RNA-FISH技術を用いた染色体機能異常症のための萌芽的診断法開発研究

利用RNA-FISH技术开发染色体功能障碍探索性诊断方法的研究

• 批准号: 15659252
• 负责人: 久保田 健夫
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: University of Yamanashi
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15659252/
• 关键词: RNA FISH; 染色体機能; 臨床検査; 診断法; SNRRN; XIST; 血液サンプル; Prader-Willi症候群; SNRPN; Pader-Willi症候群

【研究目的】従来の染色体検査では診断できなかった構造変化を認めず機能異常だけを認める染色体異常性疾患、いわゆる「染色体機能異常症」の診断を可能にする染色体検査の開発研究を行った.【平成16年度の研究成果】昨年度の基礎的成果をふまえ、今年度は臨床応用にむけて、染色体異常を有する患者検体を用いての解析をおこなった.1)SNRPNプローブを用いた解析Prader-Willi症候群の責任遺伝子SNRPNのDNAプローブを用いたRNA FISH解析を継続した.その結果、検体の質により、RNAシグナルがはっきりしない症例が存在する場合があった.RNA FISH法を実用的な検査法にするために、検体の質を問わず、安定してSNRPN遺伝子シグナルが検出できることが必要と考えられた.この問題の克服のために、シグナルの高感度増幅法を現在試している.2)XISTプローブを用いた解析不活化X染色体特異的遺伝子XISTのcDNAプローブを用いたRNA FISH解析は、上記のSNRPNゲノムプローブに比べて、発現シグナルが安定して研究することができた.この方法で、46,X,i(Xq)の核型を有する発達障害患者の解析を行った.その結果、正常X染色体からはXIST遺伝子の発現は見られず、XIST発現はi(Xq)染色体からに限られていることが判明した.またi(Xq)染色体上の2か所のXISTはいずれも発現していた.この結果から、この患者において、i(Xq)染色体は選択的に不活化されており、またXIST遺伝子は同一染色体上の他方の同遺伝子の発現産物により不活化されることがないことが示唆された.【本研究の今後の課題】1.SNRPN RNAシグナルの増幅をさらに安定化させる方法を確立すること2.がんの診断応用をふまえて、固形組織においてもRNAシグナルを検出できる方法を確立すること

【 objective 】 to の 従 chromosome 検 check で は diagnosis で き な か っ た structure - the を recognize め ず parafunction だ け を recognize め る chromosome abnormal sexual disorders, い わ ゆ る "abnormal chromosomes function disorder" を の diagnosis may に す る chromosome 検 check の open 発 を line っ た. 【 pp.47-53 16 year の results 】 based the results of yesterday's annual の を ふ ま え, our は" Clinical 応 に む け て, chromosome abnormality を す 検 body を る patients with い て の parsing を お こ な っ た. 1) SNRPN プ ロ ー ブ を with い た parsing Prader - Willi syndrome の responsibility heritage 伝 son SNRPN の DNA プ ロ ー ブ を with い た RNA FISH parsing を 継 続 し た. そ の results, 検 の qualitative に よ り, RNA シ グ ナ ル が は っ き り し な い cases が exist す る occasions が あ っ た. RNA を FISH method be used な 検 check method に す る た め に, 検 の qualitative を asked わ ず, stable し て SNRPN posthumous son 伝 シ グ ナ ル が 検 out で き る こ と が と necessary test え ら れ た. こ の の overcome の た め に, シ グ ナ ル の Gao Gan degree of rights law を now try し て い る. 2) XIST プ ロ ー ブ を with い た parsing the inactive X chromosome specific The 伝 subcarrier XIST is used for <s:1> た cDNAプロ ブを ブを ブを RNA FISH analytical は, written の SNRPN ゲ ノ ム プ ロ ー ブ に than べ て, 発 シ グ ナ ル が settle し て research す る こ と が で き た. こ の way で, 46, X, I (Xq) の karyotype を have す る 発 of handicap of patients の line analytical を っ た. そ の results, normal X chromosome か ら は XIST heritage 伝 son の 発 は now see ら れ ず, XIS T 発 は now I (Xq) chromosome か ら に limit ら れ て い る こ と が.at し た. ま た I (Xq) on chromosome 2 か の is の XIST は い ず れ も 発 now し て い た. こ の results か ら, こ の patients に お い て, I (Xq) chromosome は sentaku に not activate さ れ て お り, ま た XIST heritage 伝 son は の の with the other in the same chromosome Posthumous son 伝 の 発 now product に よ り inactive さ れ る こ と が な い こ と が in stopping さ れ た. 1. の の subject in the future this study 】 【 SNRPN RNA シ グ ナ ル の rights of を さ ら に stabilization さ せ を る method established す る こ と 2. が ん 応 の diagnosis with を ふ ま え て, solid organization に お い て も RNA シ グ ナ ル を 検 out で き を る method established す る こ と

项目成果

Ida et al.: "Functional disorny for Xq22-q23 in a girl with complex rearrangements of chromosomes 3 and X."Am J Med Genet. 120A・4. 557-561 (2003)

Ida 等人：“3 号和 X 号染色体发生复杂重排的女孩中的 Xq22-q23 功能失调。”Am J Med Genet 120A·4 (2003)。

遺伝子疾患の診断に有用な染色体機能異常の検査方法

用于诊断遗传病的染色体异常检测方法

• 发表时间: 2003

ICF syndrome in a girl with DNA hypomethylation but without detectable DNMT3B mutation

• DOI: 10.1002/ajmg.a.30135
• 发表时间: 2004-09-01
• 期刊: AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A
• 影响因子: 2
• 作者: Kubota, T;Furuumi, H;Kajii, T
• 通讯作者: Kajii, T

エピジェネティックス(佐々木裕之編)

表观遗传学（佐佐木博之编辑）

• 发表时间: 2004
• 作者: 久保田健夫;和田敬仁
• 通讯作者: 和田敬仁

Matsumura et al.: "Severe Prader-Willi syndrome with a large deletion of chromosome 15 due to an unbalanced t(15;22)(q14;11.2) translocation."Clinical Genet. 63・1. 79-81 (2003)

Matsumura 等人：“由于不平衡 t(15;22)(q14;11.2) 易位导致 15 号染色体大量缺失的严重 Prader-Willi 综合征。”Clinical Genet 63・1 (2003)。