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Principles of chromatin operations ensuring the repair of genomic DNA damage caused by environmental stresses

确保修复环境压力引起的基因组 DNA 损伤的染色质操作原理

基本信息

批准号：
21H03598
负责人：
菅澤薫
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

１．損傷部位にリクルートされるヒストン修飾酵素の解析：　ヒストン脱アセチル化酵素HDAC1/2及びその活性化因子であるMTA（metastasis-associatd）ファミリータンパク質がDNA損傷部位にリクルートされるメカニズムを解明するため、これらの因子をサブユニットとして含む転写コリプレッサー複合体に着目した解析を行った。その結果、特にクロマチンリモデリング活性を持つATPaseサブユニットの発現抑制によってXPC及びMTAの損傷部位へのリクルートが減弱するだけでなく、当該サブユニット自身が損傷部位にリクルートされることを見出した。２．クロマチンとの相互作用を介したXPCの局在・動態制御機構の解析：　LacO-LacRシステムを用いて、HDACのテザリングによりXPCがLacOアレイにリクルートされることを前年度までに示したが、この時XPCはLacOアレイを含むクロマチン領域で結合と解離を繰り返しており、その結合親和性はDNA損傷部位と比較しても決して低くないことがわかった。さらに、ヒストンメチル化酵素EHMT1が、HDACと同様にXPCをLacOアレイにリクルートできることを示すとともに、EHMT1の発現抑制によるXPCの損傷部位へのリクルートの減弱が、XPCタンパク質中央部の天然変性領域に依存することが示された。３．XPCのゲノムワイドな局在制御と損傷修復効率の相関：　前年度に引き続き、XPC及びヒストン修飾を標的とするクロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq）解析のためのサンプル調製及びデータ取得を行った。

1. Analysis of the modified enzyme in the injured area: にリトされるヒストトされるヒストトされるヒストヒストンア off セチル phenoloxidase HDAC1/2 and びその activation factor である MTA (metastasis - associatd) ファミリータンパク qualitative が DNA injury にリクルートされるメカニズムを interpret するため, これらの factor をサブユニットとして containing む planning write コリプ The レッサレッサ complex に addresses the たた resolution を rows った. その results, にクロマチンリモデリング active を hold つ ATPase サブユニットの発 now inhibit によって XPC and び MTA の injury へのリクルートが abate するだけでなく, when the サブユニット itself が injury にリクルートされることを shows した. 2 {" text ":" : "ロロチとと <s:1> interaction を mediation たXPC <s:1> bureau in · dynamic control mechanism <e:1> analysis:"}" LacO - LacR システムを with いて, HDAC のテザリングにより XPC が LacO アレイにリクルートされることを before annual までに shown したが, この XPC when は LacO アレイを containing むクロマチン fields でと dissociation を Qiao り return しており, その combined with affinity は DNA injury Youdaoplaceholder0 is compared with that of ててと to determine that of て is lower than that of くなとがわとがわったった. さらに, ヒストンメチル phenoloxidase EHMT1 が, HDAC と with others に XPC を LacO アレイにリクルートできることを shown すとともに, EHMT1 の発 now inhibit による XPC の injury へのリクルートの abate が, XPC タンパクの - natural quality, and the central department field に dependent することがさ Youdaoplaceholder0. 3. The XPC のゲノムワイドな bureau in the system of imperial と damage repair services rate の phase masato: before the annual に lead き続き, XPC and びヒストン modified を mark とするクロマチン immune sink シーケンス (ChIP - seq) parsing のためのサンプル modulation and びデータを row った.