权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Rad17 ATPaseの解析からDNA損傷応答を標的とするシード化合物への展開

通过 Rad17 ATPase 分析开发针对 DNA 损伤反应的种子化合物

基本信息

批准号：
19K07079
负责人：
福本泰典
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

[紫外線照射によるRad17タンパク質の核小体移行昨年度の解析で、Rad17の”central basic domain”に核小体移行シグナルが存在することを見出していた。本年度は、紫外線照射によってその核小体への蓄積が促進されることを見出した。この成果をFukumoto et al. Int. J. Mol. Sci. 2022として報告した。[Rad17-iVERGEとの相互作用タンパク質の同定と解析]以前に私達はRad17のiVERGEと命名したC末端領域がRad17の機能に必須であることを報告していた(Fukumoto et a l. BBRC 2017, BBRC 2018, RRRC 2019)。今回私達はiVERGEの相互作用タンパク質Xを同定した。flag-EGFPをCOS-1細胞に発現させ、タンパク質Xが共免疫沈降されることを見出した。相互作用はiVERGE-S667のリン酸化に依存的であった。相互作用の分子機構を明らかにするためにIn silicoの解析を行った。iVERGEとタンパク質Xについて、ドッキングシュミレーションによって複数の相互作用モデルを作成した。相互作用エネルギーの計算とin vitroでの結果から、実験結果と一致すると期待される相互作用モデルを絞り込んだ。その構造を初期構造として、分子動力学シミュレーション(MD)の焼きなまし法(SA)によって多数の構造を取得した。取得した構造を機械学習によって分類し、大域的最適解と思われる構造を取得した。作成した構造モデルに基づいてタンパク質Xの変異体を作成し、iVERGEとの相互作用をin vivoにおいて検討した。タンパク質Xの変異体ではiVERGEとの相互作用が減弱した。以上の解析から、iVERGEの相互作用タンパク質Xを同定し、その相互作用機構を明らかにした。

The nucleosome transfer of Rad17 radiation induced by UV irradiation was analyzed last year, Rad17 "central basic domain" nucleosome migration was detected by UV irradiation, and the nucleosome migration was detected. This year, ultraviolet radiation has been used to promote the production of nucleosomes. The result is Fukumoto et al. Int. J. Mol. Sci. 2022 per cent, the report is not available. [Rad17-iVERGE interaction protocol] previously registered Rad17 iVERGE naming C-terminal domain Rad17 machine must register the reporting protocol (Fukumoto et a l. BBRC 2017, BBRC 2018, RRRC 2019). This time, we secretly agreed on the iVERGE interaction. Flag-EGFP