レット症候群一卵性双生児のゲノム・エピゲノム比較解析に基づく発達障害遺伝子の同定

基于雷特综合征同卵双胞胎比较基因组和表观基因组分析的发育障碍基因鉴定

• 批准号: 21659254
• 负责人: 久保田 健夫
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: University of Yamanashi
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21659254/
• 关键词: 遺伝学; 遺伝子; ゲノム; 脳神経疾患; 発現制御

【研究の目的】これまでゲノムやエピゲノムの配列やパターンは、生涯変化しないと考えられてきた。しかしこれらが一卵性双生児間で異なることが報告され、この常識が覆されつつある。本研究の目的は、精神発達に著しい差異を認めるレット症候群の一卵性双生児例を対象に、ゲノム・エピゲノムの網羅的比較解析を行い、発達障害差異要因となった遺伝子の同定を行い、未だ確立していない後天的なゲノム変化の概念を確実なものにすることである。研究期間の1年目はゲノム面の比較解析を行い、101カ所のCNV(反復配列)領域の双子間差異を見いだした。2年目の今年度はエピゲノム面での比較解析を行った。【本年度の研究実績】エピゲノムの要素のうち、幼若期の環境要因による変化が生じうるDNAのメチル化修飾について、当該一卵性双子の網羅的比較解析を行った。方法はChIP on chip法を用いた。具体的には、メチル化CpGドメイン結合タンパク質の吸着ビーズを用いて、DNAメチル化領域を吸着させて回収し、これをヒトゲノム配列を網羅したDNAチップにかけた。その結果、全ゲノム(染色体)領域上で双子姉妹の姉(重症児)が高メチル化された領域が194箇所、妹(軽症児)が低メチル化された領域が109カ所見いだされ、これらの双子間エピゲノム差異遺伝子の中にはUBD2MP1、HIST1H2B2、GRINA、MECP2(対象患児が罹患しているレット症候群の責任遺伝子)が含まれていた。以上より、1.一卵性双生児間でもゲノムとヱピゲノムの違いがみられること、2.これらの違いが双子間の精神・神経症状の重症度の際に関連している可能性、が示唆された。今後、エピゲノム差異を呈した遺伝子の発現解析を行い、双子間の重症度差異との関連をさらに明確にする。

The purpose of the study is to conduct a <s:1> れまでゲノムやエピゲノム <s:1> examination in conjunction with やパタ やパタ <s:1> <e:1>, career changes <s:1> な と, と and えられて た た た. し か し こ れ ら が で variations between one egg twins where sex な る こ と が report さ れ, こ の sense が fu さ れ つ つ あ る. は の purpose this study, spirit 発 da に し い differences を recognize め る レ ッ ト syndrome の one egg twins where cases of sexual を に, seaborne ゲ ノ ム · エ ピ ゲ ノ ム の net line comparison analytic を い, 発 handicap of differences in と な っ た heritage 伝 son の with line を い, not だ し て い な い acquired な ゲ ノ ム variations change の concept を indeed be な も の に す る こ と で あ る. Study period の under 1 year は ゲ ノ の ム face compares analytic を do い, 101 カ の CNV (repeatedly with column) field の difference between the twin を see い だ し た. For the second year of <s:1> this year, a comparative analysis of で で on the エピゲノム page を った. エ の research be performance this year 】 【 ピ ゲ ノ ム の elements の う ち, if young period の environment by に よ る variations change が raw じ う る DNA の メ チ ル chemical modified に つ い て, when the egg Gemini の snare line comparison analytic を っ た. Method を ChIP on chip method を using を た. Specific に は, メ チ ル the CpG ド メ イ ン combining タ ン パ ク qualitative の sorption ビ ー ズ を with い て, DNA メ チ ル mineralization field を sorption さ せ て back 収 し, こ れ を ヒ ト ゲ ノ ム match column を snare し た DNA チ ッ プ に か け た. そ の result, whole ゲ ノ ム (chromosome) field で Gemini and sisters の 姉 (severe) where high が メ チ ル change さ れ が た field by 194, the younger sister (軽 disease where) が low メ チ ル change さ れ が 109 カ た field can see い だ さ れ, こ れ ら の between Gemini エ ピ ゲ ノ ム differences heritage 伝 child の に は UBD2MP1, HIST1H2B2, GRINA MECP2(corresponding to 児が suffering from て るレット るレット るレット syndrome 伝 offspring)が contains まれて た た. Above よ り, 1. The identical twins where sex between で も ゲ ノ ム と ヱ ピ ゲ ノ ム の violations い が み ら れ る こ と, 2. こ れ ら の violations い が の spirit, god 経 symptoms between the twin の intensive degree の interstate に masato even し て い る possibility and が sucking さ れ た. In the future, the エピゲノム difference を shows a <s:1> た continuation of 伝 and the occurrence of 伝. Analysis of the を line を and the difference in the severity of <s:1> between the twins と the relationship with をさらに is clear にする.

项目成果

Resistance of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) to tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL)-mediated apoptosis.

T 细胞急性淋巴细胞白血病 (T-ALL) 对肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体 (TRAIL) 介导的细胞凋亡的抵抗。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Exp Hematol
• 影响因子: 2.6
• 作者: Akahane K;et al
• 通讯作者: et al

レット症候群一卵性双生児のゲノム・エピゲノム比較解析による重症度差異関連発達障害遺伝子の探索.

通过对患有雷特综合征的同卵双胞胎进行比较基因组和表观基因组分析，寻找与严重程度差异相关的发育障碍基因。

• 发表时间: 2009
• 作者: 丹羽明;中畑龍俊;他8名;Kurosawa H.;久保田健夫;大堀健太
• 通讯作者: 大堀健太

DNA replication"Epigenetic modifications: genetic basis of environmental stress response"

DNA复制“表观遗传修饰：环境应激反应的遗传基础”

• 作者: 丹羽明;中畑龍俊;他8名;Kurosawa H.;久保田健夫;大堀健太;Kubota T
• 通讯作者: Kubota T

市民公開講座発達障害は、今、増えているのか-現状の把握と未来への提言「発達障害の増加要因-遺伝(エピジェネティクス)の立場から」.

公开讲座：现在发育障碍正在增加吗？了解现状并为未来提出建议《增加发育障碍的因素——从遗传学（表观遗传学）的角度》。

• 发表时间: 2010
• 作者: 丹羽明;中畑龍俊;他8名;Kurosawa H.;久保田健夫
• 通讯作者: 久保田健夫

エピジェネテイクス. 増刊号:遺伝子診療学-遺伝子診断の進歩とゲノム治療の展望

表观遗传学特刊：遗传医学 - 基因诊断的进展和基因组治疗的前景

• 作者: 丹羽明;中畑龍俊;他8名;Kurosawa H.;久保田健夫;大堀健太;Kubota T;三宅邦夫
• 通讯作者: 三宅邦夫