薬剤標的分子同定のための分裂酵母ケミカルゲノミクス
薬剤標的分子同定のための分裂酵母ケミカルゲノミクス
批准号:
16658039
负责人:
吉田 稔
金额:
$2.05万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --
中文摘要
分裂酵母は細胞周期研究のモデル生物として有名であるが、ゲノム配列が決定されると、わずか4,900の遺伝子しか持たない、これまでに知られる最もゲノムサイズの小さな真核生物であることが判明した。にもかかわらず、イントロンや発現調節などは出芽酵母より高等真核生物に近く、驚くべきことに100種類以上ものヒト疾病医関連遺伝子が保存されており、ケミカルゲノミクスを行うための優れた生物である。我々のグループは、世界に先駆けてこの分裂酵母全遺伝子ORFのGateway法によるクローン化に成功した。そこで取得した4,900のORFを誘導可能なプロモーターによって分裂酵母内で発現させ、これを利用して薬剤標的分子同定のための基盤技術を確立することを目的とした。取得したORFの全てについて誘導発現が可能なnmt1プロモーターの制御下におき、C-末端にHis6-Flagという短いタグを連結した発現ベクターを作製し、分裂酵母のleu1-32遺伝子座にインテグレーションさせた形質転換株を作製した。全遺伝子の98%にあたる約4800遺伝子について形質転換株が取得された。これら全ての形質転換株について1つずつHisタグ抗体によるウェスタンブロット解析を行った結果、4300以上のクローンで発現が確認された。得られた発現クローンを用いて、標的分子がわかっている既存薬(フルコナゾール)に対する感受性が、標的分子あるいはそのパスウェイの過剰発現によって変化するかどうかを確認した。その結果、フルコナゾールの標的であるエルゴステロール合成に関与するシトクロムP-450の過剰発現株はフルコナゾール耐性となることが確認された。したがって本研究により、分裂酵母ポストゲノムを用いたケミカルゲノミクスが可能であることが示された。
英文摘要
分裂酵母は細胞周期研究のモデル生物として有名であるが、ゲノム配列が決定されると、わずか4,900の遺伝子しか持たない、これまでに知られる最もゲノムサイズの小さな真核生物であることが判明した。にもかかわらず、イントロンや発現調節などは出芽酵母より高等真核生物に近く、驚くべきことに100種類以上ものヒト疾病医関連遺伝子が保存されており、ケミカルゲノミクスを行うための優れた生物である。我々のグループは、世界に先駆けてこの分裂酵母全遺伝子ORFのGateway法によるクローン化に成功した。そこで取得した4,900のORFを誘導可能なプロモーターによって分裂酵母内で発現させ、これを利用して薬剤標的分子同定のための基盤技術を確立することを目的とした。取得したORFの全てについて誘導発現が可能なnmt1プロモーターの制御下におき、C-末端にHis6-Flagという短いタグを連結した発現ベクターを作製し、分裂酵母のleu1-32遺伝子座にインテグレーションさせた形質転換株を作製した。全遺伝子の98%にあたる約4800遺伝子について形質転換株が取得された。これら全ての形質転換株について1つずつHisタグ抗体によるウェスタンブロット解析を行った結果、4300以上のクローンで発現が確認された。得られた発現クローンを用いて、標的分子がわかっている既存薬(フルコナゾール)に対する感受性が、標的分子あるいはそのパスウェイの過剰発現によって変化するかどうかを確認した。その結果、フルコナゾールの標的であるエルゴステロール合成に関与するシトクロムP-450の過剰発現株はフルコナゾール耐性となることが確認された。したがって本研究により、分裂酵母ポストゲノムを用いたケミカルゲノミクスが可能であることが示された。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1002/yea.1181
发表时间:
2004-11-01
期刊:
YEAST
影响因子:
2.6
作者:
[Matsuyama, A, Shirai, A, Yoshida, M]
通讯作者:
Yoshida, M
専門家と非専門家の違いを考慮した科学的テキスト分析に関する研究
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批准号:24K15193
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2024
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
Uncovering hidden functions of intrinsic metabolites using chemical genetics and informatics
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批准号:23H05473
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$131.04万
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财政年份:2023
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
Utilization of an energy metabolic control compound to treat mitochondrial diseases
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批准号:22KF0400
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2023
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
ミトコンドリア病治療法確立を目指したエネルギー代謝の化学的制御研究
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批准号:21F21404
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2021
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
数値および専門性と話題性に着目したSNSからの科学的知識抽出に関する研究
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批准号:21K12141
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.33万
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财政年份:2021
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
Innovative chemical genetics on novel function of endogenous metabolites
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批准号:19H05640
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$128.71万
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财政年份:2019
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
Chemical biology on siderophore-mediated inter-microbial interactions
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批准号:19H00935
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.2万
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财政年份:2019
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
微生物由来スプライシング阻害剤によるイントロン生物学の展開
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批准号:26252013
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2014
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
HTML文書からの輪理構造自動推定に関する研究
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批准号:17700137
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2005
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
命題の局所的組織化に基づく,中学校数学科の幾何教育カリキュラムの開発と評価
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批准号:15530577
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
新規mRNA代謝監視機構に作用するハーボキシジエンの分子作用機構
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批准号:14656036
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2002
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
細胞周期と細胞死のシグナル伝達阻害剤の開発とその分子作用機構
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批准号:09256205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$30.72万
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财政年份:1997
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
数学学習における物語性についての考案
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批准号:09878041
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1997
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
細胞周期の分子機構とその抑制剤の開発
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批准号:06283208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$23.68万
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财政年份:1996
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
チロシギンナーゼ阻害剤ラディシコールによる腫瘍細胞形態正常化の分子機構
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批准号:08660093
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1996
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
ヒストナセチル化を制御する遺伝子のクローン化
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批准号:07660097
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
ヒストンデアセチラーゼ阻害剤トリコスタチンを用いた増殖関連遺伝子発現の解析
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批准号:05249207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
セラチアセリンプロテアーゼ遺伝子を用いた大腸菌の異種蛋白質菌体外分泌系の構築
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批准号:04660106
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1992
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
ヒストンデアセチラーゼ阻害剤トリコスタチンを用いた増殖関連遺伝子内現の解析
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批准号:04256209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1992
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
セラチアセリンプロテア-ゼの大腸菌における菌体外分泌機構の解明とその応用
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批准号:03660104
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1991
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负责人:吉田 稔
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依托单位:
海外基金