メチル化特異的PCRを用いたがん組織におけるメチル化異常のゲノムスキャン

使用甲基化特异性 PCR 对癌症组织中的甲基化异常进行基因组扫描

• 批准号: 12213053
• 负责人: 久保田 健夫
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: National Center of Neurology and Psychiatry
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12213053/
• 关键词: がん関連遺伝子; メチル化; プロモーター; p16遺伝子; ゲノムスキャン; がん抑制遺伝子; SNRPN遺伝子; メチル化特異的PCR

さまざまながん関連遺伝子を対象に、がん組織におけるDNAのメチル化異常をメチル化特異的PCR法を用いて調べた.p16、p15、E-カドヘリン、H-カドヘリン、エストロゲン受容体遺伝子のプロモーターのメチル化は食道扁平上皮がん210サンプルにおいて、それぞれ18%、1%、17%、17%、24%に認められた.また20%のサンプルは2種以上の遣伝子が同時にメチル化していた.さらに正常状態で50%のメチル化がみられるSNRPN遺伝子について食道がん組織におけるメチル化変化を調べたところ、16%に過メチル方向の21%に脱メチル方向の顕著な変化を認めた.一方子宮筋肉腫では、発現低下の見られた遺伝子においてプロモーターのメチル化は全く見られなかった.以上より、ある種(すべてではない)のがんではメチル化異常がゲノム上の多数の箇所に生じることが明らかになり、このことはがんにおけるゲノムのメチル化安定化機構の破綻を示唆するものと考えられた.今回解析した遺伝子の染色体上のマップ位置は、ER遺伝子が6番染色体端腕上、p16,p15遺伝子が9番端腕上、SNRPN遺伝子が15番長腕上,E-cad.,H-cad.遺伝子が16番長腕上である.これらの領域に広くメチル化異常が認めもれたことは、がん組織においてゲノムワイドにメチル化異常が生じていることが示唆された.このことはまた、がん組織におけるゲノムのメチル化安定化機構の破綻が示唆していると考えられた.今後はこのような基礎的知見をふまえ、実際にがん関連遺伝子ではメチル化がどのように遺伝子を不活化していくのか.その機構を明らかにすることで、本研究が提唱した「がんにおけるゲノムメチル化安定化機構の破綻」の解明をめざしたいと考えている.

The PCR method was used to adjust the expression of DNA in the target tissues. p16, p15, E-protein, H-protein, E-protein, E-protein, E- More than 20% of the samples were collected from more than 2 different samples at the same time. 50% of SNRPN samples in normal condition were processed in different directions, 16% in different directions, and 21% in different directions. A side of the uterus muscle swelling, appear low and see the child, the child, the child. The above mentioned problems are caused by the majority of the above problems. This paper analyzes the position of the chromosome on the chromosome, ER gene on the wrist of chromosome 6, p16,p15 gene on the wrist of chromosome 9, SNRPN gene on the wrist of chromosome 15,E-cad. H-cad. This is the first time I've ever seen an exception in a field. This is the first time that the organization has been able to stabilize the structure. In the future, the basic knowledge of this problem will be changed, and the related information will be changed. This paper proposes an explanation of the flaws in the stabilization mechanism.

项目成果

Wada t,Kubota T, et al.: "Molecular genetic study of Japanese patients with X-linked..."Am J Med Genet. 94. 242-248 (2000)

Wada t、Kubota T 等人：“日本 X 连锁患者的分子遗传学研究……”Am J Med Genet。

Nakane T,Kubota T, et al.: "Opiz Trigonocephaly (C)-like syndrome, or Bohring-Opitz syndrome..."Am J Med Genet. 92. 361-362 (2000)

Nakane T、Kubota T 等人：“Opiz Trigonocephaly (C) 样综合征，或 Bohring-Opitz 综合征......”Am J Med Genet。

Seki H,Kubota T,Ikegawa S, et al.: "Mutation frequencies of EXT1 and EXT2 in 43 Japanese families..."Am J Med Genet. 99. 59-62 (2001)

Seki H,Kubota T,Ikekawa S, et al.：“43 个日本家庭中 EXT1 和 EXT2 的突变频率......”Am J Med Genet。