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Phase specific omics on wood wafers and genome editing elucidate mechanism for white rot

木晶片和基因组编辑的阶段特异性组学阐明了白腐病的机制

基本信息

批准号：
19F19095
负责人：
本田与一
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

木材片を基質としたフェーズ毎の腐朽の特徴について調べる為、白色腐朽菌ヒラタケおよびCeriporopsis subvermisporaかをウェハース状の木材片を基質として成長させ、菌糸先端部から基部にかけて見られる様々な木材の腐朽のフェーズ毎に発現遺伝子の網羅的解析、化学的解析を行うことで、腐朽形態の推移を特徴付けた。さらに、フェーズ毎の木材残渣の成分解析を行って、それらの解析結果を総合的に比較し、細胞壁のどのような木材成分が主に分解されている際に、どのような遺伝子が発現しているのかの因果関係を明らかにした。ヒラタケでは、多機能型ペルオキシダーゼの欠損株をCRISPR/Cas9を用いて単離し、木材片を用いた腐朽実験を行った。結果として、多機能型ペルオキシダーゼがリグニン分解に重要な働きをしていることが、逆遺伝学的な手法により証明された。また。Ceriporiopsis subvermisporaでは選択的にリグニンが分解されているフェーズとホロセルロースの分解も進んでいる選択性の低い分解フェーズがある事が、実験的に示された。

Wood chip を matrix としたフェーズ毎のdecay の特徴についてadjusted べる, white rot fungus ヒラタケおよびCeriporopsis Subvermispora かをウェハース-shaped のwood piece を matrix として growth させ, fungi apex part から base part にかけて见られる様々なWood のフェーズ毎に発existing 伝子の玮analytics, chemical analysis を行うことで, decayed form のshift を特徴FU けた.さらに, フェーズ毎のComponent analysis of wood residue の行って, それらのanalytical results を総合にし, cell wall のどのようなWood compositionが mainに decompositionされているinteriorに、どのような伝子が発行しているのかのcausal relationshipを明らかにした.ヒラタケでは, multifunctional type ペルオキシダーゼの无码综合をCRISPR/Cas9を用いて単し, wood piece を用いたdecay実験を行った. The result is that it is important to decompose the multi-function type of ペルオキシダーゼがリグニンな卍きをしていることが, the な Technique of the Reverse Legacy 伝学によりproves された.また. Ceriporiopsis subvermisporaでは选択的にリグニンがbreakdownされているフェーズとホロセルロースのanalysisも入んでいるchoose択性のlowいanalyzationフェーズがある事が、実験的に Showされた.