新規高分子発光プローブによる発現遺伝子の超高感度マイクロアレー解析

使用新型聚合物发光探针对表达基因进行超灵敏微阵列分析

基本信息

  • 批准号:
    16011247
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.69万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、核酸のハイブリダイゼーションによって、細胞内の分子数レベルの遺伝子が検出できる新手法の開発を目的としている。まず、研究代表者らが開発しているTMPG試薬を用いて、細胞分裂と寿命に関係するテロメアDNAのハイブリダイゼーション高感度検出法について検討した。TMPG試薬はグアニン塩基を特異的に発光性に導くことができるので、グアニン塩基を含まないcDNA[(CCCTAA)n]をマイクロアレー膜に固定し、テロメアDNAとハイブリダイズさせた場合、ピコモルレベルのテロメアDNAの特異的な検出が可能になった。しかし、この感度は従来法の約千分の一であった。そこで、TMPG試薬によるテロメアDNAの化学発光画像検出法の感度を増大させるために、アビジンタンパク質とビオチン化長鎖DNAを用いて、ターゲットDNAに多量のグアニン塩基を含む長鎖DNAをさらに連鎖的に結合させ、発光強度を増大させることを試みた。具体的には、テロメアDNAをもたない大腸菌の二本鎖DNAにビオチンを導入したビオチン化長鎖DNAを合成し、それをテロメアDNAの検出系にストレプトアビジンとともに加え、膜上のcDNAとハイブリダイズさせ、さらにビオチン化cDNAを介して、ビオチン化長鎖DNAを結合させた。この結果、暫定的に設定した条件ではテロメアDNAの発光シグナルは千倍以上増大する事実を得たが、テロメアDNAの濃度を定量的に検出できなかった。そこで、種々のビオチン化長鎖DNAを用いて、それらのビオチン化cDNAに対する結合性を調べるために、ビオチンヒドラジド用いて長鎖DNAのビオチン化合成反応を検討した。その結果、ビオチンヒドラジドを加え、加熱反応時間を変化させることにより導入するビオチン数が調整できるビオチン化DNAの新合成法を開発した。この方法により、6種類のビオチン化長鎖DNA合成し、それらのストレプトアビジンに対する結合性と元素分析により生成物中のビオチンの導入数を調べた。この結果、合成反応時間の長いもの程ビオチンの導入数も多くなり、ストレプトアビジンに対して大きな結合定数すなわち強い結合性を示すことが分かった。
This study で は, nucleic acid の ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン に よ っ て, の molecular number in cells レ ベ ル の heritage 伝 son が 検 out で き る の twist to open 発 を purpose と し て い る. ま ず representatives, research ら が open 発 し て い る TMPG try 薬 を with い て, cell division と life に masato is す る テ ロ メ ア DNA の ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン 検 Gao Gan degrees out method に つ い て beg し 検 た. Try TMPG 薬 は グ ア ニ ン salt base を specific に 発 optical に guide く こ と が で き る の で, グ ア ニ ン salt base を containing ま な い cDNA [n] (CCCTAA) を マ イ ク ロ ア レ ー membrane に fixed し, テ ロ メ ア DNA と ハ イ ブ リ ダ イ ズ さ せ た occasions, ピ コ モ ル レ ベ ル の テ ロ メ ア の specific DNA な 検 が may に Youdaoplaceholder0. The intensity of the <s:1>, the <s:1> sensitivity of the であった 従 in France is about one thousandth であった. そ こ で, try TMPG 薬 に よ る テ ロ メ ア DNA の chemical 発 light portraits 検 out の sensitivity を raised large さ せ る た め に, ア ビ ジ ン タ ン パ ク qualitative と ビ オ チ ン turn lock を DNA with い て, タ ー ゲ ッ ト DNA に の abundant グ ア ニ ン salt base を containing む long locks DNA を さ ら に chain に combined さ せ, 発 light intensity を raised large さ せ る こ と を Try みた. Specific に は, テ ロ メ ア DNA を も た な い coliform の 2 lock DNA に ビ オ チ ン を import し た ビ オ チ ン long locks し を DNA synthesis and そ れ を テ ロ メ ア DNA の 検 out department に ス ト レ プ ト ア ビ ジ ン と と も に え, membrane の cDNA と ハ イ ブ リ ダ イ ズ さ せ, さ ら に ビ オ チ ン the cDNA を interface し て, ビ Youdaoplaceholder0 チ equips long-lock DNAを binds to させた. こ の results, the tentative set に し た conditions で は テ ロ メ ア DNA の 発 light シ グ ナ ル は one thousand times more raised large す る things be を must た が, テ ロ メ ア の DNA concentration を quantitative に 検 out で き な か っ た. そ こ で, kind of 々 の ビ オ チ ン turn lock を DNA with い て, そ れ ら の ビ オ チ ン the cDNA に す seaborne る associativity を adjustable べ る た め に, ビ オ チ ン ヒ ド ラ ジ ド with い て long locks DNA の ビ オ チ ン combined into the 応 を beg し 検 た. そ の results, ビ オ チ ン ヒ ド ラ ジ ド を え, heating the 応 time を variations change さ せ る こ と に よ り import す る ビ オ チ ン number が で き る ビ オ チ ン の new DNA synthesis を turn 発 し た. こ の way に よ り, 6 species の ビ オ チ ン し long locks of DNA synthesis and そ れ ら の ス ト レ プ ト ア ビ ジ ン に す seaborne る associativity と element analysis に よ り products in の ビ オ チ ン の import several を adjustable べ た. こ の result, synthetic 応 の long い も の cheng ビ オ チ ン の import more than several も く な り, ス ト レ プ ト ア ビ ジ ン に し seaborne て big き な combined with destiny す な わ ち strong い associativity を shown す こ と が points か っ た.

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Enantio-selective inhibition of (1R,9S)- and (1S,9R)-β-hydrastines on dopamine biosynthesis in PC12 cells
  • DOI:
    10.1016/j.neuropharm.2004.07.033
  • 发表时间:
    2004-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    S. Yin;Y. M. Kim;Jae Joon Lee;C. Jin;Y. Yang;J. Ma;Min H. Kang;M. Kai;Myung-Koo Lee
  • 通讯作者:
    S. Yin;Y. M. Kim;Jae Joon Lee;C. Jin;Y. Yang;J. Ma;Min H. Kang;M. Kai;Myung-Koo Lee
薬学物理化学 -第4版- (第7章 界面とコロイド)(松島美一,吉柳節夫 監修)
药物物理化学-第 4 版-(第 7 章界面和胶体)(由 Yoshikazu Matsushima 和 Setsuo Yoshiyanagi 指导)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Saito;Y.;Miyauchi;Y.;Okamoto;A.;Saito;I.;Choiwan Lau;Shou Yu Yin;Shou Yu Yin;甲斐 雅亮(共著)
  • 通讯作者:
    甲斐 雅亮(共著)
Effects of (1R,9S)-β-hydrastine on l-DOPA-induced cytotoxicity in PC12 cells
  • DOI:
    10.1016/j.ejphar.2004.02.021
  • 发表时间:
    2004-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    S. Yin;Jae-Joon Lee;Y. M. Kim;C. Jin;Y. Yang;Min H. Kang;M. Kai;Myung-Koo Lee
  • 通讯作者:
    S. Yin;Jae-Joon Lee;Y. M. Kim;C. Jin;Y. Yang;Min H. Kang;M. Kai;Myung-Koo Lee
Chemiluminescence determination of tetracycline based on radical production in a basic acetonitrile–hydrogen peroxide reaction
  • DOI:
    10.1016/j.aca.2003.10.035
  • 发表时间:
    2004-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    6.2
  • 作者:
    C. Lau;Jianzhong Lu;M. Kai
  • 通讯作者:
    C. Lau;Jianzhong Lu;M. Kai
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    尹 晟;椛島 力;柴田 孝之;甲斐 雅亮
  • 通讯作者:
    甲斐 雅亮
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    甲斐 雅亮

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マイクロチップ上の遺伝子及びタンパク質の検出に用いる超高感度発光プローブの創製
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  • 批准号:
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    2019
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    $ 2.69万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
機能遺伝子のmRNAを標的としたFISH法の開発と脱窒素細菌の網羅的検出へ適用
针对功能基因mRNA的FISH方法开发及其在反硝化细菌综合检测中的应用
  • 批准号:
    22651031
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 2.69万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
mRNA分解酵素複合体CCR4の、細胞増殖における遺伝子欠損マウスを用いた解析
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  • 批准号:
    07J10802
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.69万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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