Bioinformatics/Statistics)

核心区(行政核心区)核心区项目摘要。 -- 本计划的所有研究和项目都将依赖于行政、生物信息学和生物信息学的有效使用。 统计数据支持，这些支持将不会由核心数据中心负责指导。数据核心数据中心的数据管理组件数据将不会提供。 集中的科学管理、行政管理和财务管理，以及计算机硬件、软件和软件。 网络支持和服务(包括数据共享、数据存储、数据和数据维护)。 核心项目的A组成员将负责对1-4个项目所取得的最新研究和进展进行全面监测。 作为四大核心项目中每一个项目的最高效率的使用方案，核心方案A也将负责提供一般的技术支持。 这些领域的成本通常用于管理1-4个项目和A-B核心。核心A的生物信息学研究和全球统计数据的组成部分。 我们将把从1-4个项目中生成的数据以及跨整个数据连续体的公开可用的数据整合在一起。 检测的范围从蛋白质组学(通过芯片-Seq)、转录组学(通过RNA-Seq/微阵列)、蛋白质组学(RPPA)。 以及(DNA-IP)、基因和代谢组学研究(通过大规模数据分析平台)。这些数据和获取数据将不会发生在已建立的核心技术中。 目前，贝勒医学院分子生物学和细胞生物学系的设施已经到位。 核心数据中心的生物信息学和生物统计部门将继续执行主要数据和分析，并提取有意义的数据。 来自每一系列基因组学分析的特征，以及在1-4个项目中提出的建议。这是世界银行的主要贡献。 生物信息学和生物统计学是核心技术的组成部分，由多项综合数据分析组成，其中数据来自多个数据库。 组学和平台被整合在一起，引领着人们建立全面的生物学和洞察力，以及可验证的假设。 将使用来自Encode的数据，包括美国国立卫生研究院表观基因组路线图，以及国际人类基因组和表观基因组联合会(IHEC)， 以及其他科学数据和资料库，如美国国立卫生研究院基因表达、综合基因(GEO)和核糖核酸受体。 Signating And Atlas An(Nursa)。对于其他科学和技术出版物，Acore将不会对这些数据和结果进行可视化处理。 通过同时使用离线测试和在线测试软件开发工具。为了更好地满足数据和传播指导方针，核心测试将继续表现。 数据和证词需要提供适当的数据库，包括但不限于NIDDK赞助的NIDDK和Nursa。 总体而言，这些努力将为我们提供必要的基础设施，以进一步支持我们的各种研究机构和核心机构。 本项目申请的组成部分-。 无与伦比的科学和技术对于完成我们的综合科学研究的总体科学和技术目标至关重要。 团队。

Core A (Administrative Core) -­ Project Summary    All  research  projects  of  this  Program  Project  (PP)  will  rely  on  the  use  of  administrative,  bioinformatics  and  statistical  support,  which  will  be  directed  by  Core  A.  The  Administrative  Component  of  Core  A  will  provide  centralized  scientific,  administrative  and  financial  management  as  well  as  computer  hardware,  software  and  network  support  services  (which  includes  data  sharing,  storage,  and  maintenance).  The  Administrative  Component of Core A will be responsible for monitoring the research progress attained by Projects 1-­4 as well  as the efficient use of Core B by each of the four projects. Core A also will be responsible for general support  of cost areas common to Projects 1-­4 and Cores A-­B. The Bioinformatics and Statistics Component of Core A  will  integrate  both  data  generated  from  Projects  1-­4  as  well  as  publicly  available  data  across  a  continuum  of  assays  ranging  from  cistromics  (via  ChIP-­Seq),  transcriptomics  (via  RNA-­Seq/microarray),  proteomics  (RPPA  and  DNA-­IP),  and  metabolomics  (via  mass  spec  platforms).  Data  acquisition  will  occur  in  established  core  facilities currently in place within the Department of Molecular and Cellular Biology at Baylor College of Medicine.  The Bioinformatics and Statistics Component of Core A will perform primary data analysis, extracting significant  features  from  each  series  of  OMICs  assays  proposed  in  Projects  1-­4.  The  major  contribution  of  the  Bioinformatics and Statistics Component of Core A consists of integrative analysis, wherein data from multiple  OMICs platforms are combined, leading to comprehensive biological insight and testable hypotheses. Core A  will use data from Encode, the NIH Epigenomic Roadmap, International Human Epigenome Consortium (IHEC),  and  scientific  data  repositories  such  as  the  NIH  Gene  Expression  Omnibus  (GEO)  and  Nuclear  Receptor  Signaling Atlas (NURSA). For scientific publications, Core A will generate visualizations of these data and results  by employing both off-­line and online software tools. To meet data dissemination guidelines, Core A will perform  data  deposition  to  the  appropriate  repositories,  including  but  not  limited  to  the  NIDDK  sponsored  NURSA.  Collectively,  these  efforts  will  provide  the  necessary  infrastructure  to  support  the  various  research  and  core  components  of  this  Program  Project  application.  The  successful  operation  of  this  administrative  team  is  unparalleled  and  is  essential  to  completion  of  the  overarching  scientific  objectives  of  our  integrative  research  teams.