课题基金 / 基金详情

Innovative chemical genetics on novel function of endogenous metabolites

Innovative chemical genetics on novel function of endogenous metabolites
内源代谢物新功能的创新化学遗传学
批准号:
19H05640
负责人:
吉田 稔
金额:
$128.71万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-06-26 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究では (1) エネルギー代謝、(2) 低酸素応答、 (3) アミノ酸代謝、(4) 脂質代謝、(5) タンパク質アシル化、(6) RNA代謝について化学遺伝学研究を推進した。(1) エネルギー代謝: SIRT2の脱長鎖アシル化反応の生成物が脱アセチル化反応の内在性阻害因子であるにもかかわらず、脱長鎖アシル化反応は進行する機構を解析するため、MDシミュレーションを行ったところ、アシル化基質と酵素の複合体はきわめて安定だったのに対し、反応生成物と酵素の複合体は揺らぎが大きく、解離しやすいことが示唆された。 (2) 低酸素応答:低酸素応答を誘導するN-アシルドーパミンの生合成経路の解明を試み、リン脂質アシル基転移酵素として知られているPLAAT2をドーパミンアシル化酵素として同定した。(3)アミノ酸代謝:分裂酵母の窒素カタボライト抑制(NCR)の制御機構を解析するため、ロイシン要求性株のロイシン取り込みを指標として各種アミノ酸の効果を調べたところ、良好な窒素源ではないメチオニンがNCRを誘導することを見いだした。このメチオニンによるNCRも窒素代謝制御因子NSFの添加によって解除された。また、シデロフォアがNCRを抑制すること、NCRを制御する未同定の揮発性分子の存在がわかった。(4)脂質代謝:奇数鎖脂肪酸が脂質代謝に与える変動を網羅的に検出し、特定の脂質種の増加を明らかにした。(5) タンパク質アシル化:転写因子TEADのリジン残基の長鎖アシル化の内在性阻害剤の探索を実施し、得られたヒット化合物について、TEADの転写活性に対する影響を検討した。(6) RNA代謝:スプライシング調節薬SSAによってイントロンを含むタンパク質の生産が認められ、これらの多くが凝集体を形成し、ストレス応答を引き起こすことが明らかになった。
英文摘要
本研究では (1) エネルギー代謝、(2) 低酸素応答、 (3) アミノ酸代謝、(4) 脂質代謝、(5) タンパク質アシル化、(6) RNA代謝について化学遺伝学研究を推進した。(1) エネルギー代謝: SIRT2の脱長鎖アシル化反応の生成物が脱アセチル化反応の内在性阻害因子であるにもかかわらず、脱長鎖アシル化反応は進行する機構を解析するため、MDシミュレーションを行ったところ、アシル化基質と酵素の複合体はきわめて安定だったのに対し、反応生成物と酵素の複合体は揺らぎが大きく、解離しやすいことが示唆された。 (2) 低酸素応答:低酸素応答を誘導するN-アシルドーパミンの生合成経路の解明を試み、リン脂質アシル基転移酵素として知られているPLAAT2をドーパミンアシル化酵素として同定した。(3)アミノ酸代謝:分裂酵母の窒素カタボライト抑制(NCR)の制御機構を解析するため、ロイシン要求性株のロイシン取り込みを指標として各種アミノ酸の効果を調べたところ、良好な窒素源ではないメチオニンがNCRを誘導することを見いだした。このメチオニンによるNCRも窒素代謝制御因子NSFの添加によって解除された。また、シデロフォアがNCRを抑制すること、NCRを制御する未同定の揮発性分子の存在がわかった。(4)脂質代謝:奇数鎖脂肪酸が脂質代謝に与える変動を網羅的に検出し、特定の脂質種の増加を明らかにした。(5) タンパク質アシル化:転写因子TEADのリジン残基の長鎖アシル化の内在性阻害剤の探索を実施し、得られたヒット化合物について、TEADの転写活性に対する影響を検討した。(6) RNA代謝:スプライシング調節薬SSAによってイントロンを含むタンパク質の生産が認められ、これらの多くが凝集体を形成し、ストレス応答を引き起こすことが明らかになった。
期刊论文(125)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Shin Ohsawa, Yoko Yahiroda, Minoru Yohida]
通讯作者: Minoru Yohida
Development of NanoBiT-based 2- and 3-hybrid system in fission yeast
裂殖酵母中基于 NanoBiT 的 2 和 3 杂交系统的开发
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Akihisa Matsuyama, Minoru Yoshida]
通讯作者: Minoru Yoshida
Target identification using a yeast chemical genomic approach
使用酵母化学基因组方法进行目标鉴定
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Yoko Yashiroda, Sheena Li, Hiroyuki Osada, Minoru Yoshida, Chad Myers, Charles Boone]
通讯作者: Charles Boone
Fatty acyl metabolites as intrinsic inhibitors of SIRT2 deacetylase
脂肪酰代谢物作为 SIRT2 脱乙酰酶的内在抑制剂
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Kurosaki, T., Minoru Yoshida]
通讯作者: Minoru Yoshida
共 101 条
    専門家と非専門家の違いを考慮した科学的テキスト分析に関する研究
    • 批准号:
      24K15193
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.83万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      吉田 稔
    • 依托单位:
    Uncovering hidden functions of intrinsic metabolites using chemical genetics and informatics
    Utilization of an energy metabolic control compound to treat mitochondrial diseases
    数値および専門性と話題性に着目したSNSからの科学的知識抽出に関する研究
    • 批准号:
      21K12141
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.33万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      吉田 稔
    • 依托单位:
    海外基金