バイオインフォマティクス解析を応用した新規ヒト生理活性ペプチドの同定

利用生物信息学分析鉴定新型人类生理活性肽

基本信息

批准号：
18018011
负责人：
七里眞義
金额：
$ 6.46万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018011/
关键词：
バイオインフォマティックス全長濃縮ヒトcDNAライブラリー分泌性蛋白新規生理活性ペプチドサリューシン-β バイオインフォマティクス In silico ペプチド探索生理活性因子ペプチドライブラリー

项目摘要

全長濃縮ヒトcDNAライブラリーのデータベースを用いてバイオインフォマティックス解析を行い、構造上分泌性蛋白をコードし小分子量ペプチドにプロセシングされると推測される遺伝子配列のヒト組織での発現を確認して、それら遺伝子由来のペプチドを化学合成して培養細胞における細胞内応答をスクリーニングすることによって新規生理活性ペプチドを同定する新手法を考案した。本研究課題においてはその探索プロセスに改良を加えながら、同定したペプチドの生理活性、物理化学的性状の解明も行うことにより、本手法を確立する努力を継続しつつ、新規生理活性ペプチドの探索を行った。その結果、本手法によって始めて同定したペプチドであるサリューシン-βがきわめて特徴的な物理化学的特徴を有するために、古典的な生理活性ペプチドの同定法や最近の主流とも言える手法であったオーファン受容体を用いた同定法で発見することは困難であったことなどの事実が明らかになりつつある。このような手法で発見した新規ペプチドが、ヒトの体液中に存在する内因性ペプチドと全く同一の分子存在様式であるかどうかなど、検討しなければならない課題もあるが、逆に、内因性ペプチドであるかどうかに関わらず、強力な生理作用と安全性が確認できればペプチド医薬・ペプチド抗体医薬への直接の応用が可能であるため、そのような観点からの新規ペプチド探索法の完成を試みている。実際、ペプチドの有用な作用による医薬品への応用に加えて、ペプチド測定により新たな診断法を提供する技術などが開発され、2件の特許出願に至った。

设计了一种新方法来通过使用全长富含人类cDNA培养基的数据库进行生物信息学分析来鉴定新型的生物活性肽，从而证实了基因序列的表达，这些基因序列的表达是结构编码的分泌蛋白，并被认为可以在人类组织中衍生物中的小分子量肽中的小分子量肽来处理这些基因依赖的基因，这些基因对这些基因的替代了这些替代物质，这些蛋白质源自这些替代物质。在这个研究主题中，我们继续努力建立这种方法，通过改善搜索过程并阐明已鉴定肽的理化特性。结果，很明显，最初使用这种方法鉴定出的肽盐素β具有极为独特的物理化学特征，因此很难使用经典方法来发现鉴定物理活性肽和孤儿受体的经典方法，这可以被视为最近几年的主流方法。需要研究一些问题，例如，通过这种方法发现的新肽是否具有与人体液中存在的内源性肽完全相同的分子模式，但另一方面，如果它是强大的生理效果和安全性，是否是内源性肽，它可以直接应用于肽药物和肽抗体，并且可以从肽药物和肽抗体中进行启用，并且可以从肽药物抗体中进行尝试，并且可以从肽药物抗体，以及我们的肽抗体，我们可以将其用于肽抗体，并且可以从肽药物抗体中进行。方法。实际上，除了通过肽的有用作用应用于药品外，还开发了通过肽测量提供新的诊断方法的技术，从而导致了两种专利申请。