课题基金 / 基金详情

ノンヘム型の2価鉄イオンを含む2原子酸素添加酵素の超高分解能X線結晶構造解析

ノンヘム型の2価鉄イオンを含む2原子酸素添加酵素の超高分解能X線結晶構造解析
含非血红素二价铁离子双加氧酶的超高分辨率X射线晶体结构分析
批准号：
10129206
负责人：
三井 幸雄
金额：
$1.22万
依托单位：
Nagaoka University of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1998 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10129206/
关键词：
ノンヘム鉄ジオキシゲナーゼ立体構造X線結晶構造解析基質特異性

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
1. LigABの立体構造解析LigABは、class IIIのextradiol型dioxygenaseに分類され、我々が過去にその構造を明らかにしてきたclass IIのextradiol型dioxygenaseとは一次構造上の類似性が全く認められない。今回、我々は、世界に先駆けLigABの立体構造を重原子同型置換法により2.2Å分解能で解明することに成功した。その結果、全体構造はClass IIのextradiol型dioxygenaseとは全く異なるが、活性中心の構造は互いに類似していることが明らかになった。その結果、これら2つのclassの酵素は、同一の反応を行うために収束進化をしてきていることが明らかになった。2. PheBの立体構造解析PheBは、Class IIのextradiol型dioxygenaseであるが、既に構造を決定しているBphCとは、基質特異性が異なっていることが知られている。そこで、基質特異性の違いを立体構造的に解明するためにPheBの立体構造解析を行った。PheBの結晶は、非常に薄く、実験室系での回折データ収集は困難であったため、放射光を利用して回折データの収集を行った。立体構造解析は分子置換法によって行った。現在、2.8Å分解能での構造精密化、及び更に高分解能のデータを収集するための実験を行っている。3. BPhC-基質-NOの複合体の構造解析に向けての準備上記の3元複合体の結晶を作成するためには、無酸素状態での実験が不可欠である。そこで、無酸素状態を達成するための装置を作成し、3元複合体結晶や作成の準備を行った。
英文摘要
1. LigABの立体構造解析LigABは、class IIIのextradiol型dioxygenaseに分類され、我々が過去にその構造を明らかにしてきたclass IIのextradiol型dioxygenaseとは一次構造上の類似性が全く認められない。今回、我々は、世界に先駆けLigABの立体構造を重原子同型置換法により2.2Å分解能で解明することに成功した。その結果、全体構造はClass IIのextradiol型dioxygenaseとは全く異なるが、活性中心の構造は互いに類似していることが明らかになった。その結果、これら2つのclassの酵素は、同一の反応を行うために収束進化をしてきていることが明らかになった。2. PheBの立体構造解析PheBは、Class IIのextradiol型dioxygenaseであるが、既に構造を決定しているBphCとは、基質特異性が異なっていることが知られている。そこで、基質特異性の違いを立体構造的に解明するためにPheBの立体構造解析を行った。PheBの結晶は、非常に薄く、実験室系での回折データ収集は困難であったため、放射光を利用して回折データの収集を行った。立体構造解析は分子置換法によって行った。現在、2.8Å分解能での構造精密化、及び更に高分解能のデータを収集するための実験を行っている。3. BPhC-基質-NOの複合体の構造解析に向けての準備上記の3元複合体の結晶を作成するためには、無酸素状態での実験が不可欠である。そこで、無酸素状態を達成するための装置を作成し、3元複合体結晶や作成の準備を行った。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sugimoto,K,Aoshima,H.,Senda,T.,Masai,E,Fukuda,M.& Mitsui,Y: "Purification and crystallization of a protocatecuate 4,5-dioxygenase LigAB from sphingomonas paucimobilis SYK-6" Protein and Peptide Letters. in Press. (1999)
杉本K、青岛H、千田T、马西E、福田M。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Tanabe,T.,Tanaka,N.,Nonaka,T.,Mitsui,Y.,Yoshimoto.,et al.: "Roles of the Ser146,Tyr159 and Lys163 n the catalytic action of 7α-hydroxysteroid dehydrogenase." J.Biochem.(Tokyo). 12423. 634-641 (1998)
Tanabe, T.、Tanaka, N.、Nonaka, T.、Mitsui, Y.、Yoshimoto., et al.：“Ser146、Tyr159 和 Lys163 在 7α-羟基类固醇脱氢酶催化作用中的作用 J.Biochem”。 .（东京）12423.634-641（1998）
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Sugimoto,K.,Senda,T.,Aoshima,H.Masai,E.,Fukuda,M.& Mitsui,Y.: "Crystal structure of an aromatic-ring-opening dioxygenase LigAB which is a protocatechuate 4,5-dioxygenase." Structure. (in Press). (1999)
杉本，K.，千田，T.，青岛，H.马西，E.，福田，M.
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
三井幸雄、千田俊哉、野中孝昌: "「遺伝」 52巻、7号" X線で見る-生体高分子から生物マシーナリーへ-, 6 (1998)
三井由纪夫、仙田俊哉、野中隆正：“《遗传学》第 52 卷第 7 期”通过 X 射线观察 - 从生物聚合物到生物机械 -，6 (1998)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
電子伝達系とカップルする2原子酸素添加酵素のX線結晶構造解析と構造活性相関
  • 批准号：
    10490017
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $6.78万
  • 财政年份：
    1998
  • 负责人：
    三井 幸雄
  • 依托单位：
    Nagaoka University of Technology
機能探索分子設計の為のアクチビン情報伝達系を構成する蛋白質の立体構造の解明
  • 批准号：
    09273218
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $1.28万
  • 财政年份：
    1997
  • 负责人：
    三井 幸雄
  • 依托单位：
    Nagaoka University of Technology
超高分解能立体構造解析を目指した蛋白質結晶化方法の開発
  • 批准号：
    09878126
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $1.22万
  • 财政年份：
    1997
  • 负责人：
    三井 幸雄
  • 依托单位：
    Nagaoka University of Technology
キセノンガスを利用した普遍的かつ容易な蛋白結晶構造解析法の開発
  • 批准号：
    09559005
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $5.89万
  • 财政年份：
    1997
  • 负责人：
    三井 幸雄
  • 依托单位：
    Nagaoka University of Technology
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