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NCSおよびNCSモデルハイブリッドの核酸認識と切断機構

NCS和NCS模型杂交体的核酸识别和切割机制

基本信息

批准号：
04220208
负责人：
平間正博
金额：
$ 1.41万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1992
资助国家：
日本
起止时间：
1992 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

(1)第二世代10員環アナログのアルコールは、非常に興味あるpBR322DNA切断活性を示した。その顕著なG塩基選択性は、当初、ラジカル機構によると推定していた。しかし、DNA切断をポリアクリルアミドゲル電気泳動により詳細に検討した結果、アルキル化機構で進行している可能性が高くなった。また、グアノシンとの反応も検討した結果、グアニン部位がトリガーとなって芳香環化した付加体が生成することも分かった。現在、DNAとの付加体が生成するか、するとすればどこで結合するかを精査中である。(2)DNA認識部位として、マイナーグルーブバインダーで、ATに親和性の高いネトロプシンアナログを結合させた新しいハイブリッド分子の合成法を確立した。そのDNA切断活性は、当核研究でこれまでに合成した化合物の中で最強であった。(3)本研究で従来合成した第一、第二世代モデルは、いずれも共役ケトンであった。これではトリガーにより芳香環化しても、生成するビラジカルの片方は、安定なπラジカルである。二個とも活性の高いσラジカルにできれば、ラジカル機構によるDNA切断が促進されると期待された。このでザインに基づき、ケトン部をアルコール誘導体の脱離基とした化合物を数種類合成した。その中で、核酸塩基へのインターカレーター機能を有すると期待される、ネオカルジノスタチンクロモフォアのナフトエートエステルを脱離基とした化合物が、第二世代アルコールより約50倍のDNA切断活性を持つことが分かった。それがどのような塩基(配列)選択性を示すか検索中である。

(1)pBR322 DNA cleavage activity was demonstrated in the second generation of 10-membered rings. The basic characteristics of the system are as follows: DNA cleavage is highly likely to result in detailed analysis of DNA fragmentation mechanisms. The results of the study showed that the formation of aromatic cyclization was not possible. Now, DNA and DNA binding agents are produced, combined, and examined. (2)DNA recognition sites and the establishment of new molecular synthesis methods. DNA cleavage activity is the strongest among compounds in nuclear research. (3)This study was conducted to synthesize the first and second generations of the virus. This is the case with aromatic cyclization, formation, and stabilization. The two enzymes are highly active, and DNA cleavage is promoted by the enzyme. A number of compounds were synthesized from these compounds. In addition, the DNA cleavage activity of the nucleic acid base is about 50 times higher than that of the second generation. The selection of the base (arrangement) is indicated in the search.