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SRP RNA間での構造比較に基づく枯草菌scRNAの機能ドメインの解析

SRP RNA間での構造比較に基づく枯草菌scRNAの機能ドメインの解析
基于SRP RNA结构比较的枯草芽孢杆菌scRNA功能域分析
批准号：
06258201
负责人：
中村 幸治
金额：
$1.79万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1994
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1994 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06258201/
关键词：
scRNAシグナル認識粒子RNARNA結合蛋白質枯草菌RNA結合モチーフFfh

项目摘要

项目成果

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(1)真正細菌内でのscRNAの構造解析.真正細菌内でのscRNAの構造解析の結果、現在までに構造が明らかにされた10属の真正細菌の中で、完全なドメインI,II構造を持つものは芽胞形成能を持つ枯草菌とウェルシュ菌の2属に限られることが明らかとなった。(2)scRNAの生体内での局在とscRNPの精製.ショ糖密度勾配遠心法で解析したところ、scRNPは10Sの沈降係数を示した。scRNPを精製したところ、scRNPには、Ffh蛋白質に加えて、72kDaと8kDaの蛋白質が含まれていることが示された。(3)scRNA結合蛋白質FfhのRNA結合モチーフの検索.Ffh蛋白質は、哺乳類のSRP RNAに結合するSRP54蛋白質と相同性を持ち、大腸菌や他の真正細菌にも存在する。Ffh蛋白質のRNA結合ドメインを解析したところ、C末端に3カ所存在する両親媒性のa-ヘリックス構造のうち、2番目と3番目を含む領域にRNA結合領域が存在することが明らかとなった。(4)scRNAの生体内の機能解析.枯草菌においてscRNAを欠損した場合、速やかに蛋白質合成阻害が起こるが、この時、野性株と比べて、抗生物質フシジン酸に対しての抵抗性を示した。また、形態的には、細胞壁が肥沃し、湾曲した構造を示した。また、低濃度のフシジン酸に対して抵抗性を示した。従って、枯草菌scRNAは蛋白質合成に関し、EF-Gの機能と関連した役割を持っている可能性が示唆された。以上の結果から、scRNAは生体内では、蛋白質合成と分泌蛋白質の細胞外への分泌の少なくとも2つの過程に関与していると考えられる。
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会议论文
未来型バイオプロスペクティングの技術創成のための企画調査
  • 批准号：
    17638003
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.24万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    中村 幸治
  • 依托单位：
    University of Tsukuba
枯草菌における非翻訳型RNAによる遺伝子発現制御ネットワーク解析
  • 批准号：
    16013205
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.12万
  • 财政年份：
    2004
  • 负责人：
    中村 幸治
  • 依托单位：
    University of Tsukuba
グラム陽性細菌における非翻訳型RNAによる転写制御機構の解析
  • 批准号：
    15030202
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.1万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    中村 幸治
  • 依托单位：
    University of Tsukuba
枯草菌非翻訳型RNAによる遺伝子発現制御ネットワーク解析
  • 批准号：
    15013205
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.16万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    中村 幸治
  • 依托单位：
    University of Tsukuba
海外基金