鱼类消化道微生物群落结构与宿主的关系
批准号:
31172084
项目类别:
面上项目
资助金额:
62.0 万元
负责人:
余育和
依托单位:
学科分类:
动物生理与行为
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
颜庆云、李学梅、张翔、倪加加、代梨梨、马惠丽、李金金、胡红娟
中文摘要
消化道微生物与宿主相互选择并表现出共进化的特点,所以不同动物消化道微生物具有极大的多样性。然而微生物与宿主的共进化关系研究主要集中在哺乳动物尤其是人类消化道方面,而鱼类这一很好的研究材料却没有引起研究者的重视。本项目拟选择隶属于鲤科的不同亚科、且食性和生活习性存在较大差异的青、草、鲢、鳙、鲤、鲫、鳊等为研究对象,通过PCR-DGGE、克隆文库的构建、FISH等分子生物学技术,并结合传统的培养方法对各种鱼不同发育阶段消化道微生物群落结构进行研究,揭示不同鱼类消化道中关键菌群并探讨其功能。在对比分析不同发育阶段和不同环境背景下宿主与微生物相互选择规律的基础上揭示鱼类消化道微生物群落与宿主的关系。进而希望可以通过在饵料或环境中适当添加对特定鱼类有益的关键功能菌来调节其消化道微生物群落结构,以利于鱼类的消化吸收和健康生长,为提高养殖效益提供科学依据和实践指导。
英文摘要
消化道微生物与宿主相互选择并共同进化,一方面宿主的种类、发育、食性等均能影响消化道微生物的组成;另一方面消化道微生物对宿主代谢、免疫、疾病等具有重要的调节作用。本课题各项研究内容紧紧围绕鱼类消化道微生物与宿主关系以及微生物对宿主代谢的调节作用展开。具体以我国重要的水产养殖品种、且食性或者生活习性不同的草、鲢、鳙、鲤、鲫、鳊、鳜、黄颡鱼等为研究对象。通过PCR-DGGE、克隆测序、高通量测序等分子生物学技术对不同发育阶段(仔鱼-成鱼)个体消化道微生物群落结构进行了系统的比较研究,并结合宿主的生理生化特征探讨了消化道微生物在宿主物质代谢中的功能。研究结果表明,宿主种类是影响鱼类消化道微生物群落组成的重要因子,而且宿主基因型与肠道微生物显著相关。消化道内优势菌属随宿主食性不同而存在明显差异,其中草食性、杂食性和滤食性鱼类得肠道优势菌属与肉食性鱼类之间差异显著,消化道内选择性形成的微生物群落对宿主营养物质代谢具有重要的调节作用。相关研究成果能为科学养殖和提高养殖效益提供基础依据。已发表标注该课题资助论文7篇,其中SCI论文6篇,培养博士研究生4名。
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Gut microbiota contributes to the growth of fast-growing transgenic common carp (Cyprinus carpio L.).
肠道微生物群有助于快速生长的转基因鲤鱼(Cyprinus carpio L.)的生长
DOI:
10.1371/journal.pone.0064577
发表时间:
2013
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Li X, Yan Q, Xie S, Hu W, Yu Y, Hu Z]
通讯作者:
Hu Z
How much metagenomic sequencing is enough to achieve a given goal?
多少宏基因组测序足以实现既定目标?
DOI:
10.1038/srep01968
发表时间:
2013
期刊:
SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:
4.6
作者:
[Ni, Jiajia, Yan, Qingyun, Yu, Yuhe]
通讯作者:
Yu, Yuhe
Comparative study on gastrointestinal microbiota of eight fish species with different feeding habits
8种不同食性鱼类胃肠道微生物群比较研究
DOI:
10.1111/jam.12663
发表时间:
2014-12-01
期刊:
JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY
影响因子:
4
作者:
[Li, J., Ni, J., Yan, Q.]
通讯作者:
Yan, Q.
Factors influencing the grass carp gut microbiome and its effect on metabolism
草鱼肠道微生物群的影响因素及其对代谢的影响
DOI:
10.1111/1574-6941.12256
发表时间:
2014-03-01
期刊:
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY
影响因子:
4.2
作者:
[Ni, Jiajia, Yan, Qingyun, Zhang, Tanglin]
通讯作者:
Zhang, Tanglin
Taxonomic resolutions based on 18S rRNA genes: a case study of subclass copepoda.
基于 18S rRNA 基因的分类学分辨率:桡足亚纲的案例研究。
DOI:
10.1371/journal.pone.0131498
发表时间:
2015
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Wu S, Xiong J, Yu Y]
通讯作者:
Yu Y
共 7 条
不同类型淡水水体原生动物生物多样性比较研究
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批准号:31772433
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项目类别:面上项目
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资助金额:63.0万元
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批准年份:2017
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负责人:余育和
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依托单位:
武汉东湖原生动物群落对“六湖连通”的生态响应
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批准号:31572247
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2015
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负责人:余育和
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依托单位:
草食性鱼类消化道微生物在纤维素分解与转化中的作用
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批准号:31372202
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项目类别:面上项目
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资助金额:83.0万元
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批准年份:2013
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负责人:余育和
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依托单位:
草鱼消化道微生物及其与食物组成的关系
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批准号:30970358
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项目类别:面上项目
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资助金额:33.0万元
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批准年份:2009
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负责人:余育和
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依托单位:
浮游生物群落宏基因组与其环境理化因子的关系
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批准号:30770298
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项目类别:面上项目
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资助金额:40.0万元
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批准年份:2007
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负责人:余育和
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依托单位:
浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与物种多样性
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批准号:30570240
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项目类别:面上项目
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资助金额:28.0万元
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批准年份:2005
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负责人:余育和
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依托单位:
车轮虫分子系统发育
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批准号:30270164
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项目类别:面上项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2002
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负责人:余育和
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依托单位:
原生动物同工酶作为湖泊富营养化指标的研究
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批准号:39670156
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项目类别:面上项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:1996
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负责人:余育和
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依托单位:
国内基金
海外基金