ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
批准号:
13024275
负责人:
加藤 博章
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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本計画の目標は、ルシフェラーゼと反応中間体アナログであるデヒドロルシフェリルアデニレートとの複合体および、嫌気条件下におけるルシフェラーゼと真のアデニレート中間体との複合体のX線結晶構造解析を行い、アデニル化ルシフェリンの結合様式の構造的な基盤を明らかにすることにある。そこでリン酸基をスルファモイル基、ルシフェリン部分をデヒドロルシフェリンに変更した5'-O-[N-(dehydroluciferyl)-sulfamoyl adenosine (DLSA)を合成し、共結晶化を行った。その結果、1.3Å分解能の回折強度データが得られた。得られた回折強度データを用いて構造解析を行った結果、DLSAを示す良好な電子密度図が得られた。活性部位近傍についてルシフェラーゼ:生成物複合体の立体構造と比較したところ、α-リン酸の部分は約0.7Å移動していた。この移動に連動してルシフェラーゼのHis247がわずかに移動していることが観測された。しかしその他のアデニン、リボースおよびルシフェリンの部分においてはそれほど位置のずれは観測されなかった。一方、ルシフェリルAMP中間体に酸素が攻撃する状態の構造を捉えるため、嫌気条件下でLH2、ATPとともに本酵素を結晶化することを計画した。99.98%アルゴンガス存在下でこのサンプルを用いて結晶化を行ったところ、黄緑色の結晶が得られた。現在、この結晶のX線結晶解析を検討中である。
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科研奖励(0)
会议论文
Tetsuya Shimizu: "Active-Site Architecture of Endopolygalacturonase I from the Pathogenic Fungus, Stereum purpureum, Revealed by Crystal Structures in Native and Ligan-Bound Forms at Atomic Resolution"Biochemistry. 41. 6651-6659 (2002)
Tetsuya Shimizu:“通过原子分辨率下的天然和配体结合形式的晶体结构揭示了致病性真菌 Stereum purpureum 的内多聚半乳糖醛酸酶 I 的活性位点结构”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Emiko Yamauchi: "Crystal structure of MARCKS calmodulin-binding domain peptide complexed with Ca2+ Calmodulin"Nature. Struct. Biol.. 10. 226-231 (2003)
Emiko Yamauchi:“与 Ca2 钙调蛋白复合的 MARCKS 钙调蛋白结合域肽的晶体结构”自然。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
化学的捕捉による多剤排出輸送体の多様な動的基質認識メカニズムの分子構造基盤
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批准号:24K01637
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
国際緊急援助活動と日本外交―1987―1993
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批准号:15J02529
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2015
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
糖鎖修飾によるタンパク質構造安定化機構の構造生物学的研究
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批准号:17046008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
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批准号:16659012
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2004
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
糖鎖が構造形成におよぼす要因の解析と膜タンパク質結晶化への応用
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批准号:13033044
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
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批准号:12045269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
膜タンパク質結晶化の支援法の開発-ABCタンパク質を中心に
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批准号:11169222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:1999
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
X線結晶解析とタンパク質工学的方法によるアスパラギン合成酵素の活性中心の決定
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批准号:08660108
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
合成酵素によるATPの基質活性化機構-アスパラギン合成酵素のX線結晶解析
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批准号:07660110
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
迅速冷却によるグルタチオン合成酵素反応中の準安定構造のX線結晶解析
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批准号:06760085
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
γグルタミルシステイン合成酵素の機能改変
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批准号:03856028
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1991
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
グルタチオン合成酵素におけるフレキシブル・ループの機能解析
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批准号:02856027
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
グルタチオン合成酵素のX線結晶構造解析
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批准号:01760090
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1989
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
海外基金