Division of cellular function of nuclear transport pathways

核转运途径的细胞功能划分

• 批准号: 21H02482
• 负责人: 今本 尚子
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02482/
• 关键词: 核-細胞質間輸送; Importin beta; Importin alpha; 細胞機能制御; 基質特異的認識; 細胞機能; Importin β; Importin α; evolutionary trace; 定量的プロテオミクス

私たちは、特定の輸送経路で核内へ輸送される基質タンパク質を同定する技術を使って、12のImportinβファミリー核内輸送運搬体の大規模基質同定を行い、Importinファミリーが構成するヒト細胞の核内輸送経路全てを網羅した。この解析で、一つの運搬体分子が、従来考えられていたような共通配列を持たない多くの輸送基質を運ぶことを改めて証明することができた。その理由を理解することは輸送分野に残された根源的な問題の一つである。そこで、Transportin-SR（TrnSR）とImportin-13 (Imp13)の２つの運搬体分子を例にとって、一つの運搬体が共通配列を持たない基質を特異的に認識する仕組みの解析を進めた。この２つの運搬体は、一次構造上の相同性が高いにもかかわらず、我々の解析では少数の共通基質しか持たないことがわかっていたからである。先ず最初に、それぞれの運搬体が結合する基質との共結晶構造（報告済み）から得られた基質結合アミノ酸と、進化トレース法で高いKL-valueを持つアミノ酸をピックアップすることで、それぞれの運搬体が基質と結合するであろうと考えられるアミノ酸をピックアップした（TrnSRは5アミノ酸、Imp13は10アミノ酸）。それぞれのアミノ酸に変異を加えて、我々が同定した基質候補と総当たりで、Beads Halo法を利用したハイスループット結合解析を行った。代表的なものは、表面プラズモン共鳴（SPR）で結合を定量した。また、結合に関与する運搬体上のアミノ酸残基の違いによって基質タンパク質をグループ分けして、構造情報を解析した。その結果、運搬体-基質の結合様式には、従来考えられていたような基質上の共通配列と運搬体分子上の特定部位の定型的な結合を遥かに超えた多様性があり、運搬体と基質の特異性決定は予想以上に複雑であることがわかった。

Private and specific delivery systems in the core are the same as those in the technology, 12-year-old Importin β-transport, large-scale transport in the same network, and Importin delivery in the core. There is a common arrangement for the analysis, the analysis of the carrier, and the common arrangement of the carrier, the carrier, and the carrier. The reason for this is to understand that there is a problem at the root of the problem that you have to send to the field. For example, Transportin-SR (TrnSR), Importin-13 (Imp13), and so on, there is a common configuration for people to carry objects that are based on basic knowledge and characteristics. We need to move the body, make the same thing at a time, and we will analyze the number of common data. In the first part of this paper, the combination of the primary and secondary materials and the combination of the basic materials and the common results (reporting results) were used to obtain the results of the combination of the basic materials and the results of the combination of the two methods. The results show that the combination of the basic and the basic methods of moving the bodies in the first step, the first part, the second part, the first part, the second part, the first step, the second part, the second chapter, the first step, the Imp13 (10% acid). In this paper, we have the same information as the basic information, and the Beads Halo method is used to analyze the data in this paper. On behalf of the general information, the surface information sharing (SPR) combined with the quantitative analysis. In the process of moving the body, the acid residue and the acid residue on the body should be analyzed. The results of the results, the combination of the body-to-base formula, and the common configuration of the specific parts of the moving molecules on the basis of the results, the results of the results, the combination of the results, the combination of the combination results, the combination of the combination of the body-to-body combination, and the combination of the specific parts of the moving molecules on the basis of the data.

项目成果

National Cheng Kung University(タイ)

国立成功大学（泰国）

Stochastic chromatin packing of 3D mitotic chromosomes revealed by coherent X-rays

• DOI: 10.1073/pnas.2109921118
• 发表时间: 2021-11
• 期刊: Proceedings of the National Academy of Sciences
• 作者: Daeho Sung;Chan Lim;M. Takagi;C. Jung;Heemin Lee;D. Cho;Jaeyong Shin;Kangwoo Ahn;Junha Hwang;D. Nam;Y. Kohmura;Tetsuya Ishikawa;D. Noh;N. Imamoto;Jae-Hyung Jeon;Changyong Song

Nuclear Fractionation

核分馏

• 发表时间: 2021

Methods to separate nuclear soluble fractions reflecting localizations in living cells

• DOI: 10.1016/j.isci.2021.103503
• 发表时间: 2021-12-17
• 期刊: ISCIENCE
• 影响因子: 5.8
• 作者: Ogawa，Yutaka;Imamoto，Naoko
• 通讯作者: Imamoto，Naoko

生細胞の局在を反映した核・細胞質可溶性画分の分画法

反映活细胞定位的核和细胞质可溶性组分的分级方法

• 发表时间: 2022
• 作者: 小川泰;今本尚子
• 通讯作者: 今本尚子