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遺伝子系図学理論を用いた集団の遺伝的分化の研究

利用遗传谱系理论研究种群遗传分化

基本信息

批准号：
05640702
负责人：
斎藤成也
金额：
$ 1.34万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、遺伝子系図学理論を用いて、以下の3点について解析を行なう計画であった。1.遺伝子系図学の手法を用いて、集団間の遺伝的分化パターンを、理論的に、およびコンピュータシミュレーションを用いて調べる。2.集団間の遺伝的分化パターンを、無限サイトモデルを前提とする遺伝子系図学理論から得られる結果と、従来の無限対立遺伝子モデルに基づく理論から得られる結果とを比較する。3.これらの結果をもとに、塩基配列レベルのDNA多型データを中心とする、実際の遺伝的多型データを分析する。1.この解析は、主として田嶋が担当した。互いに淘汰上中立である対立遺伝子のみを有する遺伝子座を仮定し、そのような複数の遺伝子座における遺伝子系図のふるまいを理論的に解析した。その結果の一部を、Japanese Joumal of Geneticsに掲載予定である。2.この解析は、主として斎藤が担当した。集団間の系統関係をあらかじめ与え、そこから単一の遺伝子座について遺伝子系図を生成するプログラムの開発を行なった。しかし、こうして得られた遺伝子系図に従って進化する、あらかじめ設定した長さの塩基配列を生成し、一定の突然変異率およびその出現確率分布を仮定して、それらの上に塩基置換タイプの突然変異を生じさせるようなプログラムは、現在まだ開発中であり、完成していない。今後、プログラムを完成して、得られる仮想的な遺伝子系統樹から、各集団における遺伝子頻度の仮想データを生成し、無限対立遺伝子モデルにもとづいた集団間の系統関係の解析を行なう計画である。3.この解析は、主として斎藤が担当した。HTLVIウイルスの塩基配列データを分析した結果をVirologyに発表したほか、タンパク多型を中心とする遺伝子頻度データとその分析結果をAnthropological Scienceに発表した。

In this study, the application of genetic subsystem theory, the following three points of analysis and implementation plan 1. The method of genetic research is to use the medium, group and genetic differentiation, theory, and technology to adjust the medium. 2. The results of the theory of genetic differentiation between groups and infinite sets of genetic conditions are compared with those of the theory of genetic differentiation between groups. 3. The results of this analysis are as follows: 1. The analysis of this problem, the main problem and the responsibility of the field. A theoretical analysis of the relationship between genetic diversity and genetic diversity. Japanese Journal of Genetics 2. The analysis of this problem, the main problem and the responsibility of the vine. The systematic relationships between groups are discussed in detail below. In the case of a sub-system, it is necessary to set the length of the sub-system, the generation of a certain abrupt difference rate, and the occurrence of an accurate distribution of the sub-system. In the future, the analysis of system relationships between clusters will be carried out in the following ways: complete the cluster analysis, obtain the cluster analysis subsystem tree, generate the cluster analysis subsystem frequency, and analyze the cluster analysis subsystem. 3. The analysis of this problem, the main problem and the responsibility of the vine. The analysis results of HTLVI's base alignment data are reported in Virology and Anthropological Science.