がん化に関わる蛋白質の立体構造に基づく機能制御

基于参与癌变的蛋白质三维结构的功能控制

• 批准号: 18011007
• 负责人: 山縣 ゆり子
• 金额: $ 7.68万
• 依托单位: Kumamoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18011007/
• 关键词: 転写因子; 転写因子-DNA複合体; 構造生物学; 立体構造に基づく薬物設計

がん化に転写因子が関わることは多い。がん細胞での遺伝子発現異常を考えれば、これは当然のことである。我々はともに80数残基からなる高等生物に保存され、DNA結合するEtsドメインをもつEts-2とEwing肉腫に見られる染色体転座遺伝子産物EWS/FLI1を対象として、それらと標的DNAとの複合体の立体構造をX線結晶構造解析法で決定し、両転写制御因子の立体構造に基づきがん化の仕組みを解明し、阻害剤設計へ応用する。さらに我々がすでにX線結晶構造解析を終えたヒトMTH1の欠損がアポトーシスを起こすため、新たに抗がん剤の標的となることが分かったので、hMTH1の立体構造に基づく薬物設計(SBDD)も本研究の目的とした。EWS/FLI1について、現在唯一可溶画分に移行できるトリガーファクターとの融合タンパク質のより高純度精製を試みたが、分解が問題で分解しない条件を見出せていない。まだ試してしない発現系が数少ないがあるのでその発現系について検討中である。Ets-2については、Etsドメイン(ETSD)と標的DNA複合体の結晶化条件の検討を重ね、構造解析可能な結晶が得られた。放射光実験施設で40K下X線回折データを収集することで、分子置換法での構造解析後の3.0Aでの構造の精密化ができた。明らかになった複合体の構造から、Biacoreを用いて測定したETSDといろいろなDNA配列との親和性についての構造的基盤が明らかになった。さらなる転写制御の仕組みを解明するために全長Ets-2とコファクタータンパク質とDNAの3元複合体の結晶化に研究を展開している。hMTH1の阻害剤の設計の課題については、ドッキングプログラムMOEを用い、様々な配座データを含むライブラリーから活性部位に結合する低分子を検索し、阻害剤を見つける作業を行った。現在、IC50が50μM程度の阻害剤を見出している。

The number of words in the text is zero. The cell is abnormal, and the cell is abnormal. We determined the three-dimensional structure of the target DNA complex by X-ray crystallographic analysis. We determined the three-dimensional structure of the control factor by X-ray crystallographic analysis. We determined the structure of the control factor by X-ray crystallographic analysis. The purpose of this study is to analyze the structure of MTH1 and to design the structure of MTH 1. EWS/FLI1 is the only soluble component in the transition process. It is the only soluble component in the transition process. It is the only soluble component in the transition process. It is the only soluble component in the transition process. It is the only soluble component in the transition process. There are a lot of ways in which you can find out. Ets-2, ETSD, ETSD X-ray reflection data collection at 40K under radiation conditions and structural analysis by molecular replacement method were analyzed and refined at 3.0 A. The structure and Biacore of the complex were determined by ETSD and DNA alignment and affinity. A study on the crystallization of 3-member DNA complexes was carried out. hMTH1's design of the barrier agent is the subject of research and application of MOE, research and application of low molecular weight, barrier agent and active site binding. At present, IC50 - 50μM level of resistance agent is seen in the middle of the day.

项目成果

Crystal structure of the IL-15-IL-15Rα complex, a cytokine-receptor unit presented in trans

• DOI: 10.1038/ni1492
• 发表时间: 2007-09-01
• 期刊: NATURE IMMUNOLOGY
• 影响因子: 30.5
• 作者: Chirifu, Mami;Hayashi, Chiharu;Ikemizu, Shinji
• 通讯作者: Ikemizu, Shinji

Probing inhibition, and crystallographic characterization of metallo-beta-lactamase (IMP-1) with fluorescent agents containing dansyl and thiol groups

使用含有丹酰基和硫醇基团的荧光剂探测金属-β-内酰胺酶 (IMP-1) 的抑制和晶体学表征

• 发表时间: 2006
• 期刊: Chem. Med. Chem. 1
• 作者: Yoneyama;M.;Fujita;T.;藤田尚志;小野口和英;米山光俊;尾野本浩司;米山光俊;渡邊伸昌;T.Sato et al.;H.Kurosaki et al.
• 通讯作者: H.Kurosaki et al.

Cromium (III) ion and thyroxine cooperate to stabilize the transthyretin tetramer and suppress in vitro amyloid fibril formation

铬 (III) 离子和甲状腺素协同稳定转甲状腺素蛋白四聚体并抑制体外淀粉样原纤维形成

• 发表时间: 2006
• 期刊: FEBS Letters 580
• 作者: Yoneyama;M.;Fujita;T.;藤田尚志;小野口和英;米山光俊;尾野本浩司;米山光俊;渡邊伸昌;T.Sato et al.
• 通讯作者: T.Sato et al.

Completely buried, non-ion-paired glutamic acid contributes favorably to the conformational stability of pyrrolidone carboxyl peptidases from hyperthermophiles

• DOI: 10.1021/bi052610n
• 发表时间: 2006-06-13
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Kaushik, Jai K.;Iimura, Satoshi;Yutani, Katsuhide
• 通讯作者: Yutani, Katsuhide

Crystallization and preliminary X-ray analysis of human MTHI complexed with two oxidized nucleotides, 8-oxo-dGMP and 2-oxo-dATP

与两种氧化核苷酸（8-oxo-dGMP 和 2-oxo-dATP）复合的人 MTHI 的结晶和初步 X 射线分析

• 发表时间: 2006
• 期刊: Acta Cryst. F62
• 作者: Yoneyama;M.;Fujita;T.;藤田尚志;小野口和英;米山光俊;尾野本浩司;米山光俊;渡邊伸昌;T.Sato et al.;H.Kurosaki et al.;J.K.Kaushik et al.;T.Nakamura et al.
• 通讯作者: T.Nakamura et al.