膜に関わる蛋白質の構造生物学的研究
膜に関わる蛋白質の構造生物学的研究
批准号:
19036023
负责人:
山縣 ゆり子
金额:
$3.84万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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本研究で対象とする膜に関わる蛋白質は、1) 熊本大学谷らによって酵母のmRNAの核外輸送ができない温度感受性株の一つの原因蛋白質として見出されたPtr7と、2) 炎症性サイトカイン受容体ファミリーからの情報伝達に関わるTRAF6/TIFA複合体であったが、Ptr7のホモログの構造解析や機能解析が報告されたので、新たにPtr7と同様、mRNAの核外輸送に関わると予想されるが機能未知である1回貫通型膜蛋白質Ptr10のヒトホモログの膜外C末ドメインhPtr10Cを対象に加えた。本研究の目的は、hPtr10CのX線結晶構造解析を行い、立体構造から機能を推定し、核膜や小胞体膜に存在するPtr10の働きを解明することである。Ptr7については酵母における機能解明とその立体構造基盤の解明が目的である。さらに炎症性サイトカインからの情報伝達機構について、立体構造に基づく機能の解明と抗炎症剤の設計を目的とする。hPtr10Cについては、X線構造解析可能な結晶が得られ、さらに、SeMet化結晶も得られたので放射光研究施設を利用し、単波長異常分散法(MAD/SAD法)による構造解析に成功した。明らかになった立体構造は全く新規のフォールドであったので、この構造からすぐに機能の予測が出来ないが、特徴的な構造と構造形成に必須である分子内S-S結合の存在を見出し、hPtr10Cは小胞体で働くと推定できた。Ptr7については現在のところヒトホモログで報告されたsiRNAのリン酸化活性は見出だされていないので、Ptr7-RNA複合体の結晶化は行っていない。TRAF6/TIFA複合体については、高純度に精製できたTRAF6CとTIPAとの複合体の結晶化を行い、細い針状結晶が得られた。現在X線構造解析可能な太さの結晶作成を試みている。また関連のTNF/TNFR複合体の構造解析に成功し、炎症性サイトカインからの情報伝達機構の第1ステップが解明できた。
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Creation and X-ray structure analysis of the tumor necrosis factor receptor-1 selective mutant of a TNFα antagonist
TNFα拮抗剂肿瘤坏死因子受体1选择性突变体的创建和X射线结构分析
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
J. Biol. Chem. 283
影响因子:
--
作者:
[Shibata H., et. al.,]
通讯作者:
et. al.,
DOI:
10.1038/ni1492
发表时间:
2007-09-01
期刊:
NATURE IMMUNOLOGY
影响因子:
30.5
作者:
[Chirifu, Mami, Hayashi, Chiharu, Ikemizu, Shinji]
通讯作者:
Ikemizu, Shinji
Crystallization and preliminary Xray analysis of the tumor necrosis factor α-tumor necrosis factor receptor type 2 complex
肿瘤坏死因子α-肿瘤坏死因子受体2型复合物的结晶和初步X射线分析
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Acta Cryst F65
影响因子:
--
作者:
[Mukai, Y., et.al.]
通讯作者:
et.al.
Stnicture-function relationship of tumor necrosis factor (TNF) and its receptor interaction based on 3D structural analysis of a fully active TNFR1-selective TNF mutant
基于完全活性 TNFR1 选择性 TNF 突变体的 3D 结构分析,肿瘤坏死因子 (TNF) 的结构功能关系及其受体相互作用
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Journal of Molecular Biology 381
影响因子:
--
作者:
[Mukai, Y., et.al.]
通讯作者:
et.al.
Fast binding lcinetics and conserved 3D structure underlie the antagonistic activity of mutant TNF : useful information for designing artificial proteo-antagonists
快速结合动力学和保守的 3D 结构是突变体 TNF 拮抗活性的基础:设计人工蛋白拮抗剂的有用信息
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Journal of Biochemistry 146(in press)
影响因子:
--
作者:
[Mukai, Y., et.al.]
通讯作者:
et.al.
共 8 条
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解機構の解明
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批准号:18031029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.49万
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财政年份:2006
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
がん化に関わる蛋白質の立体構造に基づく機能制御
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批准号:18011007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.68万
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财政年份:2006
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
がん化に関わる転写因子の立体構造に基づく機能解明と阻害剤の接計
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批准号:17012019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2005
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究
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批准号:17048022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.29万
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财政年份:2005
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究
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批准号:16048225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解反応機構の解明
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批准号:16041236
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.42万
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财政年份:2004
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
造血幹細胞から巨核球への分化に関わる蛋白質群の3次元構造と機能
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批准号:13033026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2001
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
ゲノム配列データからファミリーを効率よく検索するシステム開発のための基盤研究
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批准号:12206050
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
造血幹細胞から巨核球への分化に関わる蛋白質群の3次元構造と機能
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批准号:11169226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:1999
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの3次元構造に基づく機能解明
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批准号:11146211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの3次元構造に基づく機能解明
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批准号:10165214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼの反応機構
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批准号:08214208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1996
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼの反応機構
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批准号:07224205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1995
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼのX線構造解析
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批准号:06235210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1994
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素の三次元構造と機能
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批准号:06263207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1994
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
大腸菌アルキル化DNA修復酵素の三次元構造と機能
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批准号:05270209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素の高次構造と機能に関する研究
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批准号:63771917
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1988
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素系遺伝子発現調節蛋白質の作用機構に関する構造化学的研究
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批准号:62771874
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化核酸とアルキル化DNA修復酵素の相互認識機構に関する構造化学的研究
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批准号:61771842
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1986
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位: