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小型魚類の嗅覚受容体遺伝子ファミリーのエピジェネティックな転写制御機構の解析

小鱼嗅觉受体基因家族表观遗传转录调控机制分析

基本信息

批准号：
16011214
负责人：
榎森康文
金额：
$ 2.5万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

脊椎動物の主嗅覚受容体(MOR)遺伝子は大きな遺伝子ファミリーであり、嗅神経細胞で発現する遺伝子は1種類に絞られる。この過程に関してクロマチン構造の変化などのエピジェネティックな制御機構が働いていると云う仮説を得、本研究では、小型魚類の中では嗅上皮が発達していて発現組織材料が得やすく、発現の解析が比較的容易なドジョウを主たる実験材料に用いた解析を行った。まず第1に、非発現細胞に見られるCpGメチル化によるDNA修飾状態をbisulfite法で、また、ヒストン修飾状態をChIP法で解析した。その結果、デフォルト(非発現細胞)においては、嗅覚受容体遺伝子クラスターは、ヘテロクロマチンに類似した不活性な状態になることを示唆する状態であることが判明した。次に、個体毎のコスミドライブラリーを作成して、多型性と進化の解析を個体差・アリル差を含めて行った。その結果、嗅覚受容体遺伝子クラスター内には、個体差が生じ易い領域と保存される領域が混在していることを明らかにした。つまり、クラスター内にはORF以外にも発現制御に関わる重要な配列がある一方、個体レベルでも塩基配列に差があるほか、挿入・欠失が起こりやすい領域があることが分かった。また、このようなクラスターレベルにおける遺伝子発現制御を検証するため、トランスジェニック動物を作成することを目的に、コスミド挿入断片を用いながら長鎖DNAコンストラクトを構築している。

Vertebrate main olfactory receptor (MOR) genes are produced by a variety of genes, such as large olfactory receptors and olfactory neurons. This study aims to explore the development of olfactory epithelium in small fish and to analyze the development of tissue materials. DNA modification status analysis by bisulfite method and ChIP method The result is that the receptor (non-developing cell) is in a similar inactive state and the receptor is in an inactive state. The analysis of polymorphism and evolution of individuals includes the following: As a result, the olfactory receptor is in the middle of the field, and the individual difference is in the middle of the field. In addition to the ORF, there is a need to develop a control system that is important for one party and one individual. In addition, there is a need to develop a control system that is important for one party and one individual. For example, if a DNA fragment is inserted into a DNA fragment, it can be used to construct a long-locked DNA fragment.