L-Mafを中心とした転写因子のX線構造生物学的研究

以L-Maf为中心的转录因子的X射线结构生物学研究

• 批准号: 09277216
• 负责人: 箱嶋 敏雄
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09277216/
• 关键词: bZIP; bHLH; DNA結合モチーフ; 塩基配列; 分子認識; 構造生物学

1)PHO4-DNA複合体結晶酵母由来のリン酸代謝系の転写因子PHO4のDNA結合ドメインとその認識配列DNA(PHO5遺伝子のUASp2)との複合体の結晶構造を分解能2.8Åで決定し、EMBO.J(1997)に発表した。従来のbHLHモチーフでは見られなかった第三のヘリックスがループ部分に存在すること、及び、E-boxと呼ばれるbHLHの認識する共通配列(CACGTG)に続く3'-側の2塩基対を余分に認識していることを発見した。ホモ二量体の非対称認識を示す最初の例である。2)Papl-DNA複合体結晶また、分裂酵母由来のAP-1様転写因子PaplのDNA結合ドメインとDNAオリゴマーとの高分解能(2Å以上)複合体結晶を作成して、MIRより位相決定した。bZIPの認識する共通配列はAP-1及びATF/CREBサイトに大別されるが、Papl(認識配列TAACGTTA)などの幾つかのbZIP転写因子はこれとは異なる種々の配列を認識することが知られており、その認識メカニズムは不明であった。本構造はこの非共通配列をもつ複合体の最初の解析例であり、塩基認識の多様性について新しいパラダイムを提出できる可能性がある。3)IRF2-DNA複合体結晶更に、マウス由来の転写因子IRF-2のDNA結合ドメインとDNAオリゴマーとの複合体結晶を、MIR-MRより位相決定した。IRF-2は繰り返し配列にタンデムに結合しており、IRF-1/DNA結晶で報告されているような大きなDNAの湾曲が局所的には存在するもの、分子全体としては互いに打ち消し合っていることが明らかになった。これらのPapl/DNAとIRF-1/DNAの複合体は、現在、更に構造精密化中である。

1) The crystal structure of PHO4-DNA complex was determined by the decomposition energy of 2.8 ℃, EMBO.J(1997). The recent bHLH monitor has been found to exist in the third connector part of the phone, and it is also revealed that the E-box and the call bHLH common configuration (CACGTG) have a clear understanding of the remaining 2 bases on the 3'-side. An initial example of the asymmetric understanding of two quantities 2)Papl-DNA Complex Crystallization, Splitting Yeast Originated AP-1 DNA Binding Factor Papl DNA Binding Factor DNA Separation and High Decomposition Energy (2 +) Complex Crystallization Preparation, MIR Phase Determination bZIP's common arrangement is AP-1 and ATF/CREB's arrangement is unknown, Papl(knowledge arrangement TAACGTTA) is unknown. This structure is based on the initial analysis of the non-common arrangement of the complex. 3)IRF-2-DNA complex crystal change, MIR-MR-phase determination of the origin of the writing factor IRF-2 DNA binding factors IRF-2 is a complex molecule that binds to the DNA sequence and is present in the DNA sequence. IRF-1/DNA crystallisation reports that the DNA sequence exists in the DNA sequence. Papl/DNA complex IRF-1/DNA complex is now being refined.

项目成果

M.Kato: "Insights into multistep phosphorelay from the crystal structure" Cell. 88・5. 717-723 (1997)

M.Kato：“从晶体结构洞察多步磷光继电器”Cell 88・5。

T.Shimizu: "Crystal Structure of PHO4 bHLH domain-DNA complex" EMBO Journal. 16・15. 4689-4697 (1997)

T.Shimizu：“PHO4 bHLH结构域-DNA复合物的晶体结构”EMBO杂志16・15（1997）。

S.Kuge: "Use of a fusion protein to obtain well-ordered crystal" Protein Science. 6・8. 1783-1786 (1997)

S.Kuge：“使用融合蛋白获得有序晶体”《蛋白质科学》6·8（1997）。

T.Kishi: "Crystallization and preliminary X-ray studies of neuropsin" Journal of Stuctural Biology. 118. 248-251 (1997)

T.Kishi：“神经蛋白酶的结晶和初步 X 射线研究”结构生物学杂志。

箱嶋敏雄: "薬学の進歩13" 薬学研究奨励財団, 143 (1997)

Toshio Hakoshima：《药学进展 13》药物研究基金会，143（1997）