HIV-1産生の不均一性を規定する原理の解明

阐明调节 HIV-1 产生异质性的原理

• 批准号: 21H02737
• 负责人: 小柳 義夫
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02737/
• 关键词: ヒト化マウス; HIV; １細胞RNAシークエンス; バイオインフォマティクス; インテグレーション; CD4+ T細胞

ヒト化マウス内のHIV-1感染細胞に発現するマーカーを見出すために、１細胞RNAシークエンスデータを再度解析した。亜集団（クラスター）1、2、3、4、8の発現遺伝子として、クラスター1 にはTh1細胞（高IFNG、高GZMA、低CCR7と低SELL)、クラスター2には活性化CD4+ T細胞(高HLA-DR、高PDCD1)、クラスター3にはナイーブCD4+ T細胞(高CCR7、高SELL、低CTLA4、低HLA-DR、低IFNG)、クラスター4にはTfh細胞(高CXCL13、高TNFSF8、高SH2D1A、高BTLA)、クラスター8にはTreg細胞(高CTLA、高TNFRSF1B、高TIGIT、高TNFRSF18)の特徴があった。クラスター4での効率的なHIV-1の複製にCXCL13が直接関与するかを明らかにするためにCXCL13の受容体CXCR5を発現するCD4+ T細胞株を調製し、感染後にCXCL13を添加したが感染増強は見られなかった。CXCL13には感染増強はないがHIV-1を効率よく産生する細胞のマーカーであることが示唆された。HIV-1発現とヒトゲノムへのプロウイルスの挿入部位との関連性の解析実験として、隣接配列を増幅するPCR法により全HIV-1プロウイルスを解析したところ、CD4+ T細胞におけるヒストン修飾のクロマチン免疫沈降データとの照合解析から、組込み部位はH3K27ac、H3K36me3、H3K4me1/3などの活性化ヒストン修飾の領域に集積していたが、発現抑制のヒストン修飾であるH3K27me3およびH3K9me3領域への組込み数は少なかった。これらの結果は、多くのウイルスの組込みが遺伝子発現領域に生じ、ウイルス発現と関連していることを示唆している。一方、転写の方向性に関しては、順方向と逆方向への組み込まれたプロウイルスの頻度ほとんど同じであった。

ヒ ト change マ ウ ス の within cells infected with HIV - 1 に 発 now す る マ ー カ ー を shows す た め に, 1 cell RNA シ ー ク エ ン ス デ ー タ を analytical し again た. 亜 set 団 (ク ラ ス タ ー) 1, 2, 3, 4, 8 の 発 now heritage 伝 son と し て, ク ラ ス タ ー 1 に は Th1 cells (high IFNG, high GZMA and low when the CCR7 と low SELL), ク ラ ス タ ー 2 に は activated CD4 + T cells (high HLA-DR, high PDCD1), <s:1> ラスタ ラスタ 3に ナ ナ ナ ブ ブCD4+ T cells (high CCR7, high SELL, low CTLA4, low HLA-DR, low IFNG), <s:1> ラスタ ラスタ 4に <e:1> Tfh cells (high CXCL13, high TNFSF8, high SH2D1A, high BTLA), <s:1> ラスタ <s:1> 8に <e:1> Treg cells (high CTLA, high TNFRSF1B, high TIGIT) High TNFRSF18) <s:1> characteristics があった. ク ラ ス タ ー 4 で の sharper rate の な HIV - 1 copy に CXCL13 が masato directly with す る か を Ming ら か に す る た め に CXCL13 の by let body CXCR5 を 発 now す る CD4 + T cell lines を modulation し, infection after に CXCL13 を add し た が infection raised strong は see ら れ な か っ た. CXCL13 に は infection raised strong は な い を が HIV - 1 working rate よ く produce す る cells の マ ー カ ー で あ る こ と が in stopping さ れ た. HIV - 1 発 now と ヒ ト ゲ ノ ム へ の プ ロ ウ イ ル ス の scions into parts と の masato even sex の parsing be 験 と し て, 隣 match column を raised after す る PCR method に よ り all HIV - 1 プ ロ ウ イ ル ス を parsing し た と こ ろ, CD4 + T cells に お け る ヒ ス ト ン modified の ク ロ マ チ ン immune sink デ ー タ と の according to combined analytical か ら, group 込 み parts は H3K27ac, H3K36me3, H3K4me1/3 な ど の activeness ヒ ス ト ン modified に の field set product し て い た が, 発 now suppression の ヒ ス ト ン modified で あ る H3K27me3 お よ び H3K9 In the me3 field, the number of へ groups of 込み is へ less than that of な った った. こ れ ら は の results, much く の ウ イ ル ス の group 込 み が posthumous son 伝 発 fields に じ, ウ イ ル ス 発 now と masato even し て い る こ と を in stopping し て い る. A party, planning to write の directional に masato し て は, along the direction と inverse direction へ の group み 込 ま れ た プ ロ ウ イ ル ス の frequency ほ と ん ど with じ で あ っ た.

项目成果

Antithetic effect of interferon-α on cell-free and cell-to-cell HIV-1 infection.

干扰素-α对无细胞和细胞对HIV-1感染的反对作用。

• DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010053
• 发表时间: 2022-04
• 期刊: PLoS computational biology
• 影响因子: 4.3

HIV-1 tracing method of systemic viremia in vivo using an artificially mutated virus pool

使用人工突变病毒库的体内系统性病毒血症的HIV-1追踪方法

• DOI: 10.1111/1348-0421.12862
• 发表时间: 2021
• 期刊: Microbiology and Immunology
• 影响因子: 2.6
• 作者: Andrew Soper;Yoshio Koyanagi;Kei Sato
• 通讯作者: Kei Sato

Characteristics of HIV-1-infected cells in a humanized mouse model

人源化小鼠模型中 HIV-1 感染细胞的特征

• 发表时间: 2021
• 作者: Shinnakasu Ryo;Sakakibara Shuhei;Yamamoto Hiromi;Wang Po-hung;Moriyama Saya;Sax Nicolas;Ono Chikako;Yamanaka Atsushi;Adachi Yu;Onodera Taishi;Sato Takashi;Shinkai Masaharu;Suzuki Ryosuke;Matsuura Yoshiharu;Hashii Noritaka;Takahashi Yoshimasa;Inoue Takeshi;Kei Sato
• 通讯作者: Kei Sato