ゲノムのリプログラミングと染色体構築原理

基因组重编程和染色体构建原理

• 批准号: 15658107
• 负责人: 奥村 克純
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15658107/
• 关键词: 核マトリックス; クロマチン; 複製ファクトリー; FISH; セントロメアヘテロクロマチン; 複製フォーク; DNAメチル化; ヒストン修飾; ヘテロクロマチン; エピジェネティック; セントロメア; 複製タイミング; DNAファイバー; ES細胞; アセチル化; DNA複製; チェックポイント; インプリンティング

クロマチンドメインの形成に極めて重要である以下の二点について解析し成果のとりまとめを行った。DNA複製における核マトリックスの関与:まず修飾ヌクレオチドをパルスで複製時に取り込ませて核ハロー標本上で検出した結果、複製直後は取り込まれたヌクレオチドは核内にとどまっているが、チェイス30分後にはDNAループ上にも広がって検出され、DNA複製が核マトリックス上で起こっていることを示唆した。さらに複製タイミングがS期初期、中期、後期の特定のゲノム領域について解析した結果、それぞれの遺伝子領域に存在するMARはS期を通して核マトリックスに結合しているが、MAR以外のDNA配列は、それぞれの複製タイミングの時期にのみ核マトリックスと結合していることを明らかにした。また各種preRC複合体タンパク、複製ファクトリータンパクについても核マトリックスとの関係を明らかにし、これまでの成果とあわせて、複製・転写ファクトリーが核マトリックス上で機能しているモデルを提示した。セントロメアヘテロクロマチン領域におけるエピジェネティックな制御:DNAメチル化阻害時のヘテロクロマチン領域における複製フォークの進行と複製タイミング、ヒストンのエピジェネティックな動態との相関関係について解析した。triMeK4H3,diMeK4H3はDNAメチル化阻害で、セントロメア周辺ヘテロクロマチン領域に局在する一方、triMeK9H3はこの領域では少し減少した。また、24時間の5azadC処理によって、セントロメア周辺ヘテロクロマチンにおける修飾ヒストンの変換が起きた核はS期初期では少なく、この領域が複製するS期中期以降の核で多く見られた。これらの結果から、5-azadC処理により、セントロメア周辺ヘテロクロマチン領域のDNAのメチル化が減少することで、複製タイミングが早くなり、さらに複製フォークの進行が促進されるに伴って、その後のクロマチンアッセンブリーの際、ヒストン修飾の構成に大きな変化が起こると示唆された。さらに成果のまとめとして論文作成中である。

ク ロ マ チ ン ド メ イ ン の form に め extremely important で て あ る の below two point に つ い て parsing し results の と り ま と め を line っ た. DNA replication に お け る nuclear マ ト リ ッ ク ス の masato and: ま ず modified ヌ ク レ オ チ ド を パ ル ス で に when copying take り 込 ま せ て nuclear ハ ロ ー specimens で 検 out し た after the results, copy straight は り 込 ま れ た ヌ ク レ オ チ ド は intranuclear に と ど ま っ て い る が, チ ェ イ ス 30 minutes after に は DNA ル ー プ on に も hiroo が っ て 検 out さ れ, DN A replicates the が nucleus and で トリッ ス ス ス ス とを る る る る とを とを とを to indicate た. さ ら に copy タ イ ミ ン グ が S early period, middle and late の specific の ゲ ノ ム field に つ い て parsing し た results, そ れ ぞ れ の heritage 伝 sub-fields に exist す る MAR は S period を tong し て nuclear マ ト リ ッ ク ス に combining し て い る が, MAR の DNA match column は, そ れ ぞ れ の copy タ イ ミ ン グ の period に の み nuclear マ ト リ ッ ク ス Youdaoplaceholder0 combined with に て る る とを とを ら に に た た. ま た various preRC complex タ ン パ ク, duplicate フ ァ ク ト リ ー タ ン パ ク に つ い て も nuclear マ ト リ ッ ク ス と の masato を and Ming ら か に し, こ れ ま で の results と あ わ せ て, copy, planning to write フ ァ ク ト リ ー が nuclear マ ト リ ッ ク ス で function on し て い る モ デ ル を prompt し た. セ ン ト ロ メ ア ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン field に お け る エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な suppression: DNA メ チ ル when resistance against の ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン field に お け る copy フ ォ ー ク の reproducing と タ イ ミ ン グ, ヒ ス ト ン の エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な dynamic と の phase masato masato is に つ い て parsing し た. TriMeK4H3, diMeK4H3 は DNA メ チ ル resistance against で, セ ン ト ロ メ ア weeks 辺 ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン field に bureau in す る side, triMeK9H3 は こ の field で は reduce し し た. ま た, 24 time の 5 azadc 処 Richard に よ っ て, セ ン ト ロ メ ア weeks 辺 ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン に お け る modified ヒ ス ト ン の variations in が き た nuclear は "S early stage で は less な く, こ の field が copy す る S period in mid の nuclear で く see ら れ た. こ れ ら の results か ら, 5 - azadC 処 Richard に よ り, セ ン ト ロ メ ア weeks 辺 ヘ テ ロ ク ロ マ チ ン field の DNA の メ チ ル change が reduce す る こ と で, duplicate タ イ ミ ン グ が early く な り, さ ら に copy フ ォ ー ク の が and to promote さ れ る に with っ て, そ の after の ク ロ マ チ ン ア ッ セ ン ブ リ ー の interstate, ヒ ス ト ン modify の The large に な variation が starts with ると and された. Youdaoplaceholder0 achievements さらに まとめと て て paper in progress である.

项目成果

A 210-kb segment of tandem repeats and Retroelements located between imprinted subdomains of mouse distal chromosome 7

• DOI: 10.1093/dnares/11.5.325
• 发表时间: 2004-10-31
• 期刊: DNA RESEARCH
• 影响因子: 4.1
• 作者: Shirohzu, H;Yokomine, T;Sasaki, H
• 通讯作者: Sasaki, H

クロマチン・染色体実験プロトコール

染色质/染色体实验方案

• 发表时间: 2004
• 作者: M.-T.Gao et al.;押村光雄ら編
• 通讯作者: 押村光雄ら編

奥村 克純: "クロマチン構造とDNA複製"生体の科学. 54巻3号. 185-191 (2003)

Katsumi Okumura：“染色质结构和 DNA 复制”《生物科学》第 54 卷，第 3. 185-191 期（2003 年）。

A novel isoform of Vinexin, Vinexin γ, regulates Sox9 gene expression through activation of MAPK cascade in mouse fetal gonad

• DOI: 10.1111/j.1365-2443.2005.00844.x
• 发表时间: 2005-05
• 期刊: Genes to Cells
• 影响因子: 2.1
• 作者: M. Matsuyama;H. Mizusaki;A. Shimono;T. Mukai;K. Okumura;K. Abe;K. Shimada;K. Morohashi

Structure and evolution of the mouse pregnancy-specific glycoprotein (Psg) gene locus

小鼠妊娠特异性糖蛋白（Psg）基因座的结构和进化

• 发表时间: 2005
• 期刊: BMC Genomics 6巻4号(印刷中)
• 作者: Matsumoto R.;Ito Y.;Shin-ichiro Takebayashi;Andrew S McLellan
• 通讯作者: Andrew S McLellan