Phase specific omics on wood wafers and genome editing elucidate mechanism for white rot

木晶片和基因组编辑的阶段特异性组学阐明了白腐病的机制

• 批准号: 19F19095
• 负责人: 本田 与一
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19F19095/
• 关键词: 白色腐朽; 木材腐朽菌; オミックス; 木材分解系酵素; トランスクリプトミクス

木材片を基質としたフェーズ毎の腐朽の特徴について調べる為、白色腐朽菌ヒラタケおよびCeriporopsis subvermisporaかをウェハース状の木材片を基質として成長させ、菌糸先端部から基部にかけて見られる様々な木材の腐朽のフェーズ毎に発現遺伝子の網羅的解析、化学的解析を行うことで、腐朽形態の推移を特徴付けた。さらに、フェーズ毎の木材残渣の成分解析を行って、それらの解析結果を総合的に比較し、細胞壁のどのような木材成分が主に分解されている際に、どのような遺伝子が発現しているのかの因果関係を明らかにした。ヒラタケでは、多機能型ペルオキシダーゼの欠損株をCRISPR/Cas9を用いて単離し、木材片を用いた腐朽実験を行った。結果として、多機能型ペルオキシダーゼがリグニン分解に重要な働きをしていることが、逆遺伝学的な手法により証明された。また。Ceriporiopsis subvermisporaでは選択的にリグニンが分解されているフェーズとホロセルロースの分解も進んでいる選択性の低い分解フェーズがある事が、実験的に示された。

Wood slice を matrix と し た フ ェ ー ズ their の decayed の, 徴 に つ い て adjustable べ る is, white decay fungi ヒ ラ タ ケ お よ び Ceriporopsis Subvermispora か を ウ ェ ハ ー ス shape の woodchip を matrix と し て growth さ せ, bacteria si apex か ら base に か け て see ら れ る others 々 な の decayed wood の フ ェ ー ズ their に 発 now heritage 伝 の net analysis, chemical analysis line を う こ と で, corrupt form の を 徴 especially pay け た. さ ら に, フ ェ ー ズ their の wood residue analytical を の composition line っ て, そ れ ら の analytical results を 総 に compare し, cell wall の ど の よ う な wood components が main に decomposition さ れ て い る interstate に, ど の よ う な posthumous son 伝 が 発 now し て い る の か の causal masato を and Ming ら か に し た. ヒ ラ タ ケ で は, multiple function type ペ ル オ キ シ ダ ー ゼ の owe damage strain を CRISPR/Cas9 を with い て 単 し, wood piece を い た decay be 験 を line っ た. Results と し て, multiple function type ペ ル オ キ シ ダ ー ゼ が リ グ ニ ン decomposition に important な 働 き を し て い る こ と が, reverse but 伝 learn な gimmick に よ り prove さ れ た. Youdaoplaceholder0. The Ceriporiopsis subvermispora で は sentaku に リ グ ニ ン が decomposition さ れ て い る フ ェ ー ズ と ホ ロ セ ル ロ ー ス も の decomposition into ん で い る sentaku sex low の い decomposition フ ェ ー ズ が あ が る, be 験 に さ in れ た.