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オーソログ遺伝子群を用いた嗅覚受容体遺伝子のゲノム進化解析と環境要因との相関

オーソログ遺伝子群を用いた嗅覚受容体遺伝子のゲノム進化解析と環境要因との相関
使用直系同源基因组进行嗅觉受体基因的基因组进化分析以及与环境因素的相关性
批准号:
18K06359
负责人:
新村 芳人
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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2022年度は、以下の研究実績を得た。霊長類は優れた視覚をもつが、嗅覚は他の哺乳類に比べて退化している。また、イルカは聴覚(反響定位)をもちいて獲物を探すことができるが、味覚・嗅覚などの化学感覚は退化している。このように、進化の過程で異なる感覚間でトレード・オフが起きることが知られている。では、嗅覚・味覚・フェロモンという化学感覚同士では、このようなトレード・オフは起きるのだろうか?このことを調べるため、齧歯類のヤマアラシ亜目を用いて解析を行った。マアラシ亜目は生態的・形態的に多様であることに加え、嗅覚・味覚・フェロモンの受容体遺伝子数が多く、本解析に最適である。全ゲノム配列が利用可能な17種のヤマアラシ亜目に対し、嗅覚・味覚・フェロモンの受容体であるOR, T2R, V1Rの同定を行った。そして、17種間でオーソログ遺伝子群を同定し、ヤマアラシ亜目の進化過程における遺伝子の増減数を推定した。その結果、嗅覚・味覚・フェロモン三者の受容体遺伝子は、増減が同調していることが明らかになった。すなわち、化学感覚間においては、感覚のトレード・オフが起きるのではなく、同調して進化している。また、遺伝子の増減の速度は、V1R遺伝子が最も速く、次いでOR遺伝子、最も遅いのがT2R遺伝子であった。この結果は、種特異的なフェロモン、生育環境に依存する匂い物質、そして生物間で共通した毒物(苦味物質)という三者のリガンドの違いを反映していると考えられる。以上の結果を論文にまとめ、国際誌に投稿した。現在リバイズ中である。
期刊论文(50)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
A structural model for the channel pore and a ligand binding site of an insect gustatory receptor
昆虫味觉受体的通道孔和配体结合位点的结构模型
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Satoshi Morinaga, Koji Nagata, Sayoko Ihara, Yoshihito Niimura, Koji Sato, Kazushige Touhara]
通讯作者: Kazushige Touhara
Divergent evolution of olfactory receptor repertoire in New and Old World primates revealed by target capture and massive-parallel sequencing
通过目标捕获和大规模并行测序揭示新旧世界灵长类动物嗅觉受体库的不同进化
DOI: --
发表时间: 2018
期刊:
影响因子: --
作者: [Ryuichi Ashino, Yoshihito Niimura, Kazushige Touhara, Amanda D. Melin, Shoji Kawamura]
通讯作者: Shoji Kawamura
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Akhtar, M. S., Ashino, R., Niimura, Y. Touhara, K., Melin, A. D., and Kawamura, S.]
通讯作者: S.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102573
发表时间: 2022-11
期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子: 4.8
作者: [Morinaga, Satoshi, Nagata, Koji, Ihara, Sayoko, Yumita, Tomohiro, Niimura, Yoshihito, Sato, Koji, Touhara, Kazushige]
通讯作者: Touhara, Kazushige
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    環境への適応を特徴づける哺乳類嗅覚受容体遺伝子の探索とその機能解析
    • 批准号:
      22K06341
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      新村 芳人
    • 依托单位:
    脊椎動物ゲノムにおける嗅覚受容体多重遺伝子族の分子進化
    • 批准号:
      17710162
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      新村 芳人
    • 依托单位:
    大量遺伝情報解析によるヒトゲノム高次構造の比較進化的研究
    • 批准号:
      00J60105
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.54万
    • 财政年份:
      2000
    • 负责人:
      新村 芳人
    • 依托单位:
    海外基金