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プラスミド様2本鎖RNAレプリコンの起源と進化

类质粒双链RNA复制子的起源和进化

基本信息

批准号：
17657078
负责人：
福原敏行
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

私たちは、1990年代から、宿主植物に対して病徴を示さず、宿主細胞に一定量存在し、垂直(種子)伝播するといったプラスミド様の性質をもち自己複製する2本鎖RNAレプリコンが種々の植物から検出されることを報告してきた。さらに、菌類、原生生物、昆虫からも同様な性質を示す2本鎖RNAが検出される。本研究では、植物だけでなく菌類、昆虫から検出される2本鎖RNAについて、塩基配列を中心とした分子構造を明らかにし、プラスミド様2本鎖RNAレプリコンの普遍性について明らかにした。植物病原菌Alternalia alternate EGS35-193株からは、3.6-1.5kbpの4成分の2本鎖RNAが検出される。L鎖(3.6kbp)を鋳型としてcDNAクローニングをおこない全長の塩基配列を決定したところ、L鎖はTotivirusとChrysovirusのRNA依存RNA合成酵素(複製酵素)に相同性を示すタンパク質をコードするが、その相同性は低く、新規な2本鎖RNAウイルスに分類されうる可能性が示された。昆虫ヤマヨツボシオオアリ(Camponotus yamaokai)からは、約6.3kbpの2本鎖RNAが検出される。この2本鎖RNAを鋳型にcDNAクローニングをおこない、約5kbpの塩基配列を決定・解析したところ、この2本鎖RNAは、TotivirusのRNA依存RNA合成酵素に相同性を示すタンパク質をコードすることが分かった。この結果は、昆虫に存在するプラスミド様2本鎖レプリコンから得られた初めての塩基配列情報である。また、Totivirusは、植物、原生生物、菌類から検出されていることから、動物(昆虫)も含めて、真核生物全般に分布するプラスミド様の性質を示す2本鎖RNAレプリコン(ウイルス)であることが示された。

In the 1990s, the host plant showed signs of disease, a certain amount of host cell presence, vertical (seed) seeding, the nature of the plant, and self-replication. The same properties of fungi, protozoa, and insects are shown in 2. In this study, we investigated the prevalence of 2-locked-RNA in fungi and insects, and the molecular structure of 2-locked-RNA in plants and plants. Plant pathogenic fungus Alternalia alternate EGS35-193 strains were found to have 4 components of 3.6-1.5kbp and 2 locked-in RNA. L-lock (3.6kbp) is a type of cDNA that determines the alignment of full-length RNA bases. The identity of L-lock RNA synthase (replicase) between L-lock Tovirus and Chrysovirus is shown. The identity is low. The possibility of classifying L-lock RNA is shown. Insect DNA sequence analysis (Camponotus yamaokai): 6.3 kbp and 2-mer RNA sequence analysis. The identity of the RNA dependent RNA synthase of this 2-locked-RNA gene is shown in the following table: cDNA sequence analysis of approximately 5kbp nucleotide sequence. The results are as follows: 1. Insect species are present in the first place, and 2. Insect species are present in the second place. The nature of virus, virus, plant, protozoa, fungi, animal (insect), eukaryote and eukaryote is shown in this paper.