遺伝子系図学理論を用いた集団の遺伝的分化の研究

利用遗传谱系理论研究种群遗传分化

基本信息

批准号：
05640702
负责人：
斎藤成也
金额：
$ 1.34万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、遺伝子系図学理論を用いて、以下の3点について解析を行なう計画であった。1.遺伝子系図学の手法を用いて、集団間の遺伝的分化パターンを、理論的に、およびコンピュータシミュレーションを用いて調べる。2.集団間の遺伝的分化パターンを、無限サイトモデルを前提とする遺伝子系図学理論から得られる結果と、従来の無限対立遺伝子モデルに基づく理論から得られる結果とを比較する。3.これらの結果をもとに、塩基配列レベルのDNA多型データを中心とする、実際の遺伝的多型データを分析する。1.この解析は、主として田嶋が担当した。互いに淘汰上中立である対立遺伝子のみを有する遺伝子座を仮定し、そのような複数の遺伝子座における遺伝子系図のふるまいを理論的に解析した。その結果の一部を、Japanese Joumal of Geneticsに掲載予定である。2.この解析は、主として斎藤が担当した。集団間の系統関係をあらかじめ与え、そこから単一の遺伝子座について遺伝子系図を生成するプログラムの開発を行なった。しかし、こうして得られた遺伝子系図に従って進化する、あらかじめ設定した長さの塩基配列を生成し、一定の突然変異率およびその出現確率分布を仮定して、それらの上に塩基置換タイプの突然変異を生じさせるようなプログラムは、現在まだ開発中であり、完成していない。今後、プログラムを完成して、得られる仮想的な遺伝子系統樹から、各集団における遺伝子頻度の仮想データを生成し、無限対立遺伝子モデルにもとづいた集団間の系統関係の解析を行なう計画である。3.この解析は、主として斎藤が担当した。HTLVIウイルスの塩基配列データを分析した結果をVirologyに発表したほか、タンパク多型を中心とする遺伝子頻度データとその分析結果をAnthropological Scienceに発表した。

在这项研究中，我们计划使用遗传谱系理论分析以下三点。 1。使用遗传谱系技术研究人群之间的遗传分化模式，无论是理论和使用计算机模拟。 2。将种群之间的遗传分化模式与从基因族谱理论获得的结果与基于传统无限等位基因模型获得的基于理论获得的结果。 3。根据这些结果，分析了实际的遗传多态性数据，主要是基础序列水平的DNA多态性数据。 1。该分析主要由Tajima处理。我们假设仅具有相互选择的等位基因，并且在理论上分析了多个基因座的家谱行为。结果的一部分将在日本的遗传学杂物中发表。 2。该分析主要由saito处理。开发了一个程序，以预先拨入系统发育关系，并为单个基因座生成基因家谱。但是，一个程序生成基本序列的基本序列，这些长度根据以这种方式获得的基因树进化，并在其顶部生成基本替代类型突变，假设当前有一定的突变率和其发生概率的分布，并且未完成。该程序将完成，并且将从获得的虚拟基因系统发育树以及基于无限等位基因模型的种群之间的系统发育关系分析每个人群中的基因频率的虚拟数据。 3。该分析主要由斋藤处理。除了分析HTLVI病毒的基本序列数据的结果外，基因频率数据的结果（主要是蛋白质多态性）在人类学科学中发表。