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糖鎖が構造形成におよぼす要因の解析と膜タンパク質結晶化への応用

糖鎖が構造形成におよぼす要因の解析と膜タンパク質結晶化への応用
影响糖链结构形成的因素分析及其在膜蛋白结晶中的应用
批准号:
13033044
负责人:
加藤 博章
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002

项目摘要

项目成果

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1.修飾糖鎖の解析について4ヶ所糖鎖の修飾を受けるリンゴ銀葉病菌由来エンドポリガラクツロナーゼのうち、2ヶ所(Ash92,Asn161)が修飾されているIaとその脱糖鎖型deIaについて超高分解能精密結晶構造解析を行った。また、オリゴガラクツロン酸との複合体を結晶化させることに成功し、サブサイト構造について明らかにすることができた。ついで、分解能を向上させることにより、水素の構造についても明らかにすることに成功した。さらに、中性子線解析によって、水素構造の確認を行うため、中性子線解析に必要となる巨大結晶(数ミリ立方メートル大)の作成を試みた。2.ABCトランスポーターについてガンの多剤耐性の原因となるMDR1と糖尿病薬スルホニルウレア剤のレセプターであるSUR1について、ヒトおよびマウス由来の遺伝子を用いてバキュロウイルスをベクターにした昆虫培養細胞(Sf-9)による発現系を構築し、得られた発現系を用いて活性型のタンパク質を大量生産(3リットルの液体培養)できる培養条件を確立した。また、細胞からミクロソーム画分を調製する方法を改良することにより収量を改良することができた。さらに、結晶化を補助するため、モノクロナール抗体から調製したFabフラグメントとの複合体を調製することを試みた。その結果、特定の界面活性剤を用いたときだけ複合体ができていることが判明した。
期刊论文(8)
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会议论文
Tetsuya Shimizu: "Active-Site Architecture of Endopolygalacturonase I from the Pathogenic Fungus, Stereum purpureum, Revealed by Crystal Structures in Native and Ligan-Bound Forms at Atomic Resolution"Biochemistry. 41. 6651-6659 (2002)
Tetsuya Shimizu:“通过原子分辨率下的天然和配体结合形式的晶体结构揭示了致病性真菌 Stereum purpureum 的内多聚半乳糖醛酸酶 I 的活性位点结构”生物化学。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Tetsuya Shimizu: "Active-Site Architecture of Endopolygalacturonase I from the Pathogenic Fungus, Stereum purpureum, Revealed by Crystal Structures in Native and Ligan-Bound Forms at Atomic Resolution"Biochemistry. (In press). (2002)
Tetsuya Shimizu:“通过原子分辨率下的天然和配体结合形式的晶体结构揭示了致病性真菌 Stereum purpureum 的内多聚半乳糖醛酸酶 I 的活性位点结构”生物化学。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Tetsuya Shimizu: "Crystallization and preliminary X-ray study of endopolygalacturonase from the pathogenic fungus Stereum purpureum"Acta Crystallographica Section D. 57. 1171-1173 (2001)
Tetsuya Shimizu:“来自病原真菌 Stereum purpureum 的内聚半乳糖醛酸酶的结晶和初步 X 射线研究”Acta Crystallographa 第 D. 57. 1171-1173 (2001)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Emiko Yamauchi: "Crystal structure of MARCKS calmodulin-binding domain peptide complexed with Ca2+ Calmodulin"Nature. Struct. Biol.. 10. 226-231 (2003)
Emiko Yamauchi:“与 Ca2 钙调蛋白复合的 MARCKS 钙调蛋白结合域肽的晶体结构”自然。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
化学的捕捉による多剤排出輸送体の多様な動的基質認識メカニズムの分子構造基盤
  • 批准号:
    24K01637
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.9万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    加藤 博章
  • 依托单位:
国際緊急援助活動と日本外交―1987―1993
  • 批准号:
    15J02529
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.22万
  • 财政年份:
    2015
  • 负责人:
    加藤 博章
  • 依托单位:
糖鎖修飾によるタンパク質構造安定化機構の構造生物学的研究
  • 批准号:
    17046008
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.2万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    加藤 博章
  • 依托单位:
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
  • 批准号:
    16659012
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.18万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    加藤 博章
  • 依托单位:
海外基金