Promoter analysis of the interferon regulatory factor 2 and the SNP analysis of the gene

干扰素调节因子2启动子分析及基因SNP分析

基本信息

项目摘要

Interferon regulatory factor 2 (IRF-2) is a transcriptional regulatory protein which represses the expression of interferon-alpha/beta genes. In mice lacking IRF-2, the inflammatory skin disease very similar to human psoriasis develops spontaneously. In addition, IRF-2 gene is located at human chromosome 4q35, where a familial psoriasis susceptibility locus has been mapped. Therefore, we hypothesized the IRF-2 gene is a possible candidate gene for psoriasis.Genotyping of -535G>A was performed by NlaIII-restriction flagment polymorphism (RFLP). Gel-shift and super-shift analysis were employed for the accessment of the binding abilities of transcription factors. To demonstrate differential transcriptional activities, luciferase reporter assays were perforemed.We identified a -535G>A polymorphism in the IRF-2 transcriptional promoter. The -535A allele was more frequent (p= 0.035) in early-onset (less than 41 years of age) psoriasis in Japan, although this was not associated with the old-onset (41 years or older) psoriasis. The -535G allele was found to bind upstream stimulatory factor (USF) by the supershift analysis, whereas the -535A allele did not bind USF. However, the reporter assay revealed no statistical difference of the transcriptional activity between -535A allele and -535G allele. Furthermore, co-transfection of the USF-1 expression vector did not stimulate the promoter activity of our luciferase reporter system.
干扰素调节因子2(Interferon Regulatory Factor 2,IRF-2)是一种抑制干扰素α/β基因表达的转录调节蛋白。在缺乏IRF-2的小鼠中,与人类银屑病非常相似的炎性皮肤病自发发展。此外,IRF-2基因定位于人类染色体4 q35,在那里一个家族性银屑病易感基因已被定位。因此,我们假设IRF-2基因可能是银屑病的候选基因。凝胶位移和超位移分析评价转录因子的结合能力。为了证明不同的转录活性,我们进行了荧光素酶报告基因分析,在IRF-2转录启动子中发现了一个-535G>A多态性。在日本,-535A等位基因在早发性(小于41岁)银屑病中更常见(p= 0.035),尽管这与老年性(41岁或以上)银屑病无关。超移位分析发现-535G等位基因与上游刺激因子(USF)结合,而-535A等位基因不与USF结合。报告基因检测结果显示,-535A和-535G等位基因的转录活性无统计学差异。此外,USF-1表达载体的共转染没有刺激我们的荧光素酶报告系统的启动子活性。

项目成果

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Association of 8PINK5 gene polymorplusms with atopic dermatitis in the Japanese population
8PINK5 基因多态性与日本人群特应性皮炎的关联
  • DOI:
  • 发表时间:
    2003
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kato A;Fukai K et al.
  • 通讯作者:
    Fukai K et al.
Proximal promoter polymorphisms of the IL-4R alpha are associated with psortasis : inverse association pattern compared with atopic dermatitis.
IL-4R α 的近端启动子多态性与牛皮癣相关:与特应性皮炎相比呈负相关模式。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fukai K;Hosomi N et al.
  • 通讯作者:
    Hosomi N et al.
Novel KIT mutations in patients with piebaldism.
花斑症患者的新 KIT 突变。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yokoyama E.;Muto M.;Murakami T et al.
  • 通讯作者:
    Murakami T et al.
Hosomi N, Fukai K, Oiso N, et al.: "Polymorphism in the promoter of the interleukin-4 receptor alpha chain gene are associated with atopic dermatitis in Japan"Journal of Investigative Dermatology. (in press). (2004)
Hosomi N、Fukai K、Oiso N 等人:“白细胞介素 4 受体 α 链基因启动子的多态性与日本特应性皮炎相关”《皮肤病学研究杂志》。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Analysis of KIT, SCF and initial sceening of SLOG genes in patients with piebaldism
花斑症患者KIT、SCF及SLOG基因初筛分析
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hanamoto Y.;et al.;Murakami T et al.;Murakami T et al.
  • 通讯作者:
    Murakami T et al.
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