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ローカスおよびゲノムワイド関連解析による統合失調症の分子基盤の解明

通过基因座和全基因组关联分析阐明精神分裂症的分子基础

基本信息

批准号：
17019052
负责人：
服巻保幸
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

1.ローカスワイド関連解析(1)グルタミン酸受容体遺伝子群のなかで、メタボトロピックグルタミン酸受容体8型遺伝子(GRM8)およびNMDA受容体2D型遺伝子(GRIN2D)、カイニン酸受容体7型、KA1型、KA2型各遺伝子(GRIK3,GRIK4,GRIK5)の全領域にわたり、連鎖不平衡を考慮し選択したSNPを用いて関連解析を行った。GRM8,GRIN2Dについてはハプロタイプと疾患との関連を見出した。一方GRIK3,GRIK4,GRIK5については関連を認めなかった。グルタミン酸トランスポーターEAAT2遺伝子(SLC1A2)についてハプロタイプで関連を認めた。(2)罹患同胞対解析による5q33.1領域の遺伝子群について:本領域5.7Mbに存在する43個の遺伝子領域に、連鎖不平衡を考慮して選択したSNPについてタイピングを行った。有意差が見られたSNPについてサンプル数を追加しさらに解析を行ったところ、遺伝子型・アレル頻度で1遺伝子、ハプロタイプ頻度において1遺伝子、それぞれ疾患との有意な関連が認められた。(3)PCP投与ラットの大脳の5部位から、マイクロアレイを用いて発現に変化を来す遺伝子を見出した(発現亢進71個、発現低下31個)。その中で2.5倍以上の変化を来す10個の遺伝子を定量的RT-PCR法により確認した。これらの遺伝子について関連解析を開始した。2.ゲノムワイド関連解析27,000のマイクロサテライトマーカーを用いて1〜5次ゲノムワイド関連解析を行っている。1次スクリーニングについて:1〜18番,20番染色体は終了した。終了マーカー数25,074、その中で有意差が見られたマーカー数は2,951(11.8%)であった。2次スクリーニングについて:1〜6番,9〜18番,20番染色体はほぼ終了した。終了マーカー数1,868、その中で有意差が見られたマーカー数は638(34.2%)であった。

1. Association analysis (1) All-domain analysis and linkage disequilibrium analysis were performed for the acid receptor type 8 gene (GRM8) and NMDA receptor type 2D gene (GRIN2D), acid receptor type 7, KA type 1, KA type 2 genes (GRIK3, GRIK4, GRIK5). GRM8,GRIN2D is the first to see the relationship between disease and disease. One side GRIK3,GRIK4,GRIK5 is connected to the other side. The EAAT2 gene (SLC1A2) is a member of the EAAT family. (2)The sib analysis was performed on the 5q33.1 domain with 43 genetic subdomains, and linkage disequilibrium was considered. The number of SNPs that are intentionally found is added to the number of SNPs that are analyzed. The number of SNPs that are intentionally found is added to the number of SNPs that are analyzed. The number of SNPs that are intentionally found is added to the number of SNPs that are analyzed. The number of SNPs that are intentionally found is added to the number of SNPs that are analyzed. (3)PCP was found in 5 parts of the brain (71 increased and 31 decreased). A 2.5-fold or higher variation in the middle of the genome was confirmed by quantitative RT-PCR of 10 genes. This is the beginning of a relationship analysis. 2. Related analysis of 27,000 items in the list 1 to 5 times in the list 1 time:1 ~ 18 times, 20 times chromosome ending. The final number of is 25,074, and the number of intentional differences is 2,951(11.8%). 2 times chromosome number:1 ~ 6, 9 ~ 18, 20 chromosome number:1 ~ 6, 9 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18, 9 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18, 9 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18, 9 chromosome number: 1 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18, 9 chromosome number: 1 ~ 18 chromosome number: 1 ~ 18 chromosome number: 1, 9 ~ 18 chromosome number 1 ~ The final number of cases was 1,868, and the number of cases was 638(34.2%).