小型魚類の嗅覚受容体遺伝子ファミリーのエピジェネティックな転写制御機構の解析

小鱼嗅觉受体基因家族表观遗传转录调控机制分析

• 批准号: 15011209
• 负责人: 榎森 康文
• 金额: $ 3.52万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011209/
• 关键词: ゲノム; 進化; 遺伝子; 多重遺伝子; 嗅覚; 神経; エピジェネシス

脊椎動物の主嗅覚受容体(MOR)遺伝子は大きな遺伝子ファミリーであり、嗅神経細胞で発現する遺伝子は1種類に絞られる。このMOR遺伝子の発現制御機構をエピジェネシスの観点から明らかにすることを主たる目的として以下の項目を行った。(1)CpGメチル化領域とクロマチン免疫沈降DNA(ChIP)法によるMOR遺伝子のクロマチン状態の解析デフォルトにおけるクロマチンの状態を検討するため、肝臓からそれぞれDNAを抽出・精製し、メチル化状態を検討した結果、2箇所のCpGアイランドがほぼ100%のメチル化を受け、タンパクコード領城が高頻度メチル化、5'-上流城が中程度のメチル化状態であることが分かった。また、ドジョウの肝臓の細胞を用い、ChIP法によってヒストンメチル化とアセチル化状態を検討した結果、CpGアイランド周辺では、不活性化状態であることに適合するヒストンH3修飾状態であることが分かった。この結果、MOR遺伝子は、デフォルト状態においてヘテロクロマチン様の不活性な状態であることが示唆された。(2)嗅上皮ESTクローンの評価と嗅覚受容体遺伝子を含む嗅上皮特異的発現遺伝子クローンの同定ドジョウ嗅上皮ESTライブラリーを構築した。現在その塩基配列を決定(依頼)中である。評価を兼ねて、1万数千個の塩基配列を決定し、トラフグゲノムおよびゼブラフィッシュゲノム配列と比較し、嗅覚関連遺伝子を検索する。また、既に行っているラット嗅上皮のマイクロアレイによって同定した発現遺伝子との対応を行う予定である。続いて、各ゲノムクローンを得て、その構造から嗅上皮における発現制御に関する知見を得る。

Vertebrate main olfactory receptor (MOR) genes are produced by a variety of genes, such as large olfactory receptors and olfactory neurons. The following items were carried out for the purpose of developing and controlling the MOR gene: (1) Analysis of the state of MOR gene by CpG protein domain and immunoprecipitation DNA(ChIP) method; analysis of the state of MOR gene; extraction, purification, and analysis of the state of CpG protein; and analysis of the state of CpG protein domain and immunoprecipitation DNA (ChIP) method. 5'-Upper City The results showed that CpG was in the inactive state and the inactive state, and that it was suitable for the H3 modified state. As a result, the MOR gene is in a state of inactivity. (2)Olfactory epithelium EST gene evaluation and olfactory receptor gene construction including olfactory epithelial-specific development gene evaluation and identification of olfactory epithelium EST gene Now the base of the decision (according to) in. The evaluation and evaluation of the 10,000-strong base allocation decision, the selection and comparison of base allocation, and the detection of olfactory correlation factors In addition to the above, it is also necessary to establish a mechanism for the development of the olfactory epithelium. In the middle of the day, each member of the team was able to obtain information about the development of the olfactory epithelium and the structure of the team.

项目成果

I.Matsumoto, Y.Emori, S.Nakamura, K Shimizu, S Arai, K.Abe: "DNA microarray cluster analysis reveals tissue similarity and potential neuron-specific genes expressed in cranial sensory ganglia"Journal of Neuroscience Research. 74. 818-828 (2003)

I.Matsumoto、Y.Emori、S.Nakamura、K Shimizu、S Arai、K.Abe：“DNA 微阵列聚类分析揭示了组织相似性和颅感觉神经节中表达的潜在神经元特异性基因”神经科学研究杂志。

S.Irie-Kushiyama, M.Asano-Miyoshi, T Suda, K Abe, Y.Emori: "Identification of 24 genes and two pseudogenes coding for olfactory receptors in Japanese loach, classified into four subfamilies : a putative evolutionary process for fish olfactory receptor gen

S.Irie-Kushiyama、M.Asano-Miyoshi、T Suda、K Abe、Y.Emori：“鉴定日本泥鳅嗅觉受体的 24 个基因和两个假基因，分为四个亚科：鱼类嗅觉的推定进化过程

I.Matsumoto, N.Nagamatsu, S.Arai, Y.Emori, K.Abe: "Identification of candidate genes involved in somatosensory functions of cranial sensory ganglia"Molecular Brain Research. (印刷中). (2004)

I.Matsumoto、N.Nagamatsu、S.Arai、Y.Emori、K.Abe：“识别颅内感觉神经节体感功能的候选基因”（出版中）。