Principles of chromatin operations ensuring the repair of genomic DNA damage caused by environmental stresses

确保修复环境压力引起的基因组 DNA 损伤的染色质操作原理

• 批准号: 21H03598
• 负责人: 菅澤 薫
• 金额: $ 10.98万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03598/
• 关键词: ヌクレオチド除去修復; DNA損傷認識; 紫外線; 色素性乾皮症; クロマチン

１．損傷部位にリクルートされるヒストン修飾酵素の解析：　ヒストン脱アセチル化酵素HDAC1/2及びその活性化因子であるMTA（metastasis-associatd）ファミリータンパク質がDNA損傷部位にリクルートされるメカニズムを解明するため、これらの因子をサブユニットとして含む転写コリプレッサー複合体に着目した解析を行った。その結果、特にクロマチンリモデリング活性を持つATPaseサブユニットの発現抑制によってXPC及びMTAの損傷部位へのリクルートが減弱するだけでなく、当該サブユニット自身が損傷部位にリクルートされることを見出した。２．クロマチンとの相互作用を介したXPCの局在・動態制御機構の解析：　LacO-LacRシステムを用いて、HDACのテザリングによりXPCがLacOアレイにリクルートされることを前年度までに示したが、この時XPCはLacOアレイを含むクロマチン領域で結合と解離を繰り返しており、その結合親和性はDNA損傷部位と比較しても決して低くないことがわかった。さらに、ヒストンメチル化酵素EHMT1が、HDACと同様にXPCをLacOアレイにリクルートできることを示すとともに、EHMT1の発現抑制によるXPCの損傷部位へのリクルートの減弱が、XPCタンパク質中央部の天然変性領域に依存することが示された。３．XPCのゲノムワイドな局在制御と損傷修復効率の相関：　前年度に引き続き、XPC及びヒストン修飾を標的とするクロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq）解析のためのサンプル調製及びデータ取得を行った。

1. Analysis of DNA modification enzymes at damaged sites: HDAC1/2 and MTA (metastasis-associatd) activation factors at damaged sites As a result, the inhibition of ATPase activity in the injured part of XPC and MTA was reduced, and the inhibition of ATPase activity in the injured part of XPC and MTA was observed. 2. Analysis of the interaction mechanism between LacO and HDAC: LacO-LacR system, HDAC system, XPC system, LacO system, XPC system, XPC system, HDAC system, XPC system, XPC system, HDAC system, XPC system, XPC system, X In addition, the expression of EHMT1, HDAC and XPC is related to the inhibition of the development of EHMT1, the attenuation of the damage site of XPC, and the natural dependence of XPC on the central part of the body. 3. Correlation between XPC's immune system control and damage repair efficiency: previous year's immune system control, XPC and XPC's immune system control (ChIP-seq) analysis, immune system control and damage repair efficiency

项目成果

ヒストン修飾を介したヌクレオチド除去修復の損傷認識促進機構

组蛋白修饰介导的核苷酸切除修复损伤识别促进机制

• 发表时间: 2022
• 作者: 日下部将之;前田拓海;各務恵理菜;綿田瑞希;菅澤 薫
• 通讯作者: 菅澤 薫

ヌクレオチド除去修復におけるDNA損傷認識を制御するクロマチン構造変換因子複合体

染色质结构转换因子复合物在核苷酸切除修复过程中控制 DNA 损伤识别

• 发表时间: 2022
• 作者: 槌田千輝;日下部将之;各務恵理菜;栗原文佳;草尾佳那子;前田拓海;横井雅幸;酒井 恒;菅澤 薫
• 通讯作者: 菅澤 薫

ヌクレオチド除去修復の損傷認識を補助するクロマチン構造変換機構の解明

阐明支持核苷酸切除修复中损伤识别的染色质结构转换机制

• 发表时间: 2021
• 作者: 前田拓海;日下部将之;菅澤 薫
• 通讯作者: 菅澤 薫

神戸大学バイオシグナル総合研究センター・菅澤研究室ホームページ

神户大学生物信号研究中心/菅泽实验室主页

ヌクレオチド除去修復の損傷認識を促進するクロマチン構造変換因子の機能解析

促进核苷酸切除修复中损伤识别的染色质结构转换因子的功能分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 前田拓海;日下部将之;横井雅幸;酒井 恒;菅澤 薫
• 通讯作者: 菅澤 薫