自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解反応機構の解明
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解反応機構の解明
批准号:
16041236
负责人:
山縣 ゆり子
金额:
$7.42万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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生体内の酵素反応の中で加水分解反応は古くからその触媒機構の解明が試みられてきたが、今もって正確に理解されているとは言い難い。本研究では、低温トラップX線結晶構造解析法を駆使して、Mg^<2+>(Mn^<2+>)存在下8-oxo-dGTPを8-oxo-dGMPに分解する大腸菌MutTやそのヒトホモログhMTH1の加水分解反応機構の解明を目的とする。1.我々は昨年度本研究の基本となるMutTと基質である8-oxo-dGTPの複合体の結晶化に取組み、良好な結晶を得ることに成功、1.8Å分解能の構造を得、MnCl_2溶液中に浸漬したところ、結晶内で反応が起こることを確認した。本年度はさらにMutT-8-oxo-dGTP複合体結晶をさまざまな条件下MnCl_2溶液中に浸漬、100KのN2ガスで瞬間凍結し、その構造解析を約50種の結晶について行った。その結果,5mMMnCl_2溶液中に3から5時間浸潰したところで,3個のMn^<2+>がMutTと8-oxo-dGTPに配位し、反応が起こる直前と思われる状態の構造を捕らえることに成功した.さらに、Mn^<2+>の異常分散効果を利用してMn^<2+>の位置を正確に決定した。その結果に基づき、加水分解反応の初期過程のモデルを提案できた。2.ヒト由来のMutTホモログ(hMTH1)はMutTと異なり幅広い基質特異性をもち、加水分解に関わるアミノ酸残が異なることが示唆されている。我々はこの差異を明らかにするために、hMTH1と8-oxo-dGTP並びに8-oxo-dGMPとの基合体の結晶化を行い、両複合体構造を2.2Åと1.95Å分解能で解析した。hMTH1-8-oxo-dGTP複合体の結晶についてもMg^<2+>(Mn^<2+>)を浸漬し、MutT同様の方法で結晶内反応を調べた。その結果、現在の結晶では反応が起こると結晶が壊れることが分かったので、別の結晶化条件を検討している。
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タンパク質のかたちから生命のなぞを解く
从蛋白质的形状解开生命之谜
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kosako, H., Yamaguchi, N., Aranami, C., Ushiyama, M., Kose, S., Imamoto, N., Taniguchi, H., Nishida, E., Hattori, S., 田之倉優編]
通讯作者:
田之倉優編
DOI:
10.1002/anie.200500835
发表时间:
2005-01-01
期刊:
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子:
16.6
作者:
[Kurosaki, H, Yamaguchi, Y, Goto, M]
通讯作者:
Goto, M
Optimal site-specific PEGylation of mutant TNF-alpha improves its antitumor potency.
突变体 TNF-α 的最佳位点特异性聚乙二醇化可提高其抗肿瘤效力。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Biochem.Biophys.Res.Commun. 315・4
影响因子:
--
作者:
[Yoshioka Y., et al.]
通讯作者:
et al.
DOI:
10.1074/jbc.m402393200
发表时间:
2004-08-06
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Mishima, M, Sakai, Y, Shirakawa, M]
通讯作者:
Shirakawa, M
DOI:
10.1021/bi050317h
发表时间:
2005-08-30
期刊:
BIOCHEMISTRY
影响因子:
2.9
作者:
[Lee, SJ, Ogasahara, K, Yutani, K]
通讯作者:
Yutani, K
共 13 条
膜に関わる蛋白質の構造生物学的研究
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批准号:19036023
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2007
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解機構の解明
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批准号:18031029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.49万
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财政年份:2006
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
がん化に関わる蛋白質の立体構造に基づく機能制御
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批准号:18011007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.68万
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财政年份:2006
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
がん化に関わる転写因子の立体構造に基づく機能解明と阻害剤の接計
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批准号:17012019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2005
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究
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批准号:17048022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.29万
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财政年份:2005
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究
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批准号:16048225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
造血幹細胞から巨核球への分化に関わる蛋白質群の3次元構造と機能
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批准号:13033026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2001
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
ゲノム配列データからファミリーを効率よく検索するシステム開発のための基盤研究
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批准号:12206050
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
造血幹細胞から巨核球への分化に関わる蛋白質群の3次元構造と機能
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批准号:11169226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:1999
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの3次元構造に基づく機能解明
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批准号:11146211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの3次元構造に基づく機能解明
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批准号:10165214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼの反応機構
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批准号:08214208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1996
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼの反応機構
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批准号:07224205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1995
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼのX線構造解析
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批准号:06235210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1994
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素の三次元構造と機能
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批准号:06263207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1994
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
大腸菌アルキル化DNA修復酵素の三次元構造と機能
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批准号:05270209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素の高次構造と機能に関する研究
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批准号:63771917
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1988
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化DNA修復酵素系遺伝子発現調節蛋白質の作用機構に関する構造化学的研究
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批准号:62771874
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
アルキル化核酸とアルキル化DNA修復酵素の相互認識機構に関する構造化学的研究
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批准号:61771842
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
-
财政年份:1986
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负责人:山縣 ゆり子
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依托单位:
海外基金