膜貫通型プロテアーゼの細胞骨格への連結の構造的基礎
连接跨膜蛋白酶与细胞骨架的结构基础
基本信息
- 批准号:19036014
- 负责人:
- 金额:$ 3.9万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
精製した組み替え型radixinのFERMドメイン(残基1-310)と一回膜貫通型I型膜タンパク質プロテアーゼMT1-MMP(membrane-typel 1 matrix metalloproteinase)の細胞質テールの合成ペプチド(20残基)との複合体を, 結晶化ロボット(HYDRA-II)を用いることで, 結晶化に成功した(a=b=122.7, c=128.3Å, P6_122、非対称単位に1複合体).SPring-8での放射光実験により, 2.4ÅのX線強度データを収集した. その後, 通常のMR法により位相決定して, 最終的にR_<work>=0.252/R_<free>=0.292までCNSとREFMACを用いて構造の精密化を行った.得られたFERM-MT1-MMP複合体結晶中では, ペプチドの両親媒性領域は、FERMドメインのサブドメインAのβ2A-鎖と反平行β-β相互作用をしており, 疎水性残基がサブドメインAのくぼみにはまり込んでいた. この相互作用は, サブドメインCに結合する従来のICAM-2やCD44などの膜タンパク質と全く異なるものであった. この新事実は, ERMタンパク質が, FERMドメインを介して, MT1-MMPに結合するとともに, その基質である接着分子CD44とも結合できることを示唆している.上記の研究結果を踏まえ, 現在, 論文を作成中であり, 学術雑誌に投稿予定である.
重组放射素的纯化FERM结构域(残基1-310)与单跨膜型1基质金属蛋白酶(MT1-MMP)的胞质尾部与细胞质尾部的复合物成功地使用结晶化机器人(hydra-ii)(A = b = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 122.7,c = 128.3。非对称单位)。通过同步加速器辐射实验在春季-8中收集2.4Å的X射线强度数据。之后,通过常规MR方法确定阶段。最后,使用CNS和REFMAC对结构进行了完善,直到R_ <工作> = 0.252/r_ <free> = 0.292。在由此产生的FERM-MT1-MMP复合物晶体中,肽的两亲性区域与FERM结构域的亚域A的β2A链具有反平行的β-β相互作用ERM蛋白可以通过FERM结构域与MT1-MMP结合,也可以与粘附分子CD44结合,即底物。根据上述研究的结果,目前正在创建一篇论文,并将提交给学术期刊。
项目成果
期刊论文数量(28)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Machida;R.J.;Y.Hashiguchi;M.Nishida;S.Nishida.;河村正二;村上 聡;箱嶋敏雄
- 通讯作者:箱嶋敏雄
P-loop pliability of Rho-kinase for inhibitor binding.
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- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Gohda;K.
- 通讯作者:K.
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- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:藤博幸;根本航;伊藤隆;古川貴章;由縣ゆり子;A. Naito;Toshio Hakoshima
- 通讯作者:Toshio Hakoshima
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- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Mukai;Y.;et.al.;Toshio Hakoshima
- 通讯作者:Toshio Hakoshima
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榛葉繁紀
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