癌細胞の浸潤・転移関連RacGEFと細胞接着分子の構造生物学

RacGEF和细胞粘附分子与癌细胞侵袭和转移相关的结构生物学

• 批准号: 20011006
• 负责人: 箱嶋 敏雄
• 金额: $ 6.34万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20011006/
• 关键词: 浸潤; 転移; 細胞接着; 膜裏打ち; GEF

1) ERMタンパク質とMT1-MMPとの相互作用昨年度に決定したMT1-MMPの細胞内領域とFERMドメインとの複合体構造に基づいて,ビオチン化したペプチドを用いた結合領域の限定や厳密で定量的な結合実験を,BIAcoreを用い手検討して論文作成の準備を進めた.2) Tiam1/Tiam2の結晶構造Tiam1/Tiam2のPHCCExドメインの結晶構造に基づいて,結合タンパク質であるCD44、Par3,JIP2,あるいはephrin B1,2,3やNMDA受容体との相互作用部位の特定の結合実験を行った.その結果,酸性残基に富む2つの配列モチーフを発見した.また,PHCCExドメイン表面の塩基性残基の一連の変異実験をして,CD44などの標的タンパク質の結合部位を同定した.更に,培養細胞を用いたin vivoでの実験で,相互作用の重要性を確認した.これらの成果をまとめて論文を作成して出版した.3) Tiam1/Tiam2-CD44、-Par3,-JlP2複合体の結晶化と構造解析上記の結晶構造研究に用いたTiam1やTiam2のPHCCExドメインと,標的タンパク質であるCD44、Par3,JIP2,あるいはephrin B1,2,3との複合体の結晶化を試みた.タンパク質比,タンパク質濃度,温度等も変化させながら,現有ロボット(HYDRA-II)を使って大規模なスクリーニングを試みたが,構造解析に用いられる結晶は得られなかった.

1) ERM タ ン パ ク qualitative と MT1 MMP - と の interaction yesterday annual に decided し た MT1 MMP - field の cell と FERM ド メ イ ン と の complex tectonic に base づ い て, ビ オ チ ン change し た ペ プ チ ド を with い た combining domain の limit や 厳 dense で quantitative な combined be 験 を, BIAcore を 検 with い hand please し て paper is made の prepare を into め た. 2) Tiam1 / Tiam2 の crystal structure Tiam1 / Tiam2 の PHCCEx ド メ イ ン の crystal structure に base づ い て, combining タ ン パ ク qualitative で あ る CD44, Par3, JIP2, あ る い は ephrin B1, 2, 3 や NMDA by let body と の の の combining specific interaction parts be 験 を line っ た. そ の results, acid residue に rich む 2 つ の match column モ チ ー フ を 発 see し た. ま た, PHCCEx ド メ イ ン surface の salt basic residues の for の - vision be 験 を し て, CD44 な ど の mark タ ン パ ク qualitative の combining site を with fixed し た. More に, culture cell を with い た in vivo で の be 験 で, interaction の importance を confirm し た. こ れ ら の results を ま と め を て paper made し て publishing し た. 3) Tiam1 / Tiam2 -- CD44, Par3, - JlP2 complex の crystallization と に structure analysis on record の crystallization research with い た Tiam1 や Tiam2 の PHCCEx ド メ イ ン と, mark タ ン パ ク qualitative で あ る CD44, Par3, JIP2, あ る い は ephrin B1, 2, 3 と の complex の crystallization を try み た. タ ン パ ク mass ratio, タ ン パ ク mass concentration, temperature and other も variations change さ せ な が ら, existing ロ ボ ッ ト (HYDRA - II) を make っ て large-scale な ス ク リ ー ニ ン グ を try み た が, tectonic analytical に with い ら れ る crystallization は must ら れ な か っ た.

项目成果

A molecular mechanism of P-loop pliability of Rho-kinase investigated by molecular dynamic simulation

• DOI: 10.1007/s10822-008-9214-7
• 发表时间: 2008-04
• 期刊: Journal of Computer-Aided Molecular Design
• 影响因子: 3.5
• 作者: K. Gohda;T. Hakoshima

Structural basis of the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD43 and its binding to ERM proteins.

• DOI: 10.1016/j.jmb.2008.05.085
• 发表时间: 2008-09
• 期刊: Journal of molecular biology
• 影响因子: 5.6
• 作者: Y. Takai;K. Kitano;S. Terawaki;R. Maesaki;T. Hakoshima

Mechanism of gibberellin perception and DELLA protein recognition by the Arabidopsis gibberellin receptor

拟南芥赤霉素受体对赤霉素的感知和DELLA蛋白识别的机制

• 发表时间: 2009
• 作者: Murase;K.;Hirano;Y.;Sun;T.P.;Hakoshima;T.
• 通讯作者: T.

溶液NMR法によるRho-kinaseのスプリットPHドメインの高次構造解析

使用溶液 NMR 方法对 Rho 激酶的拆分 PH 结构域进行高阶结构分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Tsuda K;Furuta N;Inaba H;Kawai S;Hanada K;Yoshimori T;Amano A.;中村哲也;佐藤明子
• 通讯作者: 佐藤明子

RacGEF Tiam1/2の新規なタンパク質標的認識ドメインの構造

RacGEF Tiam1/2 新型蛋白质靶标识别结构域的结构

• 发表时间: 2008
• 作者: Machida;R.J.;Y.Hashiguchi;M.Nishida;S.Nishida.;河村正二;村上 聡;箱嶋敏雄
• 通讯作者: 箱嶋敏雄