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クラスターを構成する嗅覚受容体遺伝子の発現制御と進化の解析

形成簇的嗅觉受体基因的表达调控和进化分析

基本信息

批准号：
14011205
负责人：
榎森康文
金额：
$ 3.14万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011205/
关键词：
ゲノム進化遺伝子多重遺伝子嗅覚神経

项目摘要

(1)嗅覚受容体遺伝子のメチル化の解析ドジョウ嗅覚受容体(MOR)遺伝子クラスター(B/C/Dファミリークラスター)のデフォルト状態のメチル化をbisulfite法で解析した。その結果、コード領域内、および、そのごく近傍では、通常のメチル化、すなわち、CpG配列の80%程度がメチル化されていることがわかった。一方、クラスター内の遺伝子間に存在するCpGアイランド2箇所のメチル化状態を解析したところ、デフォルト状態では、ほとんど(90%以上)がメチル化を受けており、通常のCpGアイランドとは異なる状態にあることが判明した。この結果から、MOR遺伝子を発現していない組織細胞では、MOR遺伝子クラスターはヘテロクロマチン化しており、発現し得ない染色体状態にあることが推測された。一方、このクラスター領域の個体差を個体4匹を用いて検討したところ、コード領域とその周辺の塩基配列はきわめて保存されていたが、遺伝子間の領域では、CpGアイランド領域も含めて相当の個体差が塩基配列レベルで存在していた。しかし、CpGアイランド自体は塩基配列は大きく異なるような場合にも存在しており、CpGアイランドの存在がMOR遺伝子クラスターの発現制御において重要であることが予想された。(2)ドジョウ嗅上皮ESTライブラリーの作製と解析ドジョウ約100匹から嗅上皮を単離し、RNA抽出・cDNAライブラリーを作製した。現在、ライブラリーのチェックを行っており、直ちに、網羅的に塩基配列の解析を行う予定である。その結果を、既に行っているラット嗅上皮のDNAマイクロアレイ解析の結果と総合して検討する予定である。

(1)The analysis of the olfactory receptor (MOR) gene profile (B/C/D) by bisulfite The results are as follows: in the field of CpG, in the vicinity of CpG, in the general area, in the area of CpG, in the area of CpG, in The presence of CpG in one or more of the two sites was analyzed and the status of CpG in the two sites was determined. As a result, the MOR gene was detected in tissue cells, and the MOR gene was detected in chromosome states. The individual difference of a square, a square, The presence of CpG in the presence of MOR molecules is important in the development of MOR molecules, and the presence of CpG in the presence of MOR molecules is important in the development of MOR molecules. (2)About 100 pieces of DNA were isolated from the genome of the mouse, RNA was extracted, and cDNA was extracted. Now, the analysis of the base arrangement of the network is scheduled. The results of the analysis of DNA from the olfactory epithelium were analyzed and compared to the results of the previous study.