クラスターを構成する嗅覚受容体遺伝子の発現制御と進化の解析

构成簇的嗅觉受体基因的表达调控和进化分析

• 批准号: 13202010
• 负责人: 榎森 康文
• 金额: $ 3.2万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202010/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; 進化; 神経科学; 嗅覚; 多重遺伝子

1.長鎖DNAの解析のほか、通常のゲノムサザン分析によって、ドジョウゲノム中に存在するすべてのMOR遺伝子の1/2〜1/4に相当し、4つのサブファミリーに分類される約30個のMOR遺伝子を同定した。2.上記MOR遺伝子のクラスターのうち、Cサブファミリーに関して、8個のMOR遺伝子をタンデムに含むゲノム領域を解析したほか、ORF近傍に関しては他の3つのサブファミリー(47、A、202サブファミリー)の解析を終了した。これらのデータと既存のデータを総合的に検討した結果、以下のことが明らかになった。2-1)魚類のMOR遺伝子には、共通の5〜7個のプロトタイプ遺伝子が存在すること、また、比較的系統的に近い魚種間でもサブファミリーのメンバーは種毎に単系統を形成していることがわかった。これにより、現在見られるMOR遺伝子サブファミリーはそれぞれの種が進化する過程で比較的新しく重複・変異したものであり、進化のはやい遺伝子であることがわかった。2-2)これまではゲノム上にクラスターを形成している数個の類似したM0R遺伝子をサブファミリーとして分類ユニットの最小単位と考えてきた。しかし、本研究結果を基に、コーディング領域と周辺領域の塩基配列や、メチル化が起こるCpG配列の位置や数を考慮してさらに詳細に比較検討すると、1つのサブファミリーが複数のグループに分けられることがわかった。例えば、ドジョウのAサブファミリーやCサブファミリーに含まれる8〜10個のM0R遺伝子は、2〜3のメンバーを含む小さなグループに分けることができる。さらに、遺伝子の転写活性や発現遺伝子の選択に関わると期待されるCpG配列の位置とパターンは、それぞれのグループに特徴的であることが明らかになった。

1. The analysis of long-locked DNA is usually carried out in the presence of 1/2 ~ 1/4 of the MOR genes in the analysis of long-locked DNA, and about 30 MOR genes are identified in the classification of long-locked DNA. 2. The analysis of MOR gene sequences including all the MOR gene sequences, C gene sequences and 8 MOR gene sequences including all the MOR gene sequences and ORF sequences was completed. The results of this discussion are as follows: 2-1)The MOR gene of fish has 5 ~ 7 different genes in common, and there are different types of genes in the MOR gene. This is the first time in history that MOR has evolved since the 1980s. 2-2) The number of similar M0R genes is the smallest number of genes in the family. The results of this study are based on the analysis of CpG alignment in the peripheral domain and the analysis of CpG alignment in the peripheral domain. For example, the A/C file contains 8 to 10 M0R files, 2 to 3 M0R files contain 3 small files, and the C/C file contains 3 small files. In addition, the activity of CpG molecules and the selection of CpG molecules are expected to be related to the position and characteristics of CpG molecules.

项目成果

Ishimaru et al.: "An action-binding protein, CAP, is expressed in a subset of rat taste but cells"Neuro Report. 12巻. 233-235 (2001)

Ishimaru 等人：“作用结合蛋白 CAP 在大鼠味觉细胞的子集中表达”《神经报告》第 12 卷 233-235（2001 年）。

Asano-miyoshi et al.: "IP3 receptor type 3 and PLCβ2 are co-expressed with taste receptors, T1R and T2R in rat taste but cells"Chemical Senses. 26巻. 259-265 (2001)

Asano-miyoshi 等人：“IP3 受体 3 型和 PLCβ2 与大鼠味觉细胞中的味觉受体 T1R 和 T2R 共表达”Chemical Senses 26. 259-265 (2001)。

Kishi et al.: "Primary culture of rat tastebud cells that retain molecular markers for taste buds and permit functional expression of foreign genes"Neuroscience. 106巻. 217-225 (2001)

Kishi 等人：“保留味蕾分子标记并允许外源基因功能表达的大鼠味蕾细胞的原代培养”，Neuroscience，第 106 卷，217-225（2001 年）。