嫌気的条件センサー蛋白質の結晶学的研究

厌氧条件传感器蛋白的晶体学研究

• 批准号: 08249225
• 负责人: 箱嶋 敏雄
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08249225/
• 关键词: マグネシウムイオン; 亜鉛イオン; リン酸化; ヘム蛋白質; DNA; センサー蛋白質; 二成分系; 構造生物学

A)嫌気的条件センサー蛋白質ArcBにおける蛋白質リン酸化を中心としたリン酸転移反応におけるHis、Asp及び金属イオンの役割大腸菌由来の嫌気的条件センサー蛋白質ArcBのドメイン構成は複雑であり、N末端側から、アンカー部分、受容体ドメイン、HPK(ヒスチジン蛋白質キナーゼドメイン)ドメイン、分子内レシ-バ・ドメイン、そしてもう一つのヒスチジンを含むリン酸転移(HPt)ドメインをもつ。ここではATPからのHPKドメインへの自己リン酸化に続いて、分子内レシ-バ・ドメイン、HPtドメインそして標的レギュレータ蛋白質のレシ-バ・ドメインへの複雑なリン酸転移が起こる。本年度世界に先駆けて構造決定したArcBのHPtドメインの活性部位を詳述し、レシ-バ・ドメインとの関係を考察した。B)ヘムをもつ転写因子CooAの大量精製と結晶化の試み第4班班員である青野重利博士が単離し、精力的に分子生物学的、生化学的、および分光学的解析を推進されている光合成細菌由来のCooAは一酸化炭素センサーとしてのヘムをもつ珍しい転写因子である。この三次元構造を明らかにする目的で大量精製系を確立した。現在、酸化型CooAの結晶化を試みている。また、還元型、及び一酸化炭素結合型CooAの大量調整と結晶化実験系の確立を努力している。C)DNAと金属イオンとの相互作用Z-DNA結晶は1.2Aから1.0Aに及ぶ高分解能のX線回折データを与えるので、金属イオンや溶媒分子とDNAとの相互作用を精密の解析するのに最適である。今回、スペルミジン及びサーモスペルミン(高度高熱菌由来)を含む結晶の高精度構造解析を行い、六配位に水和したマグネシウムイオンと核酸塩基およびリン酸との相互作用を明らかにした。

A) the condition of disrelish: protein, ArcB, protein, acidizing center, acid transfer, His, Asp and metal, the origin of the bacteria, the protein, the ArcB, the protein, the replicator, the N-terminal, the acceptor, the acceptor. HPK (protein protein), intramolecular (intramolecular), intramolecular (HPt), intramolecular (intramolecular), intramolecular (intramolecular) and intramolecular (intramolecular). "ATP", "HPK", "self-acidify", "intramolecular", "intramolecular", "protein", "acid transfer". This year, the world has decided that the active parts will be ArcB, HPt, active, and active parts of the world. B) in order to improve the origin of photosynthetic bacteria, a large number of fine writing factors CooA were isolated from Dr. Shigei Amano in Class 4, molecular biology, biochemistry, and spectrooptics. the origin of photosynthetic bacteria was improved by the analysis of molecular biology, biochemistry, and spectrooptics. the source of photosynthetic bacteria was CooA. The purpose of the three-dimensional design is to ensure that a large number of fine materials are established. At present, acidified CooA crystals have been crystallized. A large number of crystallization systems of ferrous, carbon-based, and acidified carbon-combined CooA are responsible for making sure that they are working hard. C) DNA metal alloy interaction Z-DNA crystal 1.2A, X-ray diffraction 1.0A and high decomposition energy X-ray analysis of the interaction between metal and metal molecules, the interaction of solvent molecules, the precise analysis, the most accurate analysis. This time, it contains the results of high-precision analysis, six-coordination water and high-precision chemical analysis of nucleic acids, nucleic acids and acids.

项目成果

M.Kato: "Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of a Histidine Kinase Domain of the Anaerobic Sensor Protein ArcB from Escherichia coli." Acta Crystallogr.D52・6. 1214-1215 (1996)

M.Kato：“大肠杆菌厌氧传感器蛋白 ArcB 的组氨酸激酶结构域的结晶和初步 X 射线分析。Acta Crystallogr.D52·6 (1996)”

H.Ohishi: "Interaction between the left-handed Z-DNA and polyamine-2:The crystal structure of the d(CG)_3 and spermidine complex." FEBS Lett.391. 153-156 (1996)

H.Ohishi：“左手 Z-DNA 和多胺 2 之间的相互作用：d(CG)_3 和亚精胺复合物的晶体结构。”

H.Ohishi: "Interaction between the left-handed Z-DNA and polyamine-3:The crystal structure of the d(CG)_3 and thermospermine complex." FEBS Lett.398. 291-296 (1996)

H.Ohishi：“左手 Z-DNA 和多胺 3 之间的相互作用：d(CG)_3 和热精胺复合物的晶体结构。”

M.Kato: "Insights into multi-step phosphorelay from the crystal structure of the C-terminal HPt domain of ArcB." Cell. 88・5. 717-723 (1997)

M.Kato：“从 ArcB C 端 HPt 结构域的晶体结构洞察多步磷光继电器。”88・5 (1997)。