転写と染色体領域の視点から見たゲノムDNA損傷位置情報の解析

从转录和染色体区域角度分析基因组DNA损伤位置信息

• 批准号: 18012023
• 负责人: 豊國 伸哉
• 金额: $ 6.98万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18012023/
• 关键词: 酸化ストレス; 発癌; 腎臓; 変異; マイクロアレイ; 遺伝子増幅; ptprz1; 修飾塩基; 免疫沈降; 染色体領域; CGHアレイ

新たに開発したDNA断片の免疫沈降法により、酸化ストレスによるゲノムDNA傷害部位がランダムではないことを、ラット鉄ニトリロ三酢酸誘発腎癌モデルを使用して初めて明らかにした。その片寄りを決定する要素は、当該ゲノム部位が遺伝子か否か、その発現量、核内位置(染色体領域)、反応化学種などが想定された。gpt delta transgenic mouseを使用して、酸化ストレス発がんにおける変異スペクトラムを評価した。点突然変異はG:Cを標的とするもの(特にG:C to C:G)が多いことが判明し、1kb以上の欠損を比較的高頻度に認めた。この傾向は放射線や紫外線と異なり、正常の大腸粘膜に類似していた。鉄ニトリロ三酢酸誘発腎癌においてCGH解析を行い、動物モデルとしては初めて、共通した領域で高頻度のアレル損失や、染色体領域の増幅を認めた。ほとんどアレル増減のないEkerラット腎癌や他の発癌モデルと対照を呈した。この結果は染色体レベルの異常が高頻度に見られるヒトの発がんにおいても酸化ストレスが関与していることを示唆する。ヒトの染色体座標ヘデータを変換し種々のヒト癌のデータと比較検討も試みた。更に、アレイCGHと発現マイクロアレイの データから、本発癌モデルにおいて増幅する癌遺伝子を同定した。染色体全領域の中で、ラット染色体4番短腕(ヒト染色体7番)で高頻度の遺伝子増幅を認め、その部位に存在するptprzlに着目し た。これまで、phosphataseは癌抑制遺伝子とみなされる場合が多かったが、今回は転写因子であるβカテニンが分解されないよう核への移行を促進する癌遺伝子としての新たなメカニズムを解明した。

A new method for detecting DNA fragments by immunoprecipitation was developed. The results showed that the DNA damage sites were mainly caused by triacetic acid. The factors that determine whether a chromosome is present are: whether the chromosome is present, whether the chromosome is present, whether the chromosome is present Gpt delta transgenic mouse is used to evaluate the effects of different treatments. A high frequency of point sudden change to G:C mark (especially G:C to C:G) is identified as more than 1kb in loss comparison. This tendency is similar to radiation and ultraviolet rays, and normal large intestine mucosa. Iron triacetic acid-induced renal cell carcinoma CGH analysis, animal model, common domain, high frequency of loss, chromosome domain amplification The number of cases of kidney cancer and other cases of kidney cancer is increasing. The results showed that chromosome abnormalities occurred frequently, and the frequency of chromosome abnormalities was significantly higher than that of chromosome abnormalities. The chromosome coordinates are different. In addition, the CGH and the development of cancer cells are also determined. Chromosome 4 short arms (chromosome 7 short arms) have a high frequency of gene amplification, and the presence of ptprzl in all parts of the chromosome. In this case, the expression of phosphorases in the tumor suppressor gene is more complex than that in the tumor suppressor gene.

项目成果

Chronic oxidative stress as a cause of genomic amplification.

慢性氧化应激是基因组扩增的原因。

• 发表时间: 2008
• 作者: Liu YT;Shang DH;Akatsuka S;et. al.;Akatsuka S et al.;Jiang L et al.;Lee WH et al.;Toyokuni S et al.;Toyokuni S
• 通讯作者: Toyokuni S

Overexpressin of a transcription factor LYL-1 induces T-and B-cell lymphoma in mice.

转录因子 LYL-1 的过表达会诱发小鼠 T 细胞和 B 细胞淋巴瘤。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Oncogene 26
• 作者: Zhong Y;Li J;Hiai H;Toyokuni S* and Yamada Y*
• 通讯作者: Toyokuni S* and Yamada Y*

Chronic oxidative stress causes amplification and overexpresson of ptprzl protein tyrosine phosphatase to

慢性氧化应激导致 ptprzl 蛋白酪氨酸磷酸酶扩增和过度表达

• 发表时间: 2007
• 期刊: Am J Pathol 171
• 作者: Liu YT;Shang DH;Akatsuka S;et. al.
• 通讯作者: et. al.

A novel screening method for ultraviolet protection : combination of a human skin-equivalent model and 8-hydroxy-2ュ-deoxyguanosine

一种新型的紫外线防护筛选方法：人体皮肤等效模型与8-羟基-2-脱氧鸟苷的结合

• 发表时间: 2006
• 期刊: Pathology International 56
• 作者: Liu YT;Shang DH;Akatsuka S;et. al.;Akatsuka S et al.;Jiang L et al.;Lee WH et al.;Toyokuni S et al.
• 通讯作者: Toyokuni S et al.

Association of microRNA-34a overexpression with proliferation is cell type-dependent

• DOI: 10.1111/j.1349-7006.2007.00619.x
• 发表时间: 2007-12-01
• 期刊: CANCER SCIENCE
• 影响因子: 5.7
• 作者: Dutta, Khokon Kumar;Zhong, Yi;Toyokuni, Shinya
• 通讯作者: Toyokuni, Shinya