Bactériocines versus antibiotiques: Compréhension des mécanismes d'action antimicrobien, phénomène de résistance et résistance croisée

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Les bactériocines sont des peptides naturellement produits par plusieurs souches bactériennes et sont dotées d'une activité antimicrobienne dirigée contre des bactéries phytogénétiquement proches de la souche productrice. L'activité inhibitrice des bactériocines a été largement démontrée dans plusieurs modèles alimentaires tels que les produits laitiers, carnés, marins et végétaux. Récemment, les bactériocines ont été évoquées comme une des alternatives des plus prometteuses aux antibiotiques pour promouvoir la croissance ou pour la lutte contre les germes multirésistants en production animale. Cependant et malgré l'abondante littérature concernant les bactériocines, les données scientifiques relatives à l'innocuité de ces molécules pour l'humain et l'animal demeurent très rares. En outre, le développement de variants résistants aux bactériocines et les phénomènes de résistance croisée ou de co-résistance entre les bactériocines ou entre les bactériocines et les antibiotiques demeurent un champ de recherche très peu étudié. Dans le cadre de cette programmation quinquennale de recherche nous adopterons une approche pluridisciplinaire combinant la microbiologie la génomique et la protéomique fonctionnelle pour l'étude et la compréhension des liens entre les mécanismes d'action des bactériocines et le développement de résistance. Nous nous intéresserons également aux phénomènes de co-résistance et de résistance croisée entre les différentes classes de bactériocines et entre les bactériocines et les antibiotiques. Nous aborderons alors les objectifs spécifiques suivants: 1. Produire, purifier et caractériser différentes classes de bactériocines; 2. étudier et comparer les activités inhibitrices des différentes classes de bactériocines et d'antibiotiques contre des microorganismes pathogènes d'intérêt alimentaire médical et vétérinaire; 3. Comprendre l'impact des stress gastro-intestinaux sur les profils de résistance aux bactériocines et aux antibiotiques de ces microorganismes; 4. étudier sur les plan phénotypique et génotypique les phénomènes de résistants; 5. élucider et caractériser es phénomènes de résistance, de co-résistance et de résistance croisée entre les différentes classes de bactériocines et entre les bactériocines et les antibiotiques. Cette nouvelle programmation permettra de répondre à l'une des questions de recherche les plus persistantes à savoir l'innocuité des bactériocines pour l'humain et l'animal. Les données scientifiques nouvelles qui seront générées sur le phénomène de résistance croisée et de co-résistance entre les bactériocines ou entre les bactériocines et les antibiotiques sont essentielles pour assurer une utilisation efficace, ciblée et sans risque pour l'utilisateur.