電子伝達系とカップルする2原子酸素添加酵素のX線結晶構造解析と構造活性相関
電子伝達系とカップルする2原子酸素添加酵素のX線結晶構造解析と構造活性相関
批准号:
10490017
负责人:
三井 幸雄
金额:
$6.78万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 1999
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英文摘要
BphA4(ferredoxin reductase)の結晶構造の決定BphA4-NADH複合体の立体構造を2.6Å分解能で決定した。この結果立体構造のみならずNADHの結合様式もGlutathione reductaseと類似していることが明らかになった。これらの立体構造から、BphA3(ferredoxin)の結合位置やBphA4内の電子伝達の経路に関して新たな知見が得られた(投稿準備中)。BphA4の電子伝達機構に関する知見を得るため、無酸素条件を作り出せる吸光度測定用のセルを作成し、BphA4-NADH複合体の吸収スペクトルの測定を行った。この結果、BphA4は、酸素存在下では、2電子還元型としては安定に存在せず、急速に酸化して酸化型に戻ること、セミキノン型は安定には存在しないことを明らかにした。また、BphA4一分子に対して1分子のNADHが結合し、2電子還元型になることも明らかにした。この2電子還元型のスペクトルは、putidaredoxin reductaseの2電子還元型のものと酷似しており、1次構造から推定される立体構造の類似性を考えあわせると、両蛋白質は同一の機構で電子伝達反応を行うことが強く示唆された。BphA1A2(biphenyl dioxygenase)の構造解析BphA1A2は、PCB分解系中の初発酸化酵素であるBphAの活性部位を構成するコンポーネントで、α_3β_3のサブユニット構成を持っている(分子量約20万)。本年度は、Rhodococcus sp strain RHA1由来のBphA1A2の結晶化条件の最適化を行い、約3Åの回折点を与える結晶を得た(投稿準備中)。この結晶の空間群はP4_12_12で、格子定数は、a=b=139.9Å c=240.2Åであった。この結晶を用いて放射光実験施設(PF)において回折データの収集を行った。また、水銀の重原子同型置換体の作成にも成功している。このため、平成12年度には立体構造を決定できると考えている。
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Tanabe,T.,Tanaka,N.,Nonaka,T.,Mitsui,Y.,Yoshimoto,T.et al.: "Roles of the Ser146,Tyr159 and Lys163n the catalyticaction of 7α-hydroxysteroid dehydrogenase." J.Biochem.(Tokyo). 124. 634-641 (1998)
Tanabe, T.、Tanaka, N.、Nonaka, T.、Mitsui, Y.、Yoshimoto, T. 等人:“Ser146、Tyr159 和 Lys163n 在 7α-羟基类固醇脱氢酶催化作用中的作用 J.Biochem”。 (东京)124。634-641(1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sugimoto,K.,Senda,T.,Aoshima,H.Masai,E.,Fukuda,M.& Mitsui,Y.: "Crystal structure of an aromatic-ring-opening dioxygenase LigAB which is a protocatechuate 4,5-dioxygenase." Structure. (in Press). (1999)
杉本,K.,千田,T.,青岛,H.马西,E.,福田,M.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
三井幸雄、千田俊哉、野中孝昌: "「遺伝」 52巻、7号" X線で見る-生体高分子から生物マシーナリーへ-, 6 (1998)
三井由纪夫、仙田俊哉、野中隆正:“《遗传学》第 52 卷第 7 期”通过 X 射线观察 - 从生物聚合物到生物机械 -,6 (1998)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Fujimoto, K.: "Functionally important residues tyrosine-171 and serine-158 in sepiapterin reductase"Biochim. Biophys. Acta.. 1431(2). 306-314 (1999)
Fujimoto, K.:“墨蝶呤还原酶中功能重要的残基酪氨酸 171 和丝氨酸 158”Biochim。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Sugimoto K.: "Purification and crystallization of a protocatechuate 4,5-dioxygenase LigAB from Sphingomonas pausimobilis SYK-6"Protein and Peptide Lett.. 6. 55-58 (1999)
Sugimoto K.:“来自少动鞘氨醇单胞菌 SYK-6 的原儿茶酸 4,5-双加氧酶 LigAB 的纯化和结晶”蛋白质和肽快报.. 6. 55-58 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 12 条
ノンヘム型の2価鉄イオンを含む2原子酸素添加酵素の超高分解能X線結晶構造解析
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批准号:10129206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
機能探索分子設計の為のアクチビン情報伝達系を構成する蛋白質の立体構造の解明
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批准号:09273218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
超高分解能立体構造解析を目指した蛋白質結晶化方法の開発
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批准号:09878126
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
キセノンガスを利用した普遍的かつ容易な蛋白結晶構造解析法の開発
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批准号:09559005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.89万
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财政年份:1997
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
ノンヘム型の2価鉄イオンを含む-2原子酸素添加酵素の超高分解能X線結晶構造解析
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批准号:09235210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
時間分割ラウエ法利用研究
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批准号:05244101
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$79.17万
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财政年份:1993
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
X線解析で解明された立体構造に基づくインタ-フェロンの制癌活性の構造活性相関
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批准号:03152047
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项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1991
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
X線結晶解析によるalpha,betaーインターフェロン類の基本立体構造の解明
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批准号:01015025
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项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1989
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
プロテアーゼとその蛋白性インヒビターの系から見た酵素蛋白改変の立体精造的基礎
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批准号:63616505
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1988
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
遺伝子工学で量産されたインターロイキン2とβーインターフェロンの立体構造の解明
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批准号:62015022
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项目类别:Grant-in-Aid for Cancer Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1987
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
プロテアーゼとその蛋白性インヒビターの系から見た酵素蛋白攻変の立体構造的基礎
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批准号:62616502
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1987
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
精密結晶構造からタン白質・核酸の動的挙動と機能の解明へ
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批准号:59390009
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项目类别:Grant-in-Aid for Co-operative Research (A)
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资助金额:$4.48万
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财政年份:1984
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
精密結晶構造解析によよセリン・プロテアーゼの作用機構の解明
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批准号:58580099
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1983
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
グアニン特異的リボヌクレアーゼRnase-Stの高分解能X線解析
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批准号:56580102
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.86万
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财政年份:1981
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
多重振動写真法による高分子量酵素及び酵素複合体のX線解析
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批准号:X00120----389013
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$3.14万
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财政年份:1978
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
サブチリシンとそのタン白性インヒビターSSIとの複合体のX線解析
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批准号:X00090----258036
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.8万
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财政年份:1977
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
タン白性プロテアーゼ・インヒビターの特異的阻害機構のX線回折法による研究
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批准号:X00095----167276
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1976
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
タン白性サブチリシン, インヒビターとリボヌクレアーゼ-Sの結晶構造解析
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批准号:X00095----968018
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.22万
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财政年份:1974
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
X線解析のための生体物質-特にタンパク質の結晶化に関する研究
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批准号:X00095----768055
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.22万
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财政年份:1972
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负责人:三井 幸雄
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依托单位:
海外基金