遺伝的ブロック単位の探索と、その重合化によるタンパク質立体構造再構築の試み

寻找遗传块单元并尝试通过聚合重建蛋白质三维结构

基本信息

  • 批准号:
    09261242
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.09万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1997
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1997 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

タンパク質の構築原理の問題に迫るアプローチの1つとして、試験管内タンパク質創成系実験を用いた構成的な研究アプローチが考えられる。前述したように、現存するタンパク質・遺伝子の観察からは、「繰り返し」が重要な意味を持つらしいことが示唆される。では、単一の遺伝的ブロック単位を単純に「繰り返す」ことから、タンパク質・遺伝子らしきものが試験管の中で発生するのであろうか?マイクロ遺伝子重合法を用いた方法からこの問題にアプローチした。これは、DNAポリメラーゼがもつDNA連結反応を利用したもので、1対のオリゴヌクレオチドとDNAポリメラーゼを用いたサイクル反応からなる簡単な反応系である。1対のオリゴヌクレオチドは、それらのプライマーダイマーがマイクロ遺伝子配列を再構成するように、互いの3′領域で相補塩基対を形成するようにデザインしておく。オリゴヌクレオチドの3′末端にミスマッチ塩基を付加しておくことが、効率よくMPRを進行させるポイントとなる。サイクル反応の後、マイクロ遺伝子の重合した巨大DNAが得られるが、マイクロ遺伝子の連結部には、ランダムに塩基の欠失・挿入がおこるため、得られたDNAは分子多様性集団としての性質をもつ。すなわち、このようなマイクロ遺伝子重合体から翻訳されるタンパク質は、マイクロ遺伝子のもつ複数の読み枠のコンビナトリアルな重合体産物となる。種々の長さ、組成をもつマイクロ遺伝子を出発材料とし、これらを重合して得られたNDAライブラリー大腸菌の中で産出するタンパク質をいくつか調べた。その中の1つ、クローン320は、CD測定から、2次構造を形成していることが示唆された。「繰り返し」を制約文法にすることによって、自然のタンパク質に似た人工タンパク質が意外と簡単に試験管の中で創発するのかもしれない。
タ ン パ ク qualitative の constructing principle の problems forced に る ア プ ロ ー チ の 1 つ と し て, test tube タ ン パ ク mass into constructing system be 験 を with い た な consisting of research ア プ ロ ー チ が exam え ら れ る. The foregoing し た よ う に, existing す る タ ン パ ク quality, heritage 伝 son の 観 examine か ら は, "Qiao り return し" が important な mean を hold つ ら し い こ と が in stopping さ れ る. で は, 単 の but 伝 ブ ロ ッ ク 単 a を 単 pure に "Qiao り return す" こ と か ら, タ ン パ ク quality, heritage 伝 son ら し き も の が test tube の で 発 raw す る の で あ ろ う か? を マ イ ク ロ posthumous son 伝 superposition method with い た method か ら こ の problem に ア プ ロ ー チ し た. こ れ は, DNA ポ リ メ ラ ー ゼ が も つ DNA link against 応 を using し た も の で, 1 の seaborne オ リ ゴ ヌ ク レ オ チ ド と DNA ポ リ メ ラ ー ゼ を with い た サ イ ク ル anti 応 か ら な る Jane 単 な anti 応 department で あ る. 1 の seaborne オ リ ゴ ヌ ク レ オ チ ド は, そ れ ら の プ ラ イ マ ー ダ イ マ ー が マ イ ク ロ heritage 伝 with sequence を reconstitution す る よ う に, mutual い の で phase 3 'field repair salt formed を seaborne す る よ う に デ ザ イ ン し て お く. オ リ ゴ ヌ ク レ オ チ ド の 3 'end に ミ ス マ ッ チ salt base pay plus し を て お く こ と が, sharper rate よ く MPR を for さ せ る ポ イ ン ト と な る. , after サ イ ク ル anti 応 の マ イ ク ロ posthumous son 伝 の overlap し た huge DNA が ら れ る が, マ イ ク ロ posthumous son 伝 の link department に は, ラ ン ダ ム に salt base の owe loss, scions into が お こ る た め, ら れ た は DNA molecules with multiple others set 団 と し て の nature を も つ. す な わ ち, こ の よ う な マ イ ク ロ heritage 伝 son returns fit か ら turn 訳 さ れ る タ ン パ ク は, マ イ ク ロ posthumous son 伝 の も つ plural の 読 み 枠 の コ ン ビ ナ ト リ ア ル な heavy fit product と な る. Kind of 々 の long さ, composition を も つ マ イ ク ロ heritage 伝 son を 発 material と し, こ れ ら を overlap し て must ら れ た NDA ラ イ ブ ラ リ ー coliform の で す output in る タ ン パ ク qualitative を い く つ か adjustable べ た. In the そ そ, the determination of <s:1> 1 そ, ロ ロ ロ ロ ロ 320 された, CD, ら ら, secondary structure を forms <s:1> て る る る とが とが とが indicating された. "Qiao り return し" を restricted grammar に す る こ と に よ っ て, natural の タ ン パ ク qualitative に like た artificial タ ン パ ク が quality accident と Jane 単 に test tube の で gen 発 す る の か も し れ な い.

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
芝 清隆: "遺伝子を創る-遺伝子誕生の謎に分子進化工学が迫る" 科学. 938-947 (1977)
Kiyotaka Shiba:“创造基因 - 分子进化工程接近基因诞生之谜”《科学》938-947 (1977)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
K.Shiba, H.Motegi et al.: "Maintaining genetic code through adaptations of tRNA synthetases to taxonomic domains" Trends Biochem.Sci.22. 453-457 (1977)
K.Shiba、H.Motegi 等人:“通过 tRNA 合成酶适应分类域来维持遗传密码”Trends Biochem.Sci.22。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
K.Shiba.: "In vitro constructive approchaes to the origin of cooding seqeuences" J.Biochem.& Mol.Biol.(印刷中). (1988)
K. Shiba.:“编码序列起源的体外构建方法”J.Biochem.& Mol.Biol(印刷中)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
芝 清隆: "アミノアシルtRNA合成酵素から見たゲノム形成のダイナミクス" 細胞工学. (印刷中).
Kiyotaka Shiba:“从氨酰基-tRNA 合成酶的角度来看基因组形成的动力学”《细胞工程》(正在出版)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
芝 清隆: "試験管の中での遺伝子の誕生" アカデミア. 173. 34-44 (1988)
Kiyotaka Shiba:“试管中基因的诞生”学术界 173. 34-44 (1988)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

芝 清隆其他文献

モチーフ・プログラミング~複数種マイクロ遺伝子のコンビナトリアル重合から機能性人工タンパク質を創る~
基序编程〜通过多个微基因的组合聚合创建功能性人工蛋白质〜
ヒト唾液由来エクソソームと細胞株由来エクソソームの比較
人唾液来源的外泌体和细胞系来源的外泌体的比较
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山本恵史;岩井千弥;吉田光孝;南澤宝美后;松村幸子;芝 清隆;矢島安朝
  • 通讯作者:
    矢島安朝
細胞外ベシクル(エクソソーム)のグラファイト、マイカ基板等への吸着とAFMによる評価
石墨、云母基材等细胞外囊泡(外泌体)的吸附及AFM评价
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    松村 幸子;南澤 宝美后;菅 加奈子;芝 清隆
  • 通讯作者:
    芝 清隆
ナノ粒子を利用したエクソソームサブタイプの簡便な検出法の開発
使用纳米粒子开发外泌体亚型的简单检测方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    松村幸子;南澤宝美后;市川雄貴;芝 清隆
  • 通讯作者:
    芝 清隆
ホスファチジルセリンの露出の異なる細胞外ベシクルサブタイプ
磷脂酰丝氨酸暴露量不同的细胞外囊泡亚型
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    松村幸子;南澤宝美后;菅 加奈子;芝 清隆
  • 通讯作者:
    芝 清隆

芝 清隆的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('芝 清隆', 18)}}的其他基金

Differentiation of EVs using artificial proteins and immune assay
使用人工蛋白和免疫测定来分化 EV
  • 批准号:
    23K05774
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
人工タンパク質を用いた低エネルギー型ナノ無機材料形成システムの確立
利用人工蛋白质建立低能纳米无机材料形成系统
  • 批准号:
    21651058
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
人工タンパク質の技術開発
人工蛋白质技术开发
  • 批准号:
    17012026
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シンセティックアプローチによる生物システム形成原理の探求
使用合成方法探索生物系统形成的原理
  • 批准号:
    16011262
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
プロテオームが忌避する配列をもつ人工タンパク質の示す免疫原性能力の調査
研究具有被蛋白质组排斥的序列的人工蛋白质的免疫原性潜力
  • 批准号:
    13878137
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
ゲノム生物学から抽出される知識をタンパク質上に人為再構成するシステムの構築
构建将基因组生物学提取的知识人工重建到蛋白质上的系统
  • 批准号:
    13202069
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
ヒトアミノアシルtRNA合成酵素活性の酵素間相互作用依存性
人氨酰-tRNA合成酶活性的酶-酶相互作用依赖性
  • 批准号:
    12029222
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
バキュロウイルス多重感染系を用いた翻訳装置超高分子複合体の再構成
使用杆状病毒多重感染系统重建翻译装置超分子复合物
  • 批准号:
    11169243
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
繰り返し構造単位の探索と、繰り返しにより作成された人工タンパク質の性質解析
寻找重复结构单元以及通过重复产生的人工蛋白质的性质分析
  • 批准号:
    10157228
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
マイクロ遺伝子重合法を用いた人工バイオシグナル分子創出系の確立
利用微基因聚合方法建立人工生物信号分子产生系统
  • 批准号:
    10878115
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research

相似海外基金

タイトジャンクションの多様性構築原理の解明
阐明紧密连接中构建多样性的原理
  • 批准号:
    24K09458
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
放射線誘発DNA二本鎖切断部位近傍における修復ナノドメインの構築原理と機能解明
阐明辐射诱导DNA双链断裂位点附近修复纳米结构域的构建原理和功能
  • 批准号:
    24K20933
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
遺伝子の機能的発現を可能にするクロマチンドメインの構築原理解明
阐明实现基因功能表达的染色质结构域的构建原理
  • 批准号:
    23K23862
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
神経細胞の膜ナノドメイン構築原理とナノ病態機構の解明
阐明神经细胞膜纳米结构域构建原理及纳米病理机制
  • 批准号:
    23H00374
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
遺伝子の機能的発現を可能にするクロマチンドメインの構築原理解明
阐明实现基因功能表达的染色质结构域的构建原理
  • 批准号:
    22H02599
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation of the construction principle of animal cell chromosomes and their control mechanism
阐明动物细胞染色体的构建原理及其调控机制
  • 批准号:
    21K05503
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
次世代自由視点テレビの構築原理の研究
下一代自由视点电视的构建原理研究
  • 批准号:
    21K04072
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
適応的な行動制御を可能とする神経回路の構築原理
构建实现自适应行为控制的神经回路的原理
  • 批准号:
    21H02576
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
新奇なオンゲル共培養法を用いた脳スフェロイドへの血管網構造構築原理の探索
探索使用新型凝胶共培养方法在脑球体中构建血管网络结构的原理
  • 批准号:
    20K05236
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Stress oriented folded structures - an optimized light weight construction principle
应力导向折叠结构 - 优化的轻质结构原理
  • 批准号:
    269321250
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 1.09万
  • 项目类别:
    Research Grants
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了