がん化に関わる転写因子の立体構造に基づく機能解明と阻害剤の接計

基于参与癌症形成的转录因子的三维结构的功能阐明和抑制剂的直接评估

• 批准号: 17012019
• 负责人: 山縣 ゆり子
• 金额: $ 5.63万
• 依托单位: Kumamoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17012019/
• 关键词: 転写因子; 構造生物学; 蛋白質の結晶化; SBDD

がん化に転写因子が関わることは多い。がん細胞での遺伝子発現異常を考えれば、これは当然のことである。我々はともに80数残基からなる高等生物に保存され、DNA結合するEtsドメインをもつEts-2とEwing肉腫に見られる染色体転座遺伝子産物EWS/FLI1を対象として、それらと標的DNAとの複合体の立体構造をX線結晶構造解析法で決定し、両転写制御因子の立体構造に基づきがん化の仕組みを解明し、阻害剤設計へ応用する。さらに我々がすでにX線結晶構造解析を終えたヒトMTH1の欠損がアポトーシスを起こすため、新たに抗がん剤の標的となることが分かったので、hMTH1の立体構造に基づく薬物設計(SBDD)も本研究の目的とし、以下の研究を行った。1.Ets-2については大腸菌から全長のものを大量調製したが、蛋白質の分解が観察されたので、分解しない条件を検討しつつ、C末フラグメント、Etsドメインの発現系の構築を行い、精製した。EWS/FLI1については、Ni-カラムの後、さらに幾つかのカラムを試して、結晶化できる純度まで上げることを検討しているが、溶解度の低さの解決方法を検討している。2.精製のできたEts-2のC末フラグメントと標的DNAとの複合体の結晶化について核酸-蛋白質結晶化によく使われる条件を中心に、幅広く多様な条件でスクリーニングを行った。現在、クラスター状の微結晶が得られ、さらに条件の検討を行っている。3.hMTH1のSBDDについては、その基質である8-oxodGTPと2-oxodATPとの複合体の結晶構造の精密化を完成させた。この結果、hMTH1は極めて珍しい2つの構造の異なる基質の認識機構を持つことがわかった。これを考慮してプログラムMOEを用いて活性部位にうまく結合する低分子化合物をライブラリーから検索し、リード化合物の侯補について細胞増殖実験で活性を調べている。

The number of words in the text is zero. The cell is abnormal, and the cell is abnormal. We determined the three-dimensional structure of the target DNA complex by X-ray crystallographic analysis. We determined the three-dimensional structure of the control factor by X-ray crystallographic analysis. We determined the structure of the control factor by X-ray crystallographic analysis. X-ray crystallographic analysis of MTH1 was carried out in order to improve the quality of MTH1 and to improve the quality of MTH 1. 1. Ets-2: The whole length of Escherichia coli is regulated in large quantities, the decomposition of protein is observed, the decomposition conditions are discussed, the C terminal is selected, and the development system of Ets is constructed and refined. EWS/FLI1: The solution to the problem of low solubility is discussed. 2. Crystallization of Nucleic Acid-Protein Crystallization Conditions for Purified Ets-2 and Target DNA Complexes Now, the micro-crystals in the shape of crystals can be obtained, and the conditions of the micro-crystals can be discussed. 3. The crystal structure of hMTH1 SBDD complex was refined. As a result, hMTH1 is extremely rare and 2 is different from the structure and the understanding mechanism of the matrix. This is to consider the use of low molecular weight compounds in the active site of MOE, the use of low molecular weight compounds in cell proliferation, and the use of low molecular weight compounds in cell proliferation.

项目成果

Irreversible inhibition of metallo-β-lactamase (IMP-1) by 3-(3-mercaptopropionylsulfanyl)propionic acid pentafluorophenyl ester

• DOI: 10.1002/anie.200500835
• 发表时间: 2005-01-01
• 期刊: ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
• 影响因子: 16.6
• 作者: Kurosaki, H;Yamaguchi, Y;Goto, M
• 通讯作者: Goto, M

Conformational changes in the tryptophan synthase from a hyperthermophile upon α2β2 complex formation:: Crystal structure of the complex

• DOI: 10.1021/bi050317h
• 发表时间: 2005-08-30
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Lee, SJ;Ogasahara, K;Yutani, K
• 通讯作者: Yutani, K

Probing the role of Aspl20(81) of metallo-β-lactamase (TMP-1) by site-directed mutagenesis, kinetic studies. and X-ray crystallography

通过定点诱变、动力学研究和 X 射线晶体学探讨金属-β-内酰胺酶 (TMP-1) 的 Aspl20(81) 的作用。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biol. Chem. 280
• 作者: Shibue T;Suzuki S;Okamoto H;Yoshida H;Ohba Y;Takaoka A;Taniguchi T.;Yamaguchi Y. et al.
• 通讯作者: Yamaguchi Y. et al.

タンパク質のかたちから生命のなぞを解く

从蛋白质的形状解开生命之谜

• 发表时间: 2005
• 作者: Kosako;H.;Yamaguchi;N.;Aranami;C.;Ushiyama;M.;Kose;S.;Imamoto;N.;Taniguchi;H.;Nishida;E.;Hattori;S.;田之倉優編
• 通讯作者: 田之倉優編

Mammalian enzymes for preventing transcriptional errors caused by oxidative damage.

• DOI: 10.1093/nar/gki682
• 发表时间: 2005
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Ishibashi T;Hayakawa H;Ito R;Miyazawa M;Yamagata Y;Sekiguchi M
• 通讯作者: Sekiguchi M