精神発達障害緩和分子同定のための一卵性双生児間エピゲノム比較アプローチ

使用同卵双胞胎之间的比较表观基因组方法来识别缓解精神发育障碍的分子

• 批准号: 19659261
• 负责人: 久保田 健夫
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: University of Yamanashi
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659261/
• 关键词: 遺伝学; 遺伝子; ゲノム; 脳神経疾患; 発現制御

本研究の目的は、ゲノムを共有する一卵性双子間でも存在するエピゲノムの差異が存在する最近の知見を背景とする、レット症候群の一卵性双子例を対象にした精神発達障害の新規関連遺伝子を探索することである。具体的には、双子間のエピゲノム(DNAメチル化パターン)差異領域を特定し、その中から本症候群の責任蛋白質(MeCP2)によって調節されるメチル化遺伝子を見いだし、最終的に双子間での発現差異を明らかにする。平成20年度は、この目的を達成させるために、ゲノムマイクロアレイ装置で解析する試料の調整法の確立,ならびに調整された試料を用いた解析を行った。具体的にはメチル化DNAを選択的に吸着し濃縮させる,チル化DNA結合タンパク質(MBD2b)のカラムを用いて濃縮し、濃縮されたDNAサンプルにおいて、前年度に明らかにした材料であるヒトリンパ球における高メチル化領域がみられ、低メチル化領域がみられないことを、定量リアルタイムPCRにより確認した。その結果、Bisulfite sequencing法で高メチル化が認められたCDX1, PNLDC, HISTIH2BA遺伝子領域は濃縮され、同法で低メチル化が認められたPTTGIP, STCH遺伝子領域やCpGを含まないAGEH遺伝子領域は濃縮されていなかった。以上より、MBD2bのカラムはメチル化領域を選択的に濃縮していると考え、これを用いてアレイ解析を行った。その結果、高メチル化が予想される領域はメチル化が高く描出された。この基礎的研究成果をふまえ、双子間比較を行い、症状の差異に関連する遺伝子を見いだす予定である。

The purpose of this study is to explore the relationship between genetic diversity and mental health disorders. Specific areas of DNA differentiation between twins are identified, and the regulatory proteins responsible for this syndrome (MeCP2) are identified, and finally the genetic differentiation between twins is identified. In 2010, the test sample was analyzed and adjusted. The specific DNA binding protein (MBD2b) was purified by adsorption, concentration, and quantitative PCR. The results showed that MBD2b binding protein (MBD2b) was purified by PCR, concentration, and purification. Results: Bismuth sequencing method was used to identify CDX1, PNLDC, HISTIH2BA and CpG subdomains, and the same method was used to identify PTTGIP, STCH and CpG subdomains. The above, MBD2b and the list of selected fields are concentrated and analyzed. The result is that the field of high quality products is very high. The results of this basic research are as follows: comparison between twins, correlation between symptoms, and genetic analysis.

项目成果

セカンドオピニョン実践ガイド(遺伝カウンセリングに基づくセカンドオピニョンの章を担当)

第二意见实用指南（负责基于遗传咨询的第二意见章节）

• 发表时间: 2007
• 作者: 久保田健夫;ほか
• 通讯作者: ほか

ヒトジンパ球における遺伝子プロモダター領域のDNAメチル化パターン : 臨床研究にむけてのエピゲノム基盤.

人类淋巴细胞基因启动子区域的 DNA 甲基化模式：临床研究的表观基因组基础。

• 发表时间: 2008
• 期刊: 山梨医科学雑誌 23
• 作者: 大堀健太;ら
• 通讯作者: ら

レッド症候群一卵性双生児のエピゲノム解析にむけての基礎的検討.

红色综合征同卵双胞胎表观基因组分析的基础研究。

• 发表时间: 2008
• 作者: 大堀健太;ら.
• 通讯作者: ら.

New MeCP2-target neuronal genes potentially associated with Rett syndrome.

新的 MeCP2 目标神经元基因可能与 Rett 综合征相关。

• 发表时间: 2007
• 作者: Chunshu Y;et. al.
• 通讯作者: et. al.

基礎研究の新たな方向性を解く28「疾患解明のためのOverview: Rett症候群-エピジェネティクスの理解を進展させた精神発達障害疾患-」.

揭示基础研究的新方向 28“疾病阐明概述：雷特综合征 - 一种精神发育障碍，促进了对表观遗传学的理解。”

• 发表时间: 2007
• 期刊: 実験医学 25
• 作者: 久保田健夫;ほか
• 通讯作者: ほか