权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

バイオインフォマティクス解析を応用した新規ヒト生理活性ペプチドの同定

利用生物信息学分析鉴定新型人类生理活性肽

基本信息

批准号：
17019015
负责人：
七里眞義
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019015/
关键词：
バイオインフォマティクス生理活性因子ペプチド

项目摘要

すでに獲得し解析中であったペプチドライブラリーに加えて、新たにバイオインフォマティクス解析によって選択した新規生理活性候補ペプチド配列についてペプチド合成を行った。70%程度以上の純度のペプチドが合成できたものについて、順次、当初の計画に準じて種々の生理活性を検討することによりスクリーニングを行っている。すなわち、ヒト、ラットの血管内皮細胞、血管平滑筋細胞、ラット繊維芽細胞、ヒト、マウスの単球・マクロファージ、マウスの腎由来細胞を始めとする各種培養細胞系において、種々の細胞内情報伝達系の活性化作用を指標に細胞応答を検討しているほか、c-myc、c-fosなどの各種遺伝子発現制御作用、細胞周期、血管新生、細胞増殖、細胞死に及ぼす作用を評価して、生理活性の強力な因子を選択している。こうしたスクリーニングにて得られた数多くの新規ペプチドをコードする遺伝子配列を用いて、ヒト主要臓器やビト由来培養細胞系における発現をRT-PCRにて順次確認している。構造解析を詳細に行って得られたペプチド配列のうち何らかの生理活性が認められるペプチドはヒト組織においても発現している頻度が高く、これらの流れによって一定の頻度で新規生理活性候補ペプチドが効率よく選択できていると考えている。これらのスクリーニングプロセスにて選択されたものの一部についてはin vivoでの作用を検討してきた結果、すでに摘出環流心モデルにおいて心筋収縮抑制作用を示す新規因子などが見出されている。これを含む一部についてはすでに高純度ペプチドの合成からポリクローナル抗体の作成まで完了しており、作成された抗体については順次、主にアフィニティーカラムを用いて精製している。精製終了した抗体を用いてヒト血漿抽出物の逆相クロマトグラフィーの各分画の免疫活性を解析しており、ヒト体液中にバイオインフォマティクスにより予測されたアミノ酸配列が、そのままの分子型で存在するか、あるいは修飾やさらなるプロセシングをうけているかなどの確認を進めている。

In addition, the new physiological activity candidate is selected from the list of candidates selected from the list. 70% or more purity of the selection process, the sequence, the original plan, the physiological activity of the quasi-species, the selection process Cell cycle, angiogenesis, cell proliferation, cell cycle, cell cycle Cell death and cell function evaluation, physiological activity and potent factor selection The number of new genes detected by RT-PCR was confirmed by RT-PCR in vitro, and the sequence of genes was confirmed by RT-PCR in vitro. The structure analysis shows that the frequency of occurrence of the physiological activity candidate is high, and the frequency of occurrence of the physiological activity candidate is high. A part of the selection process in vivo is discussed. The results show that the new factor can be found in the inhibition of muscle contraction in vivo. This includes a part of the synthesis of high-purity antibodies, the preparation of antibodies, the preparation of antibodies, and the purification of antibodies. The purified antibody was used to analyze the immunoactivity of each component of plasma extract in reverse phase and to predict the presence of acid alignment and molecular type in body fluids.