膜貫通型プロテアーゼの細胞骨格への連結の構造的基礎

连接跨膜蛋白酶与细胞骨架的结构基础

基本信息

  • 批准号:
    19036014
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2007 至 2008
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

精製した組み替え型radixinのFERMドメイン(残基1-310)と一回膜貫通型I型膜タンパク質プロテアーゼMT1-MMP(membrane-typel 1 matrix metalloproteinase)の細胞質テールの合成ペプチド(20残基)との複合体を, 結晶化ロボット(HYDRA-II)を用いることで, 結晶化に成功した(a=b=122.7, c=128.3Å, P6_122、非対称単位に1複合体).SPring-8での放射光実験により, 2.4ÅのX線強度データを収集した. その後, 通常のMR法により位相決定して, 最終的にR_<work>=0.252/R_<free>=0.292までCNSとREFMACを用いて構造の精密化を行った.得られたFERM-MT1-MMP複合体結晶中では, ペプチドの両親媒性領域は、FERMドメインのサブドメインAのβ2A-鎖と反平行β-β相互作用をしており, 疎水性残基がサブドメインAのくぼみにはまり込んでいた. この相互作用は, サブドメインCに結合する従来のICAM-2やCD44などの膜タンパク質と全く異なるものであった. この新事実は, ERMタンパク質が, FERMドメインを介して, MT1-MMPに結合するとともに, その基質である接着分子CD44とも結合できることを示唆している.上記の研究結果を踏まえ, 現在, 論文を作成中であり, 学術雑誌に投稿予定である.
Refined radixin type FERM (residues 1-310) and one-pass membrane penetration type I membrane type radixin MT1-MMP (membrane-type 1 matrix Metalloproteinase) Cytoplasmic Synthetic Synthesis (20 Residues) Synthetic Complex, Crystallized Hydra-II (HYDRA-II) Used, Crystallization was successful (a=b=122.7, c=128.3Å, P6_122, asymmetric unitary 1 complex). The X-ray intensity of 2.4Å is collected and collected. After that, the usual MR method is used to determine the phase. The final R_<work>=0.252/R_<free>=0.292 CNS and REFMAC were constructed using a precision structure and the resulting FERM-MT1-MMP complex was crystallized. FERM compatibility field, The water-based residue of the water-based residue is the water-based residue. このInteractionは, サブドメインCにcombinationする従来のICAM-2やCD44などの片タンパクqualityと全くdifferentなるものであった.この新事実は, ERMタンパクqualityが, FERMドメインを开して, MT1-MMPにcombinationするとともに, The substrate is then combined with the molecule CD44 and the binding is done. The above research results are recorded. Now, the paper is being prepared. Submissions for academic journals are pending.

项目成果

期刊论文数量(28)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structure of a novel membrane-targeting domain found in Rac GEF Tiam1/2
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mukai;Y.;et.al.;Toshio Hakoshima
  • 通讯作者:
    Toshio Hakoshima
Structural basis for neutral endopeptidas 24.11 recognition by ERM proteins
ERM 蛋白识别中性内肽 24.11 的结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤博幸;根本航;伊藤隆;古川貴章;由縣ゆり子;A. Naito;Toshio Hakoshima
  • 通讯作者:
    Toshio Hakoshima
血管収縮阻害剤: Rhoキナーゼの構造と機能
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    合田圭吾
  • 通讯作者:
    合田圭吾
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Machida;R.J.;Y.Hashiguchi;M.Nishida;S.Nishida.;河村正二;村上 聡;箱嶋敏雄
  • 通讯作者:
    箱嶋敏雄
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  • 项目类别:
ERM proteins and cell morphology in the retina
视网膜中的 ERM 蛋白和细胞形态
  • 批准号:
    RGPIN-2018-05756
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 3.9万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
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