メチル化特異的PCRを用いたがん組織におけるメチル化異常のゲノムスキャン

使用甲基化特异性 PCR 对癌症组织中的甲基化异常进行基因组扫描

• 批准号: 12213053
• 负责人: 久保田 健夫
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: National Center of Neurology and Psychiatry
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12213053/
• 关键词: がん関連遺伝子; メチル化; プロモーター; p16遺伝子; ゲノムスキャン; がん抑制遺伝子; SNRPN遺伝子; メチル化特異的PCR

さまざまながん関連遺伝子を対象に、がん組織におけるDNAのメチル化異常をメチル化特異的PCR法を用いて調べた.p16、p15、E-カドヘリン、H-カドヘリン、エストロゲン受容体遺伝子のプロモーターのメチル化は食道扁平上皮がん210サンプルにおいて、それぞれ18%、1%、17%、17%、24%に認められた.また20%のサンプルは2種以上の遣伝子が同時にメチル化していた.さらに正常状態で50%のメチル化がみられるSNRPN遺伝子について食道がん組織におけるメチル化変化を調べたところ、16%に過メチル方向の21%に脱メチル方向の顕著な変化を認めた.一方子宮筋肉腫では、発現低下の見られた遺伝子においてプロモーターのメチル化は全く見られなかった.以上より、ある種(すべてではない)のがんではメチル化異常がゲノム上の多数の箇所に生じることが明らかになり、このことはがんにおけるゲノムのメチル化安定化機構の破綻を示唆するものと考えられた.今回解析した遺伝子の染色体上のマップ位置は、ER遺伝子が6番染色体端腕上、p16,p15遺伝子が9番端腕上、SNRPN遺伝子が15番長腕上,E-cad.,H-cad.遺伝子が16番長腕上である.これらの領域に広くメチル化異常が認めもれたことは、がん組織においてゲノムワイドにメチル化異常が生じていることが示唆された.このことはまた、がん組織におけるゲノムのメチル化安定化機構の破綻が示唆していると考えられた.今後はこのような基礎的知見をふまえ、実際にがん関連遺伝子ではメチル化がどのように遺伝子を不活化していくのか.その機構を明らかにすることで、本研究が提唱した「がんにおけるゲノムメチル化安定化機構の破綻」の解明をめざしたいと考えている.

使用甲基化特异性PCR方法检查了各种癌症相关基因的癌症组织中DNA中的甲基化异常。在210种食管食管鳞状细胞癌样品中，在18％，1％，1％，17％，17％和24％中观察到p16，p15，e-钙粘着蛋白，H-钙粘着蛋白和雌激素受体基因的启动子的甲基化。此外，在20％的样品中同时甲基化了两种或多种类型的有丝分裂药。此外，当我们研究SNRPN基因的食管癌组织的甲基化变化，该基因在正常状态下表现出50％的甲基化，我们发现在高甲基方向的16％SNRPN基因中的脱甲基化方向发生了显着变化。另一方面，在子宫肿瘤中，在表达降低的基因中未观察到启动子甲基化。从以上，在某些（但不是全部）癌症中，甲基化异常发生在基因组中的许多部位。这显然表明，这表明癌症中基因组甲基化稳定机制发生了细分。今天分析的基因的染色体图位置是第9臂染色体端臂，p16和p15基因上的ER基因，第15个臂上的SNRPN基因和E-CAD。和H-cad。第16臂上的基因。这些区域中广泛的甲基化异常导致癌组织中全基因组的全基因组。有人提出，疾病中发生了甲基化异常。这还表明，基因组甲基化稳定机制的失败在癌症组织中。未来，根据这些基本知识，我们希望甲基化实际上阐明基因在癌症相关基因中的基因如何阐明该机制，我们旨在阐明这种疾病的疾病，旨在阐明甲基化的甲基化。

项目成果

Wada t,Kubota T, et al.: "Molecular genetic study of Japanese patients with X-linked..."Am J Med Genet. 94. 242-248 (2000)

Wada t、Kubota T 等人：“日本 X 连锁患者的分子遗传学研究……”Am J Med Genet。

Seki H,Kubota T,Ikegawa S, et al.: "Mutation frequencies of EXT1 and EXT2 in 43 Japanese families..."Am J Med Genet. 99. 59-62 (2001)

Seki H,Kubota T,Ikekawa S, et al.：“43 个日本家庭中 EXT1 和 EXT2 的突变频率......”Am J Med Genet。

Nakane T,Kubota T, et al.: "Opiz Trigonocephaly (C)-like syndrome, or Bohring-Opitz syndrome..."Am J Med Genet. 92. 361-362 (2000)

Nakane T、Kubota T 等人：“Opiz Trigonocephaly (C) 样综合征，或 Bohring-Opitz 综合征......”Am J Med Genet。