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自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解機構の解明

自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解機構の解明
阐明抑制自发突变的 8-oxo-dGTPase 水解机制
批准号：
18031029
负责人：
山縣 ゆり子
金额：
$7.49万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2007
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18031029/
关键词：
動的蛋白質結晶学酵素反応機構DNA修復酵素

项目摘要

项目成果

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生体内の酵素反応の中で加水分解反応は非常に多く、古くからその反応機構の解明が行われているが、今もって正確に理解されているものはほとんどない。本研究では、動的蛋白質結晶学の手法を用いて、Mg^<2+>(Mn^<2+>)存在下8-oxo-dGTPを8-oxo-dGMPに分解することによって通常の生命活動で細胞内に生じる活性酸素の酸化でもっとも重大なDNA損傷の一つ8-オキングアニンのDNAへの取り込みを防御している大腸菌MutT(分子量15000:8-oxo-dGTPase)の結晶中での加水分解反応の各段階を可視化することを目的とした。昨年までの低温トラップ法と2波長X線データ収集を組み合わせることに初めて明らかになった結晶内での初期反応過程が溶液中でも見られるか、EPR実験によって調べたところ、溶液中においても結晶内と同様のMn^<2+>クラスターの存在が示唆され、結晶内と同様の反応が溶液中でも起こっていると思われる。次に結晶内での反応の同期性を高めるために、フローセル法を用いた動的蛋白質結晶学により、触媒反応の中期、後期機構の可視化を目指した。放射光実験施設で数10秒の照射で1セットのデータを連続的に収集し、反応を追跡したが、現在のところ、触媒反応の中期、後期過程を示すデータを見出せていない。MutTのヒト関連酵素について、hMTH1-基質複合体のX線結晶構造解析に続き、NUDT5-基質(アナログ)複合体のX線結晶構造解析を行った。さらに両酵素とその変異酵素の速度論的実験を行い、明らかになった結晶構造と比較することによって、3種の8-oxo-dGT(D)Paseの加水分解反応機構の類似性や相違性が明らかになった。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Crystal structure of the IL-15-IL-15Rα complex, a cytokine-receptor unit presented in trans
DOI： 10.1038/ni1492
发表时间： 2007-09-01
期刊： NATURE IMMUNOLOGY
影响因子： 30.5
作者： [Chirifu, Mami, Hayashi, Chiharu, Ikemizu, Shinji]
通讯作者： Ikemizu, Shinji
Probing inhibition, and crystallographic characterization of metallo-beta-lactamase (IMP-1) with fluorescent agents containing dansyl and thiol groups
使用含有丹酰基和硫醇基团的荧光剂探测金属-β-内酰胺酶 (IMP-1) 的抑制和晶体学表征
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Chem. Med. Chem. 1
影响因子： --
作者： [Yoneyama, M., Fujita, T., 藤田尚志, 小野口和英, 米山光俊, 尾野本浩司, 米山光俊, 渡邊伸昌, T.Sato et al., H.Kurosaki et al.]
通讯作者： H.Kurosaki et al.
Cromium (III) ion and thyroxine cooperate to stabilize the transtnyretin tetramer and suppress in vitro amyloid fibril formation
铬 (III) 离子和甲状腺素协同稳定转酪蛋白四聚体并抑制体外淀粉样纤维形成
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： FEBS Letters 580
影响因子： --
作者： [秋山良, 狩野康人, 木下正弘, T.Sato et al.]
通讯作者： T.Sato et al.
Crystallographic investigation of the inhibition mode of a VIM-2 metallo-β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa by a mercaptocarboxylate inhibitor
DOI： 10.1021/jm701031n
发表时间： 2007-12-27
期刊： JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子： 7.3
作者： [Yamaguchi, Yoshihiro, Jin, Wanchun, Kurosaki, Hiromasa]
通讯作者： Kurosaki, Hiromasa
共 8 条
    膜に関わる蛋白質の構造生物学的研究
    • 批准号：
      19036023
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.84万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    がん化に関わる蛋白質の立体構造に基づく機能制御
    • 批准号：
      18011007
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $7.68万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    がん化に関わる転写因子の立体構造に基づく機能解明と阻害剤の接計
    • 批准号：
      17012019
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.63万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    核膜を介した双方向輸送に関わる蛋白質の多様な相互作用の構造生物学的研究
    • 批准号：
      17048022
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.29万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    海外基金